灰飞虱及扶桑绵粉蚧lncRNA预测及其差异表达分析
发布时间:2021-03-11 06:51
长链非编码 RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于 200 nt的非编码RNA,具有重要的调控作用。近年来,从转录组数据中发现lncRNA的计算流程日趋成熟,越来越多的1ncRNA被发现和鉴定。本研究采用前期建立的生物信息学分析流程,根据1ncRNA特点,分别以灰飞虱(Laoddelphax striatellusFallen)及扶桑绵粉蚧(Phenacoccus solenopsis Tinsley)基因组为参考,预测得到灰飞虱和扶桑绵粉蚧的lncRNA基因;分析了两种昆虫的lncRNA基因的特点,比较了其在不同组织中的表达情况;利用实时荧光定量PCR对灰飞虱带毒和不带毒样本进行了差异表达验证。主要研究结果如下:1.LncRNA的挖掘以及在灰飞虱带毒组织中的表达分析实验共采用38个灰飞虱转录组,其中包括实验室之前测定并报道的4个灰飞虱转录组和从NCBISRA数据库下载的34个灰飞虱转录组,包括感染与未感染水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)的不同灰飞虱组织、感染与未感染沃尔巴克氏体的灰飞虱、不同温度处理的样本。据lncRNA...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
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【参考文献】:
期刊论文
[1]水稻灰飞虱的研究进展[J]. 孙志广,王宝祥,陈庭木,徐波,邢运高,代慧敏,徐大勇. 北方农业学报. 2018(05)
[2]水稻条纹叶枯病毒对灰飞虱生物学特性及若干生理生化特性的影响[J]. 贺康,郭金梦,李飞,林克剑,王桂荣. 应用昆虫学报. 2018 (01)
[3]扶桑绵粉蚧转录组分析[J]. 胡俊杰,孟翔,周佳滨,杨陆兴,刘善海,李润钊. 昆虫学报. 2017(01)
[4]昆虫长链非编码RNA的研究进展[J]. 肖花美,李美珍,李飞. 应用昆虫学报. 2017 (01)
[5]长链非编码RNA(lncRNA)及其在昆虫学研究中的进展[J]. 朱斌,梁沛,高希武. 昆虫学报. 2016(11)
[6]扶桑绵粉蚧研究状况的文献计量分析[J]. 翟欣. 环境昆虫学报. 2015(03)
[7]应用免疫荧光技术研究水稻条纹病毒(RSV)侵染介体灰飞虱卵巢的过程[J]. 吴维,毛倩卓,陈红燕,陈倩,刘启飞,李凡,魏太云. 农业生物技术学报. 2012(12)
[8]中国水稻条纹叶枯病研究进展[J]. 周益军,李硕,程兆榜,周彤,范永坚. 江苏农业学报. 2012(05)
[9]扶桑绵粉蚧部分行为学的初步研究[J]. 魏婷,刘慧,欧高财,肖铁光,黄玲,陈常铭. 作物研究. 2010(04)
[10]实时荧光定量PCR的发展和数据分析[J]. 纪冬,辛绍杰. 生物技术通讯. 2009(04)
博士论文
[1]五种昆虫非编码RNA基因发现及miR-14的功能研究[D]. 肖花美.南京农业大学 2015
硕士论文
[1]扶桑绵粉蚧脂质合成相关基因的特性和功能研究[D]. 李晓龙.浙江农林大学 2016
本文编号:3076050
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.1灰飞虱IneRNA特征分析??Figure?2.1?The?characters?of?IncRNAs?in?SBPH??(A)每个IneRNA、蛋白编码基因的转录本对应的外显子数量;(B)lncRNA、??
'z?Z'、Z??图2.2未感染和感染病毒灰飞虱组织的IncKNA表达聚类分析??Figure?2.2.?Cluster?analysis?of?IncRNA?expression?in?viruliferous?and?non-??viruliferous?
?300??Position?along?reads??图3.2样品RRA89062测序错误率分布图??Figure?3.2?Sample?RRA89062?sequencing?error?rate?distribution??25??
【参考文献】:
期刊论文
[1]水稻灰飞虱的研究进展[J]. 孙志广,王宝祥,陈庭木,徐波,邢运高,代慧敏,徐大勇. 北方农业学报. 2018(05)
[2]水稻条纹叶枯病毒对灰飞虱生物学特性及若干生理生化特性的影响[J]. 贺康,郭金梦,李飞,林克剑,王桂荣. 应用昆虫学报. 2018 (01)
[3]扶桑绵粉蚧转录组分析[J]. 胡俊杰,孟翔,周佳滨,杨陆兴,刘善海,李润钊. 昆虫学报. 2017(01)
[4]昆虫长链非编码RNA的研究进展[J]. 肖花美,李美珍,李飞. 应用昆虫学报. 2017 (01)
[5]长链非编码RNA(lncRNA)及其在昆虫学研究中的进展[J]. 朱斌,梁沛,高希武. 昆虫学报. 2016(11)
[6]扶桑绵粉蚧研究状况的文献计量分析[J]. 翟欣. 环境昆虫学报. 2015(03)
[7]应用免疫荧光技术研究水稻条纹病毒(RSV)侵染介体灰飞虱卵巢的过程[J]. 吴维,毛倩卓,陈红燕,陈倩,刘启飞,李凡,魏太云. 农业生物技术学报. 2012(12)
[8]中国水稻条纹叶枯病研究进展[J]. 周益军,李硕,程兆榜,周彤,范永坚. 江苏农业学报. 2012(05)
[9]扶桑绵粉蚧部分行为学的初步研究[J]. 魏婷,刘慧,欧高财,肖铁光,黄玲,陈常铭. 作物研究. 2010(04)
[10]实时荧光定量PCR的发展和数据分析[J]. 纪冬,辛绍杰. 生物技术通讯. 2009(04)
博士论文
[1]五种昆虫非编码RNA基因发现及miR-14的功能研究[D]. 肖花美.南京农业大学 2015
硕士论文
[1]扶桑绵粉蚧脂质合成相关基因的特性和功能研究[D]. 李晓龙.浙江农林大学 2016
本文编号:3076050
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/dzwbhlw/3076050.html