感染白粉病烟株叶片真菌的群落结构与多样性
发布时间:2021-03-04 16:55
为烟草白粉病的科学防治提供理论依据,采用Illumina MiSeq高通量测序技术对采自同一烟株上发病烟叶和健康烟叶DNA的ITS区进行测序,分析各样品的真菌群落结构与多样性。结果表明:白粉病烟株健康烟叶真菌群落丰富度及多样性均高于发病烟叶;2种样本的优势菌门均为子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota);发病烟叶优势菌属及其相对丰富度为高氏白粉菌属(Golovinomyces)99.22%,曲霉属(Aspergillus)0.33%和链格孢属(Alternaria)0.33%;健康烟叶的优势菌属及其相对丰富度为高氏白粉菌属(Golovinomyces)91.86%、曲霉属(Aspergillus)0.34%和链格孢属(Alternaria)0.31%。在白粉病烟株上发病烟叶和健康烟叶均存在大量的高氏白粉菌属。
【文章来源】:贵州农业科学. 2020,48(05)
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 烟叶样品
1.1.2 试剂及测序系统
1.1.3 仪器设备
1.2 方法
1.2.1 样品DNA提取、扩增及测序
1.2.2 ITS文库构建及高通量测序
1.3 数据处理
2 结果与分析
2.1 ITS序列的测序深度与数据质控
2.2 OTU聚类
2.3 真菌群落的多样性指数
2.4 真菌群落的基本组成
3 结论与讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草白粉病的研究进展[J]. 贾桥东,张保全,王卫民,王钢,时焦. 江苏农业科学. 2019(04)
[2]两种不同白粉病抗性野生蔷薇内生真菌群落结构[J]. 白维晓,孙玮宏,肖瑞桐,朱政清,高咏涵,吴光丽,李海燕. 微生物学通报. 2019(06)
[3]杭州市西湖景区春季空气细菌多样性特征[J]. 楼秀芹,郭卫俊,姚文冲,方治国. 生态学报. 2019(08)
[4]基于高通量测序技术对山羊盲肠细菌多样性的分析[J]. 金磊,王立志,王之盛,薛白,彭全辉. 微生物学通报. 2019(06)
[5]沙尘暴对北京市空气细菌多样性特征的影响[J]. 甄泉,王雅晴,冼超凡,郭卫俊,欧阳志云. 生态学报. 2019(02)
[6]基于16S rRNA高通量测序方法比较新疆冷水鱼肠道中微生物多样性[J]. 黄丽丽,张艳,周红,倪永清. 食品科学. 2018(10)
[7]南方典型旅游城市空气微生物特征研究[J]. 方治国,黄闯,楼秀芹,李睿哲,姚文冲. 中国环境科学. 2017(08)
[8]舟山群岛不同功能区划海域细菌群落结构分析[J]. 刘强,赵本宣,李汝伟,吴冬梅,徐大鹏,程传东,赵淑江. 微生物学报. 2018(02)
[9]黄瓜白粉病菌拮抗真菌鉴定及生防效果评价[J]. 卢幸蓉,陈大为,张树武,刘佳,徐秉良. 中国生物防治学报. 2017(03)
[10]基于高通量测序的两种植被恢复类型根际土壤细菌多样性研究[J]. 戴雅婷,闫志坚,解继红,吴洪新,徐林波,侯向阳,高丽,崔艳伟. 土壤学报. 2017(03)
硕士论文
[1]基于高通量测序的功能微生物分析及其在对虾白斑综合症病毒载体疫苗构建中的应用[D]. 徐在超.广东药科大学 2018
[2]健康和感染黄龙病砂糖桔细菌多样性分析[D]. 肖婉钰.仲恺农业工程学院 2017
[3]通过形态和分子生物手段鉴定一种烟草白粉菌用以研究拟南芥侵入后抗性[D]. 张凌荔.四川农业大学 2015
[4]烟草内生真菌种群多样性及烟草赤星病生防内生菌的筛选[D]. 裴洲洋.河南农业大学 2009
[5]小麦叶片中潜伏侵染白粉菌的Nested PCR检测[D]. 曾晓葳.中国农业科学院 2007
本文编号:3063566
【文章来源】:贵州农业科学. 2020,48(05)
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 烟叶样品
1.1.2 试剂及测序系统
1.1.3 仪器设备
1.2 方法
1.2.1 样品DNA提取、扩增及测序
1.2.2 ITS文库构建及高通量测序
1.3 数据处理
2 结果与分析
2.1 ITS序列的测序深度与数据质控
2.2 OTU聚类
2.3 真菌群落的多样性指数
2.4 真菌群落的基本组成
3 结论与讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草白粉病的研究进展[J]. 贾桥东,张保全,王卫民,王钢,时焦. 江苏农业科学. 2019(04)
[2]两种不同白粉病抗性野生蔷薇内生真菌群落结构[J]. 白维晓,孙玮宏,肖瑞桐,朱政清,高咏涵,吴光丽,李海燕. 微生物学通报. 2019(06)
[3]杭州市西湖景区春季空气细菌多样性特征[J]. 楼秀芹,郭卫俊,姚文冲,方治国. 生态学报. 2019(08)
[4]基于高通量测序技术对山羊盲肠细菌多样性的分析[J]. 金磊,王立志,王之盛,薛白,彭全辉. 微生物学通报. 2019(06)
[5]沙尘暴对北京市空气细菌多样性特征的影响[J]. 甄泉,王雅晴,冼超凡,郭卫俊,欧阳志云. 生态学报. 2019(02)
[6]基于16S rRNA高通量测序方法比较新疆冷水鱼肠道中微生物多样性[J]. 黄丽丽,张艳,周红,倪永清. 食品科学. 2018(10)
[7]南方典型旅游城市空气微生物特征研究[J]. 方治国,黄闯,楼秀芹,李睿哲,姚文冲. 中国环境科学. 2017(08)
[8]舟山群岛不同功能区划海域细菌群落结构分析[J]. 刘强,赵本宣,李汝伟,吴冬梅,徐大鹏,程传东,赵淑江. 微生物学报. 2018(02)
[9]黄瓜白粉病菌拮抗真菌鉴定及生防效果评价[J]. 卢幸蓉,陈大为,张树武,刘佳,徐秉良. 中国生物防治学报. 2017(03)
[10]基于高通量测序的两种植被恢复类型根际土壤细菌多样性研究[J]. 戴雅婷,闫志坚,解继红,吴洪新,徐林波,侯向阳,高丽,崔艳伟. 土壤学报. 2017(03)
硕士论文
[1]基于高通量测序的功能微生物分析及其在对虾白斑综合症病毒载体疫苗构建中的应用[D]. 徐在超.广东药科大学 2018
[2]健康和感染黄龙病砂糖桔细菌多样性分析[D]. 肖婉钰.仲恺农业工程学院 2017
[3]通过形态和分子生物手段鉴定一种烟草白粉菌用以研究拟南芥侵入后抗性[D]. 张凌荔.四川农业大学 2015
[4]烟草内生真菌种群多样性及烟草赤星病生防内生菌的筛选[D]. 裴洲洋.河南农业大学 2009
[5]小麦叶片中潜伏侵染白粉菌的Nested PCR检测[D]. 曾晓葳.中国农业科学院 2007
本文编号:3063566
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3063566.html