烟草青枯病抗性的连锁与连锁不平衡联合作图
发布时间：2021-03-08 20:07
烟草青枯病是影响烟草产质量的主要病害之一,该病的发生常造成重大的经济损失。选育优良抗病品种是减少青枯病发生的最佳措施,而运用与抗病相关的分子标记辅助抗病材料的筛选能加速品种选育的进程。因此,了解青枯病抗病遗传特性,探测和发掘与青枯病抗性密切相关的优异等位基因,辅助烟草抗病材料的筛选,对提高烟草抗青枯病的能力至关重要。现阶段,青枯病抗病遗传分析主要采用连锁分析或关联分析;然而,烟草青枯病抗性属于数量性状遗传,单纯利用连锁分析或关联分析对其进行研究,探测到的信息有限。因此,本研究利用一个包含133份F7单粒传重组自交系（Recombinant inbred lines,RILs）群体和一个包含94份种质的自然群体分别进行连锁分析和关联分析,并利用共同的分子标记开展联合作图,探讨烟草青枯病的抗病遗传。主要研究结果如下:1、应用R语言对RIL群体和自然群体多年多点的青枯病病情指数进行主效可加互作可乘（Additive main effects and multiplicative interaction,AMMI）模型分析,获悉基因型和环境对供试烟草表型的作用力。结果发现...
【文章来源】：广州大学广东省
【文章页数】：131 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
重组自交系群体（A）和自然群体（B）中各株系（种质）间的烟草青枯病病情指数比较
草遗传连锁图谱的构建 546 个标记对重组自交系群体的基因分型数据，利用 JoinMap3.0张包含 463 个标记位点，25 个连锁群的分子遗传连锁图谱（图 3盖烟草的 24 条染色体。其中，第 14 染色体上的连锁群因标记遗传现断点，分别记为 LG14A 和 LG14B；25 个连锁群覆盖基因组总长M，连锁群上的标记个数在 4~82 之间，相邻标记的平均距离为 2.6基因组距离最长为 95.32 cM；LG14B 覆盖基因组距离最短仅为记数量最多达到 82 个，标记平均间距仅有 0.14 cM，密度最大；而记的平均距离最大为 9.36 cM，仅包含 4 个标记位点，密度最小，上相邻标记的平均间距均小于 10 cM，有利于后续的 QTL 定位（P各条连锁群的图距、标记数和长度等基本特征，详见表 3-1。
40图 3-2（续 1） 基于“粤烟 98”ד118-3”构建的烟草遗传连锁图谱Figure 3-2 （Continued 1） Tobacco genetic linkage map deriving from “yueyan98”“118-3”
【参考文献】：
期刊论文
[1]烟草种质的SSR标记遗传多样性及青枯病抗性的关联分析[J]. 赖瑞强,李荣华,夏岩石,郭培国,袁清华,赵伟才. 中国烟草学报. 2018(06)
[2]基于RAD-seq数据开发烟草多态性SSR标记[J]. 李海洋,李荣华,夏岩石,袁清华,张振臣,赵伟才,郭培国. 中国烟草科学. 2018(01)
[3]烟草品种大叶密合抗青枯病相关QTL的检测[J]. 袁清华,马柱文,张振臣,李集勤,李淑玲,郭培国,邱妙文,李荣华,赵伟才,陈俊标. 中国烟草学报. 2018(03)
[4]231份烤烟种质资源SSR标记遗传多样性及其与农艺性状和化学成分的关联分析[J]. 童治军,陈学军,方敦煌,曾建敏,吴兴富,肖炳光. 中国烟草学报. 2017(05)
[5]温度、湿度、接菌量及pH对烟草青枯病菌致病力的影响[J]. 汪汉成,余婧,蔡刘体,陆宁. 中国烟草科学. 2017(05)
[6]基因型与环境及其互作效应对胡麻主要农艺性状的影响[J]. 党照,张建平,赵利,王利民. 西北农业学报. 2017(09)
[7]基于R语言的AMMI和GGE双标图在花生区试中的应用[J]. 郭敏杰,邓丽,任丽,谷建中. 花生学报. 2017(02)
[8]抗茎腐病分子标记在159份玉米自交系中的验证及实用性评价[J]. 王金萍,刘永伟,孙果忠,王海波. 植物遗传资源学报. 2017(04)
[9]中间锦鸡儿干旱转录组SSR标记的开发及遗传多样性研究[J]. 郑如玉,刘坤,杨杞,杨飞芸,杨天瑞,宝力德,王瑞刚. 分子植物育种. 2017(06)
[10]以关联分析发掘烟草抗赤星病基因分子标记[J]. 朱承广,任民,蒋彩虹,张雨生,孙明铭,刘旦,程立锐,杨爱国,王元英. 中国烟草科学. 2017(01)
博士论文
[1]利用连锁与连锁不平衡联合作图解析毛白杨重要性状的等位遗传变异[D]. 杜庆章.北京林业大学 2014
[2]烟草青枯病抗性遗传分析及QTL定位研究[D]. 钱益亮.安徽农业大学 2013
[3]烟草微卫星标记的开发与应用[D]. 童治军.浙江大学 2012
[4]不同类型玉米种质分子特征分析及耐旱相关性状的连锁—连锁不平衡联合作图[D]. 卢艳丽.四川农业大学 2010
[5]粳稻穗部性状遗传分析和QTL定位及关联作图[D]. 郭媛.南京农业大学 2009
[6]水稻关联定位群体的构建及若干品质性状的关联分析[D]. 金亮.浙江大学 2009
[7]桉树青枯菌菌株致病力分化、吸附识别及PCR快速检测研究[D]. 王胜坤.中国林业科学研究院 2007
硕士论文
[1]烟草青枯病抗性的动态QTL定位[D]. 李海洋.广州大学 2018
[2]烟草遗传图谱的构建及青枯病抗性与一些农艺性状的QTL定位[D]. 刘文杰.广州大学 2017
[3]烟草遗传图谱构建与农艺性状和化学成分的QTL定位[D]. 李茜.西南大学 2015
[4]Beinhart1000-1抗烟草赤星病和黑胫病基因的QTL定位[D]. 高亭亭.中国农业科学院 2014
[5]烤烟农艺性状和化学品质指标的遗传模型分析及遗传图谱初步构建[D]. 卢晓延.西南大学 2014
[6]烤烟耐烤性遗传分析及QTL定位研究[D]. 郝贤伟.中国农业科学院 2013
[7]烟草种质青枯病抗性鉴定与分子标记筛选[D]. 范江.湖南农业大学 2012
[8]利用烟草野生种间F2群体构建SSR分子标记遗传连锁图谱[D]. 李绪英.云南农业大学 2012
[9]烟草SSR连锁图谱构建及青枯病抗性QTL定位[D]. 杨柳.福建农林大学 2012
[10]白肋烟遗传连锁图谱的构建及烟碱含量QTL的定位[D]. 柴利广.华中农业大学 2008
本文编号：3071599
【文章来源】：广州大学广东省
【文章页数】：131 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
重组自交系群体（A）和自然群体（B）中各株系（种质）间的烟草青枯病病情指数比较
草遗传连锁图谱的构建 546 个标记对重组自交系群体的基因分型数据，利用 JoinMap3.0张包含 463 个标记位点，25 个连锁群的分子遗传连锁图谱（图 3盖烟草的 24 条染色体。其中，第 14 染色体上的连锁群因标记遗传现断点，分别记为 LG14A 和 LG14B；25 个连锁群覆盖基因组总长M，连锁群上的标记个数在 4~82 之间，相邻标记的平均距离为 2.6基因组距离最长为 95.32 cM；LG14B 覆盖基因组距离最短仅为记数量最多达到 82 个，标记平均间距仅有 0.14 cM，密度最大；而记的平均距离最大为 9.36 cM，仅包含 4 个标记位点，密度最小，上相邻标记的平均间距均小于 10 cM，有利于后续的 QTL 定位（P各条连锁群的图距、标记数和长度等基本特征，详见表 3-1。
40图 3-2（续 1） 基于“粤烟 98”ד118-3”构建的烟草遗传连锁图谱Figure 3-2 （Continued 1） Tobacco genetic linkage map deriving from “yueyan98”“118-3”
【参考文献】：
期刊论文
[1]烟草种质的SSR标记遗传多样性及青枯病抗性的关联分析[J]. 赖瑞强,李荣华,夏岩石,郭培国,袁清华,赵伟才. 中国烟草学报. 2018(06)
[2]基于RAD-seq数据开发烟草多态性SSR标记[J]. 李海洋,李荣华,夏岩石,袁清华,张振臣,赵伟才,郭培国. 中国烟草科学. 2018(01)
[3]烟草品种大叶密合抗青枯病相关QTL的检测[J]. 袁清华,马柱文,张振臣,李集勤,李淑玲,郭培国,邱妙文,李荣华,赵伟才,陈俊标. 中国烟草学报. 2018(03)
[4]231份烤烟种质资源SSR标记遗传多样性及其与农艺性状和化学成分的关联分析[J]. 童治军,陈学军,方敦煌,曾建敏,吴兴富,肖炳光. 中国烟草学报. 2017(05)
[5]温度、湿度、接菌量及pH对烟草青枯病菌致病力的影响[J]. 汪汉成,余婧,蔡刘体,陆宁. 中国烟草科学. 2017(05)
[6]基因型与环境及其互作效应对胡麻主要农艺性状的影响[J]. 党照,张建平,赵利,王利民. 西北农业学报. 2017(09)
[7]基于R语言的AMMI和GGE双标图在花生区试中的应用[J]. 郭敏杰,邓丽,任丽,谷建中. 花生学报. 2017(02)
[8]抗茎腐病分子标记在159份玉米自交系中的验证及实用性评价[J]. 王金萍,刘永伟,孙果忠,王海波. 植物遗传资源学报. 2017(04)
[9]中间锦鸡儿干旱转录组SSR标记的开发及遗传多样性研究[J]. 郑如玉,刘坤,杨杞,杨飞芸,杨天瑞,宝力德,王瑞刚. 分子植物育种. 2017(06)
[10]以关联分析发掘烟草抗赤星病基因分子标记[J]. 朱承广,任民,蒋彩虹,张雨生,孙明铭,刘旦,程立锐,杨爱国,王元英. 中国烟草科学. 2017(01)
博士论文
[1]利用连锁与连锁不平衡联合作图解析毛白杨重要性状的等位遗传变异[D]. 杜庆章.北京林业大学 2014
[2]烟草青枯病抗性遗传分析及QTL定位研究[D]. 钱益亮.安徽农业大学 2013
[3]烟草微卫星标记的开发与应用[D]. 童治军.浙江大学 2012
[4]不同类型玉米种质分子特征分析及耐旱相关性状的连锁—连锁不平衡联合作图[D]. 卢艳丽.四川农业大学 2010
[5]粳稻穗部性状遗传分析和QTL定位及关联作图[D]. 郭媛.南京农业大学 2009
[6]水稻关联定位群体的构建及若干品质性状的关联分析[D]. 金亮.浙江大学 2009
[7]桉树青枯菌菌株致病力分化、吸附识别及PCR快速检测研究[D]. 王胜坤.中国林业科学研究院 2007
硕士论文
[1]烟草青枯病抗性的动态QTL定位[D]. 李海洋.广州大学 2018
[2]烟草遗传图谱的构建及青枯病抗性与一些农艺性状的QTL定位[D]. 刘文杰.广州大学 2017
[3]烟草遗传图谱构建与农艺性状和化学成分的QTL定位[D]. 李茜.西南大学 2015
[4]Beinhart1000-1抗烟草赤星病和黑胫病基因的QTL定位[D]. 高亭亭.中国农业科学院 2014
[5]烤烟农艺性状和化学品质指标的遗传模型分析及遗传图谱初步构建[D]. 卢晓延.西南大学 2014
[6]烤烟耐烤性遗传分析及QTL定位研究[D]. 郝贤伟.中国农业科学院 2013
[7]烟草种质青枯病抗性鉴定与分子标记筛选[D]. 范江.湖南农业大学 2012
[8]利用烟草野生种间F2群体构建SSR分子标记遗传连锁图谱[D]. 李绪英.云南农业大学 2012
[9]烟草SSR连锁图谱构建及青枯病抗性QTL定位[D]. 杨柳.福建农林大学 2012
[10]白肋烟遗传连锁图谱的构建及烟碱含量QTL的定位[D]. 柴利广.华中农业大学 2008
本文编号：3071599
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3071599.html
