番木瓜环斑病毒西瓜株系的致病机制与弱毒突变体应用

发布时间:2021-02-25 11:20
  番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)属于马铃薯Y病毒属(Potyvirus),根据寄主范围可以分为P(PRSV-P)和W(PRSV-W)两个株系。PRSV-W主要侵染西葫芦、甜瓜等葫芦科作物,可引起叶片卷曲、畸形、花叶和泡斑,植株矮化等症状,造成果实畸形或在表面形成水渍状环斑,降低了产量和品质,严重时甚至绝产。目前PRSV在中国、波兰、印度、巴西等地均有发生,是危害葫芦科作物生产的重要病毒。本研究获得并分析了PRSV山东分离物(PRSV-SD)的全基因组序列,构建了PRSV-SD全长侵染性cDNA克隆,筛选出PRSV弱毒突变体并验证了其交叉保护效果。从山东济南采集到叶片表现畸形、花叶,果实表面环斑的西葫芦样品,经检测其中含PRSV。通过RT-PCR分段扩增其全基因组片段并进行序列测定,结果表明,除了3′-端poly(A)尾以外,PRSV-SD基因组全长10337核苷酸(nt),5′-和3′-NCR分别为90 nt和206 nt,开放阅读框编码3346个氨基酸。PRSV-SD与另外18个PRSV分离物的全基因组核苷酸一致率为82.0%8

【文章来源】:山东农业大学山东省

【文章页数】:83 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

番木瓜环斑病毒西瓜株系的致病机制与弱毒突变体应用


植物RNA病毒侵染性克隆的两种方法比较(NagyováandSubr,2007)

全基因组扩增,分离物,策略,山东


京市六一仪器厂 DYY-8C 型)、凝胶成像仪(SageCreation)、手持式长波紫外灯(UVPmodelB100A)、离心机(Eppendorf5417R)、水浴锅(宁波江南仪器厂 SDC-6)、恒温摇床(Honour HNY-2102C)、超微量分光光度计(Analytikjena Scandrop)、超净工作台(苏净安泰 SW-CJ-1BU)、酶联免疫测定仪(BioRadModel550)、高压灭菌锅(Yamato SM830)、全自动化学发光仪(ChampChemi)等。2.2 实验方法2.2.1 序列测定与分析2.2.1.1 扩增策略与引物设计比对 GneBank 中多个 PRSV 分离物的核苷酸序列,选取保守区段设计引物,分4段扩增5′-端以外的基因组序列。然后根据已得到的近5′-端序列设计5′-RACE引物。扩增策略按照图 2-1 进行,相邻片段之间有 200bp 左右的重叠。

分离物,山东,构建策略,全长cDNA克隆


图 2-2 PRSV 山东分离物全长 cDNA 克隆构建策略Fig. 2-2 Strategy for constructing the full-length cDNA clone of PRS表 2-2 构建 PRSV 山东分离物全长 cDNA 克隆所用引物ble 2-2 Primers used in constructing the full-length cDNA clone of PR Nucleotide sequence (5′ to 3′)AAAAAAAATAAAACATCTCAACACAACAC CCGATTCTTAGTGCAATTCCCT TCATACAGAGAAGGGTATCCAAGAA CTCTCATTCCAAGAGGCTCGAATAG F TGCACTAAGAATCGGCCCCGGGAATTCTAAGAGG TGTTTTATTTTTTTTCTCTCCAAATGAAATGAACTTCC

【参考文献】:
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本文编号:3050892

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