内蒙古呼和浩特地区苹果坏死花叶病毒的检测与遗传多样性研究
发布时间:2021-03-10 10:53
采用RT-PCR方法对从内蒙古呼和浩特地区采集的29份表现花叶症状的海红果(Malus micromalus Makino)叶片样品进行了苹果坏死花叶病毒(ApNMV)的检测,ApNMV的检出率为100%,说明ApNMV在呼和浩特地区表现花叶症状的海红果上普遍发生。分别克隆并测序了29份海红果样品中ApNMV的全长外壳蛋白(CP)基因,结果表明,29个ApNMV分离物CP基因间核苷酸序列一致性为94.1%~99.8%,与NCBI数据库中其他19个ApNMV分离物全长CP基因核苷酸一致性为86.1%~97.1%。利用ApNMV CP基因的全长序列构建了系统发育树,48个ApNMV分离物共分成5个组,本研究中的29个ApNMV分离物与2个日本分离物LC108995和NC040470聚集在一起,形成组Ⅰ;其余ApNMV分离物分别形成了组Ⅱ~组Ⅴ。
【文章来源】:中国果树. 2020,(03)北大核心
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
48个ApNMV分离物的系统发育进化树
本文编号:3074543
【文章来源】:中国果树. 2020,(03)北大核心
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48个ApNMV分离物的系统发育进化树
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