一种线性双链RNA病毒的鉴定及其分子生物学特性研究
发布时间:2021-03-04 23:08
山茶刺盘孢菌(Colletotrichum camelliae Massee)可寄生茶树引起茶云纹叶枯病(Tea Brown Blight)。该病是危害茶树叶的最常见病害,在世界各茶区分布广泛,造成叶枯、芽坏死以及枯萎等症状,从而导致茶叶的产量和质量的严重下降。本研究从茶叶片上分离得到茶云纹叶枯病菌株LT-3-1,相比正常的茶云纹叶枯病菌株DP-3-1,菌株LT-3-1的菌落形态较异常,生长速度较缓慢,致病力也较弱。通过提取LT-3-1和DP-3-1菌株菌丝的dsRNA,发现LT-3-1中存在8条dsRNA片段,大小分别为2444、2253、2012、1299、1122、1085、1053和990bp,共编码了10个开放阅读框(Open Reading Frame Finder,ORF)。其中dsRNA1、-2、-3、-4、-6、-7都编码一个独立的开放阅读框,依次命名为ORF1、ORF2、ORF3、ORF4、ORF6、ORF7,而dsRNA5和-8分别编码ORF5-1、ORF5-2和ORF8-1、ORF8-2。其中ORF1编码依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RN...
【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:94 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
菌株DP-3-1和LT-3-1ApMat基因片段的PCR扩增产物电泳分析
112 山茶刺盘孢菌 DP-3-1 和 LT-3-1 的菌落形态(I)、菌丝生长速度(III)和病力分析(II 和 IV).2 Colony morphology(I),growth rate (III) and pathogenicity (II and Istrains DP-3-1 and LT-3-1
的提取及酶处理验证 LT-3-1 和 DP-3-1 的核酸之后,用 DNase I 、 S1 核酸酶后发现,只有菌株 LT-3-1中有 8条 dsRNA条带,大小在 名为 dsRNA1-dsRNA8(图 3.1)。 全长 cDNA 序列的克隆与分析胶电泳切胶分离纯化回收各 dsRNA 条带后,经随机克隆到各条带的全长 cDNA 序列,dsRNA1-dsRNA8 的大小分1299、1122、1085、1053 和 990 bp,在 GenBank 中相应66-KX778773。其中 dsRNA1- dsRNA4,以及 dsRNA6,d且为 ORF1-ORF4、ORF6、ORF7,而 dsRNA5 编码 ORF码 ORF8-1、ORF8-2(图 3.2)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]5-氟尿嘧啶多克隆抗体的制备和鉴定[J]. 高宇驰,贾岩,王鑫,卢远彬,代友超,余诗炎,张俊爱,徐军发. 细胞与分子免疫学杂志. 2016(03)
[2]茶云纹叶枯病的发生规律及防治[J]. 韩必新. 农业灾害研究. 2015(06)
[3]茶云纹叶枯病的发生与药剂防治试验[J]. 李正英,姚永松. 茶叶科学技术. 2011(02)
[4]茶树云纹叶枯病病原鉴定及其生物学特性研究[J]. 王志坤,谭万忠,张克诚,唐继洪,殷利利. 河南农业科学. 2008(04)
[5]柑橘衰退病毒多克隆和单克隆抗体的制备及检测效果分析[J]. 王彩霞,王国平,洪霓,姜波,刘辉,吴康为. 生物工程学报. 2006(04)
[6]甜菜坏死黄脉病毒外壳蛋白基因的表达及其表达产物抗血清的制备[J]. 姚华建,于嘉林,金元,刘仪. 病毒学报. 1994(01)
硕士论文
[1]禾谷镰刀菌AMT1基因的功能研究[D]. 王光辉.西北农林科技大学 2010
[2]苹果茎痘病毒的鉴定及其外壳蛋白基因的原核表达[D]. 杨绍丽.华中农业大学 2008
本文编号:3064099
【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:94 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
菌株DP-3-1和LT-3-1ApMat基因片段的PCR扩增产物电泳分析
112 山茶刺盘孢菌 DP-3-1 和 LT-3-1 的菌落形态(I)、菌丝生长速度(III)和病力分析(II 和 IV).2 Colony morphology(I),growth rate (III) and pathogenicity (II and Istrains DP-3-1 and LT-3-1
的提取及酶处理验证 LT-3-1 和 DP-3-1 的核酸之后,用 DNase I 、 S1 核酸酶后发现,只有菌株 LT-3-1中有 8条 dsRNA条带,大小在 名为 dsRNA1-dsRNA8(图 3.1)。 全长 cDNA 序列的克隆与分析胶电泳切胶分离纯化回收各 dsRNA 条带后,经随机克隆到各条带的全长 cDNA 序列,dsRNA1-dsRNA8 的大小分1299、1122、1085、1053 和 990 bp,在 GenBank 中相应66-KX778773。其中 dsRNA1- dsRNA4,以及 dsRNA6,d且为 ORF1-ORF4、ORF6、ORF7,而 dsRNA5 编码 ORF码 ORF8-1、ORF8-2(图 3.2)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]5-氟尿嘧啶多克隆抗体的制备和鉴定[J]. 高宇驰,贾岩,王鑫,卢远彬,代友超,余诗炎,张俊爱,徐军发. 细胞与分子免疫学杂志. 2016(03)
[2]茶云纹叶枯病的发生规律及防治[J]. 韩必新. 农业灾害研究. 2015(06)
[3]茶云纹叶枯病的发生与药剂防治试验[J]. 李正英,姚永松. 茶叶科学技术. 2011(02)
[4]茶树云纹叶枯病病原鉴定及其生物学特性研究[J]. 王志坤,谭万忠,张克诚,唐继洪,殷利利. 河南农业科学. 2008(04)
[5]柑橘衰退病毒多克隆和单克隆抗体的制备及检测效果分析[J]. 王彩霞,王国平,洪霓,姜波,刘辉,吴康为. 生物工程学报. 2006(04)
[6]甜菜坏死黄脉病毒外壳蛋白基因的表达及其表达产物抗血清的制备[J]. 姚华建,于嘉林,金元,刘仪. 病毒学报. 1994(01)
硕士论文
[1]禾谷镰刀菌AMT1基因的功能研究[D]. 王光辉.西北农林科技大学 2010
[2]苹果茎痘病毒的鉴定及其外壳蛋白基因的原核表达[D]. 杨绍丽.华中农业大学 2008
本文编号:3064099
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