铜和汞对小鼠盲肠、直肠微生物多样性的影响
发布时间：2021-02-25 02:32
为了探讨铜和汞对小鼠盲肠、直肠微生物共生体系的影响,进一步分析它们菌群之间的差异性,本实验以48只昆云小白鼠为研究对象,随机分成4组:正常组（CK组）、铜组（Cu组）,汞组（Hg组）和铜汞组（CH组）,每组12只。CK组饲喂纯净水,Cu组饲喂含量为500mg/L Cu Cl2,Hg组为含量140mg/L Hg Cl2,CH组为含量500mg/L Cu Cl2和140 mg/L Hg Cl2。小鼠于实验90天后,全部剖杀取盲肠、直肠内容物并提取DNA、经过PCR扩增的16S r RNA V4区域,基于Illumina Mi Seq测序平台,利用双末端测序的方法,得到原始数据,再通过对原始数据拼接过滤得到有效数据,然后基于OTU聚类,并进行物种注释及丰度分析,揭示小鼠盲肠、直肠中微生物物种构成;进一步进行Alpha多样性分析、Beta多样性分析挖掘样品之间的差异。结果如下:1、全部样品的细菌序列总数为1788171,直肠段共获得2861个OTU,盲肠段共获得2913个OTU,根据序列注释结果显示其类群高达11个门,100个属。2、在盲肠部分,门分类水平上,与正常组的菌群进行对比,铜组变形菌...
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线图
图 2 样品总 DNA 提取结果琼脂糖凝胶电泳图注：M：DNAMarker（DL15000），1-48：肠道内容物 DNA 样品Fig 2 total DNA extraction results revealed by agarose gel electrophoresisNote：M：DNA Marker（DL15000），1-48：DNA samples of intestinal contents2.1.2 测定区域 PCR 扩增以提取的肠道微生物总 DNA 作为 PCR 反应模板，利用细菌 16S rRNA 基因引物 563F/802R 进行 PCR 扩增，如图 3 均见明显的 DNA 条带，得到的目的 DNA 片段大小为 1500bp 左右，符合高通量测序的质量要求。
图 3 PCR 扩增结果琼脂糖凝胶电泳图注：M：DNAMarker（DL15000），1-45：肠道内容物 DNA 样品Fig 3 total PCR results revealed by agarose gel electrophoresisNote：M：DNA Marker（DL15000），1-45：DNA samples of intestinal contents2.1.3 16S 测序数据统计45 个样品的细菌序列总数为 1788171，高质量序列总数 1455413，占序列总数的 81.30%。利用 R 软件对样品的高质量序列进行长度统计。结果显示：高质量序列长度绝大多数集中在 223-227bp 之间，其中长度在 224bp 和 225bp 的序列数占到了高质量序列数的 98.13%，见图 4。依据 16S rRNA 基因 V4 区域长度以及本实验所用引物设计长度，高质量片段大小符合预期。详细数据见表 4。
【参考文献】：
期刊论文
[1]脑卒中后抑郁症患者肠道菌群的多样性分析[J]. 范文涛,闫咏梅,别玉龙,王倩. 南方医科大学学报. 2016(10)
[2]动物性食品汞污染及其毒理研究进展[J]. 李生涛. 畜牧兽医杂志. 2015(03)
[3]鸡肠道微生物研究进展[J]. 王丽凤,张家超,马晨,孙志宏,付维来,张和平. 动物营养学报. 2013(03)
[4]畜禽养殖废弃物重金属铜的污染治理及循环利用[J]. 敖子强,熊继海,王顺发,吴永明,桂双林. 广东农业科学. 2011(17)
[5]高剂量铜对动物免疫功能的影响[J]. 杨帆. 贵州畜牧兽医. 2008(05)
[6]高铜对仔猪肠道微生物作用机制的研究[J]. 邹君彪,贺建华. 饲料研究. 2007(03)
[7]甲基汞对雄性小鼠的生殖发育毒性及作用机制[J]. 金明华,张晶,刘晓梅,王雯,张洁,石龙,孙志伟. 吉林大学学报(医学版). 2005(04)
[8]铜抗氧自由基作用的研究进展[J]. 王德海,程国富. 微量元素与健康研究. 2001(04)
[9]高铜对早期断奶仔猪消化酶活性、营养物质消化率和肠道微生物的影响[J]. 冷向军,王康宁. 饲料研究. 2001(04)
[10]汞的生殖毒性和发育毒性[J]. 沈文正,李权武. 动物医学进展. 2000(S1)
博士论文
[1]碱式氯化铜对异育银鲫和团头鲂生长、组织铜水平、抗氧化活性及肠道菌群的影响[D]. 邵仙萍.南京农业大学 2012
[2]高铜对断奶仔猪的促生长和微生态效应研究[D]. 梅绍锋.四川农业大学 2009
硕士论文
[1]病毒感染和高温处理对家蚕肠道菌群结构的影响[D]. 孙振丽.苏州大学 2016
[2]云南募乃露天铅锌矿区优势植物根内生细菌分子多样性研究[D]. 王义聪.云南大学 2014
本文编号：3050300
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线图
图 2 样品总 DNA 提取结果琼脂糖凝胶电泳图注：M：DNAMarker（DL15000），1-48：肠道内容物 DNA 样品Fig 2 total DNA extraction results revealed by agarose gel electrophoresisNote：M：DNA Marker（DL15000），1-48：DNA samples of intestinal contents2.1.2 测定区域 PCR 扩增以提取的肠道微生物总 DNA 作为 PCR 反应模板，利用细菌 16S rRNA 基因引物 563F/802R 进行 PCR 扩增，如图 3 均见明显的 DNA 条带，得到的目的 DNA 片段大小为 1500bp 左右，符合高通量测序的质量要求。
图 3 PCR 扩增结果琼脂糖凝胶电泳图注：M：DNAMarker（DL15000），1-45：肠道内容物 DNA 样品Fig 3 total PCR results revealed by agarose gel electrophoresisNote：M：DNA Marker（DL15000），1-45：DNA samples of intestinal contents2.1.3 16S 测序数据统计45 个样品的细菌序列总数为 1788171，高质量序列总数 1455413，占序列总数的 81.30%。利用 R 软件对样品的高质量序列进行长度统计。结果显示：高质量序列长度绝大多数集中在 223-227bp 之间，其中长度在 224bp 和 225bp 的序列数占到了高质量序列数的 98.13%，见图 4。依据 16S rRNA 基因 V4 区域长度以及本实验所用引物设计长度，高质量片段大小符合预期。详细数据见表 4。
【参考文献】：
期刊论文
[1]脑卒中后抑郁症患者肠道菌群的多样性分析[J]. 范文涛,闫咏梅,别玉龙,王倩. 南方医科大学学报. 2016(10)
[2]动物性食品汞污染及其毒理研究进展[J]. 李生涛. 畜牧兽医杂志. 2015(03)
[3]鸡肠道微生物研究进展[J]. 王丽凤,张家超,马晨,孙志宏,付维来,张和平. 动物营养学报. 2013(03)
[4]畜禽养殖废弃物重金属铜的污染治理及循环利用[J]. 敖子强,熊继海,王顺发,吴永明,桂双林. 广东农业科学. 2011(17)
[5]高剂量铜对动物免疫功能的影响[J]. 杨帆. 贵州畜牧兽医. 2008(05)
[6]高铜对仔猪肠道微生物作用机制的研究[J]. 邹君彪,贺建华. 饲料研究. 2007(03)
[7]甲基汞对雄性小鼠的生殖发育毒性及作用机制[J]. 金明华,张晶,刘晓梅,王雯,张洁,石龙,孙志伟. 吉林大学学报(医学版). 2005(04)
[8]铜抗氧自由基作用的研究进展[J]. 王德海,程国富. 微量元素与健康研究. 2001(04)
[9]高铜对早期断奶仔猪消化酶活性、营养物质消化率和肠道微生物的影响[J]. 冷向军,王康宁. 饲料研究. 2001(04)
[10]汞的生殖毒性和发育毒性[J]. 沈文正,李权武. 动物医学进展. 2000(S1)
博士论文
[1]碱式氯化铜对异育银鲫和团头鲂生长、组织铜水平、抗氧化活性及肠道菌群的影响[D]. 邵仙萍.南京农业大学 2012
[2]高铜对断奶仔猪的促生长和微生态效应研究[D]. 梅绍锋.四川农业大学 2009
硕士论文
[1]病毒感染和高温处理对家蚕肠道菌群结构的影响[D]. 孙振丽.苏州大学 2016
[2]云南募乃露天铅锌矿区优势植物根内生细菌分子多样性研究[D]. 王义聪.云南大学 2014
本文编号：3050300
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3050300.html
