西瓜和甜瓜响应西瓜噬酸菌不同亚群菌株侵染的转录组分析
发布时间：2021-03-13 17:38
瓜类细菌性果斑病（Bacterial fruit blotch,BFB）是由西瓜噬酸菌（Acidovorax citrulli）引起的世界检疫性种传细菌病害,主要为害西瓜、甜瓜等葫芦科作物。该病害自1998年在我国首次报道以来,在我国大面积发生并呈上升趋势,给西瓜、甜瓜生产造成了严重的经济损失。菌株间丰富的遗传多样性将A.citrulli分为两个亚群,亚群I（代表菌株pslb65）主要分离自甜瓜,对西瓜和甜瓜寄主致病力相似;亚群II（代表菌株AAC00-1,NC008752）主要分离自西瓜,对西瓜幼苗致病力强于亚群I菌株,而对甜瓜致病力弱于亚群I菌株。本论文利用转录组测序（RNA-seq）技术,研究了西瓜和甜瓜接种A.citrulli后的差异基因表达谱,并通过分析植物-病原互作、苯丙烷生物合成和光合-天线蛋白3种抗病相关代谢通路及其防卫相关基因表达情况,揭示了西瓜噬酸菌不同菌株对寄主致病力的差异,为了解寄主对不同亚群菌株侵染的应答机制提供数据支持。研究结果如下:1、以西瓜感病品种“华欣182”和甜瓜感病品种“IVF667”为材料,以清水处理0 h时间点为对照,对接...
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：91 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
瓜类果斑斑病菌在KB培培养基上的菌菌落形态
西瓜瓜、甜瓜分别别接种pslb65和AAC00-13d后发病状状况
2Thetransc2转录组测序criptomesequ序流程
【参考文献】：
期刊论文
[1]印度南瓜转录组SSR信息分析及其多态性研究[J]. 王洋洋,单文琪,徐文龙,崔崇士,屈淑平. 园艺学报. 2016(03)
[2]棉花黄萎病菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用[J]. 沈元劼,齐谢敏,刘标,周国华,李泰明. 生态学杂志. 2015(07)
[3]基于Illumina HiSeq 2000测序技术对当归根的转录组特性研究[J]. 杨杰,王金权,丁维俊,李炜弘,刘宏伟. 中草药. 2015(08)
[4]铜胁迫下小麦幼根转录组学及蛋白质组学研究[J]. 张黛静,王多多,董文,马建辉,杨淑芳,张志娟,李春喜. 河南农业科学. 2015(04)
[5]利用RNA-Seq鉴定甘蓝型油菜叶片干旱胁迫应答基因[J]. 卢坤,张琳,曲存民,梁颖,唐章林,李加纳. 中国农业科学. 2015(04)
[6]小麦根腐病菌索氏平脐蠕孢SYBR Green I实时荧光定量PCR检测技术研究[J]. 陈清清,孙炳剑,袁虹霞,施艳,李洪连. 菌物学报. 2014(03)
[7]盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析[J]. 陈嘉贝,张芙蓉,黄丹枫,张利达,张屹东. 植物生理学报. 2014(02)
[8]基于转录组denovo拼接鉴定辣椒（Capsicum frutescens）中辣椒素生物合成相关基因[J]. Liu Shaoqun,Li Wanshun,Wu Yimin,Chen Changming,Lei Jianjun,高凌云,孔秋生. 辣椒杂志. 2014(01)
[9]利用实时荧光PCR方法检测香蕉软腐细菌[J]. 豆亚亚,阮小蕾,袁月,刘琼光,李华平. 园艺学报. 2013(02)
[10]实时荧光定量PCR筛选稻曲病菌内参基因[J]. 顾志敏,丁正中,陈析丰,郭龙彪,曾大力,钱前,马伯军. 中国水稻科学. 2012(05)
博士论文
[1]哈密瓜响应青霉菌侵染的转录组和蛋白组研究及相关抗性酶变化分析[D]. 单春会.江南大学 2015
[2]低温胁迫下两种桉树的生理响应特征及转录表达差异研究[D]. 刘奕清.中国农业大学 2015
[3]对比根系转录组研究棉花盐胁迫应答及耐受机理[D]. 师恭曜.中国农业大学 2015
[4]甘蔗应答黑穗病菌侵染的转录组与蛋白组研究及抗性相关基因挖掘[D]. 苏亚春.福建农林大学 2014
[5]超级稻协优9308根系杂种优势的转录组分析[D]. 翟荣荣.中国农业科学院 2013
[6]福建桉树焦枯病菌鉴定及其诱导下桉树转录组和蛋白组学研究[D]. 陈全助.福建农林大学 2013
硕士论文
[1]黄瓜灰霉病PMA-qPCR方法及互作转录组学研究[D]. 孔维文.北京林业大学 2016
[2]低温胁迫下西葫芦转录组分析与SSR分子标记开发[D]. 张宏亮.山西农业大学 2015
[3]基于RNA-seq技术对西瓜果皮色泽差异表达基因的分析[D]. 杨侃侃.江西农业大学 2015
[4]白粉菌诱导华东葡萄‘白河-35-1’转录组分析[D]. 翁凯.西北农林科技大学 2015
[5]谷子与锈菌互作的转录组和表达谱研究及相关基因表达分析[D]. 王楠.河北师范大学 2015
[6]紫花苜蓿耐盐生理特性及转录组分析[D]. 江超.山东农业大学 2014
[7]谷子NBS类抗病基因的生物信息学分析及在锈菌胁迫中的表达[D]. 朱彦彬.河北农业大学 2013
[8]西瓜枯萎病的防治与抗病相关基因的表达分析[D]. 翟婧.浙江大学 2013
[9]茶儿茶素生物合成相关基因表达的实时荧光定量PCR分析[D]. 孙美莲.安徽农业大学 2010
本文编号：3080640
【文章来源】：吉林农业大学吉林省
【文章页数】：91 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
瓜类果斑斑病菌在KB培培养基上的菌菌落形态
西瓜瓜、甜瓜分别别接种pslb65和AAC00-13d后发病状状况
2Thetransc2转录组测序criptomesequ序流程
【参考文献】：
期刊论文
[1]印度南瓜转录组SSR信息分析及其多态性研究[J]. 王洋洋,单文琪,徐文龙,崔崇士,屈淑平. 园艺学报. 2016(03)
[2]棉花黄萎病菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用[J]. 沈元劼,齐谢敏,刘标,周国华,李泰明. 生态学杂志. 2015(07)
[3]基于Illumina HiSeq 2000测序技术对当归根的转录组特性研究[J]. 杨杰,王金权,丁维俊,李炜弘,刘宏伟. 中草药. 2015(08)
[4]铜胁迫下小麦幼根转录组学及蛋白质组学研究[J]. 张黛静,王多多,董文,马建辉,杨淑芳,张志娟,李春喜. 河南农业科学. 2015(04)
[5]利用RNA-Seq鉴定甘蓝型油菜叶片干旱胁迫应答基因[J]. 卢坤,张琳,曲存民,梁颖,唐章林,李加纳. 中国农业科学. 2015(04)
[6]小麦根腐病菌索氏平脐蠕孢SYBR Green I实时荧光定量PCR检测技术研究[J]. 陈清清,孙炳剑,袁虹霞,施艳,李洪连. 菌物学报. 2014(03)
[7]盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析[J]. 陈嘉贝,张芙蓉,黄丹枫,张利达,张屹东. 植物生理学报. 2014(02)
[8]基于转录组denovo拼接鉴定辣椒（Capsicum frutescens）中辣椒素生物合成相关基因[J]. Liu Shaoqun,Li Wanshun,Wu Yimin,Chen Changming,Lei Jianjun,高凌云,孔秋生. 辣椒杂志. 2014(01)
[9]利用实时荧光PCR方法检测香蕉软腐细菌[J]. 豆亚亚,阮小蕾,袁月,刘琼光,李华平. 园艺学报. 2013(02)
[10]实时荧光定量PCR筛选稻曲病菌内参基因[J]. 顾志敏,丁正中,陈析丰,郭龙彪,曾大力,钱前,马伯军. 中国水稻科学. 2012(05)
博士论文
[1]哈密瓜响应青霉菌侵染的转录组和蛋白组研究及相关抗性酶变化分析[D]. 单春会.江南大学 2015
[2]低温胁迫下两种桉树的生理响应特征及转录表达差异研究[D]. 刘奕清.中国农业大学 2015
[3]对比根系转录组研究棉花盐胁迫应答及耐受机理[D]. 师恭曜.中国农业大学 2015
[4]甘蔗应答黑穗病菌侵染的转录组与蛋白组研究及抗性相关基因挖掘[D]. 苏亚春.福建农林大学 2014
[5]超级稻协优9308根系杂种优势的转录组分析[D]. 翟荣荣.中国农业科学院 2013
[6]福建桉树焦枯病菌鉴定及其诱导下桉树转录组和蛋白组学研究[D]. 陈全助.福建农林大学 2013
硕士论文
[1]黄瓜灰霉病PMA-qPCR方法及互作转录组学研究[D]. 孔维文.北京林业大学 2016
[2]低温胁迫下西葫芦转录组分析与SSR分子标记开发[D]. 张宏亮.山西农业大学 2015
[3]基于RNA-seq技术对西瓜果皮色泽差异表达基因的分析[D]. 杨侃侃.江西农业大学 2015
[4]白粉菌诱导华东葡萄‘白河-35-1’转录组分析[D]. 翁凯.西北农林科技大学 2015
[5]谷子与锈菌互作的转录组和表达谱研究及相关基因表达分析[D]. 王楠.河北师范大学 2015
[6]紫花苜蓿耐盐生理特性及转录组分析[D]. 江超.山东农业大学 2014
[7]谷子NBS类抗病基因的生物信息学分析及在锈菌胁迫中的表达[D]. 朱彦彬.河北农业大学 2013
[8]西瓜枯萎病的防治与抗病相关基因的表达分析[D]. 翟婧.浙江大学 2013
[9]茶儿茶素生物合成相关基因表达的实时荧光定量PCR分析[D]. 孙美莲.安徽农业大学 2010
本文编号：3080640
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