基于TMT技术筛选汞胁迫下水稻根尖组织差异蛋白及生物信息学分析
发布时间：2021-03-18 11:01
目的:食用稻米是中国典型汞矿区人群汞暴露的最主要途径之一,为了从蛋白质水平上揭示水稻（Oryza sativa L.）适应重金属汞胁迫的分子机制,探讨汞胁迫引起的生理生化响应和总汞分布特征,模拟汞矿区污染稻田环境,达到发现胁迫根尖后吸收汞元素相关显著差异蛋白的目的,以期为调控水稻吸收汞的分子生物学机制研究提供线索,从而降低人群汞暴露风险。方法:本研究采用盆栽试验方法,以拔节期水稻（金优431）为材料,氯化汞胁迫浓度设置0 mg·kg-1和50 mg·kg-1、150 mg·kg-1、300 mg·kg-1。胁迫30d测定生理生化指标,烘干测总汞含量,之后采用同位素相对标记与绝对定量（Tandem Mass Tag,TMT）技术,筛选水稻根尖部位响应重金属汞胁迫的显著差异表达蛋白（Fisher’s exact test,p<0.05）,对所有差异蛋白进行生物信息学分析;并应用定量蛋白质组学平行反应监测（parallel reaction monitoring,PRM）技术,鉴定验证汞胁迫响应显著...
【文章来源】：贵州医科大学贵州省
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图0-1：iTRAQ/TMT蛋白质表达差异谱多通道定量分析
线：吸取新配制的100ng/mL总汞标准溶液0mL、0.05mL、0.1mL、0.2mL、0.3mL、0.5mL、0.6mL，分别置于8mL还原瓶中，按样品方法进行测定，以总汞含量（ng）为横坐标，实验信号强度为纵坐标，绘制标准曲线（图1-1），得到标准方程为y=0.2174x+0.3152，相关系数R2=0.9996图 1-1 总汞标准工作曲线Fig. 1-1 Standard curve of THg1.2.2.4 标准物质测定样品测定时要进行标准物质的测定如表 1-1，生物样品标准物质为柑橘叶（GBW 10020）。选择与待分析测定的样品类型相同或者相似的标准物质，用于验证植物和土壤样品前处理方法及分析方法的可靠性。
图 1-2 水稻组织细分Fig. 1-2 Detailed parts of rice tissues表 1-8 水稻植株各部位中总汞分布统计(μg·kg-1)1-8 Statistics of Total Mercury Distribution in Different Parts of Rice Pla根尖 根 主茎 茎 叶 118.005 366.105 253.952 6.3334 16.986 57.483 308.916 185.216 6.222 10.629 V 144.246 224.371 181.501 1.275 18.314 373.450 747.378 454.322 9.087 49.958 9.957 127.353 63.872 4.739 3.870
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于稳定同位素标记和平行反应监测的蛋白质组学定量技术用于肝癌生物标志物的筛选和验证[J]. 王素兰,高华萍,张菁,叶翔. 色谱. 2017(09)
[2]贵州某典型汞矿区流域水稻中总汞和甲基汞含量及暴露风险[J]. 李瑞阳,徐晓航,许志东,敖明,商立海,仇广乐,汤顺林. 环境科学研究. 2016(12)
[3]重金属单一与复合污染下水稻对铬的富集特征[J]. 梁延鹏,李宗林,张学洪,刘杰,黄海涛,曾鸿鹄. 生态环境学报. 2016(09)
[4]大气汞浓度升高对水稻叶片生理效应的影响研究[J]. 陈剑,王章玮,张晓山,秦普丰,陆海军. 生态毒理学报. 2016(01)
[5]镉胁迫下锌对水稻植物螯合肽合成的影响[J]. 于莎莎,卞英芳,杨欢,孙伟华,曹赵云. 浙江农业科学. 2015(11)
[6]植物重金属胁迫耐受机制[J]. 李洋,于丽杰,金晓霞. 中国生物工程杂志. 2015(09)
[7]基于iTraq技术的加拿大一枝黄花提取物作用下铜绿微囊藻细胞差异表达蛋白[J]. 黄莹莹,白羽,王艳,孔海南. 中国环境科学. 2015(06)
[8]重金属污染土壤中Cd、Cr、Pb元素向水稻的迁移累积研究[J]. 陈慧茹,董亚玲,王琦,刘斌美,吴跃进,王钰. 中国农学通报. 2015(12)
[9]水稻根系响应镉胁迫的蛋白质差异表达[J]. 肖清铁,王经源,郑新宇,戎红,张国君,王良华,谢惠玲,李艺,陈珊,林瑞余,林文雄. 生态学报. 2015(24)
[10]2014年中国稻米产业研究[J]. 刘笑然,兰敦臣,李越. 中国粮食经济. 2014(12)
博士论文
[1]柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞的转录组学及蛋白质组学分析[D]. 王秀臻.山东农业大学 2018
[2]基于TMT技术的关于弥漫性特发性骨肥厚症的血清蛋白质组学研究[D]. 韩岳.天津医科大学 2016
[3]水稻重金属积累的品种与环境效应及调控技术研究[D]. 曹方彬.浙江大学 2014
[4]水稻应答铝毒害的根蛋白质组学研究及OsTCTP功能分析[D]. 王占旗.浙江大学 2014
[5]mTRAQ/MRM定量技术在AKR家族分析中的应用[D]. 章申燕.中国科学院北京基因组研究所 2013
[6]耐铜和敏铜水稻（Oryza sativa L.）品种根响应铜胁迫的蛋白质组学比较研究[D]. 宋玉峰.南京农业大学 2011
[7]水稻铬毒害和耐性的生理与分子机理研究[D]. 曾凡荣.浙江大学 2010
[8]汞胁迫下水稻根蛋白质组学及抗性相关基因功能分析[D]. 王飞娟.浙江大学 2010
[9]水稻耐镉的基因型差异及外源GSH缓解镉毒的机理研究[D]. 蔡悦.浙江大学 2010
硕士论文
[1]我国水稻主产区大米总汞分布特征的初步分析[D]. 赵慧芳.贵州师范大学 2017
[2]耐砷与砷敏感野生稻鉴定及其砷耐性差异的蛋白质组学研究[D]. 王娟.浙江农林大学 2014
[3]稻田生态系统中总汞和甲基汞的分布研究[D]. 黄中伟.河南理工大学 2012
[4]金属汞对视觉系统危害的毒理学研究[D]. 苏雯.中南大学 2012
[5]水稻抗镉胁迫响应的差异蛋白组学研究[D]. 戎红.福建农林大学 2009
[6]重金属胁迫对水稻伤害机理及水稻耐性机制的研究[D]. 杨小勇.扬州大学 2002
本文编号：3088210
【文章来源】：贵州医科大学贵州省
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图0-1：iTRAQ/TMT蛋白质表达差异谱多通道定量分析
线：吸取新配制的100ng/mL总汞标准溶液0mL、0.05mL、0.1mL、0.2mL、0.3mL、0.5mL、0.6mL，分别置于8mL还原瓶中，按样品方法进行测定，以总汞含量（ng）为横坐标，实验信号强度为纵坐标，绘制标准曲线（图1-1），得到标准方程为y=0.2174x+0.3152，相关系数R2=0.9996图 1-1 总汞标准工作曲线Fig. 1-1 Standard curve of THg1.2.2.4 标准物质测定样品测定时要进行标准物质的测定如表 1-1，生物样品标准物质为柑橘叶（GBW 10020）。选择与待分析测定的样品类型相同或者相似的标准物质，用于验证植物和土壤样品前处理方法及分析方法的可靠性。
图 1-2 水稻组织细分Fig. 1-2 Detailed parts of rice tissues表 1-8 水稻植株各部位中总汞分布统计(μg·kg-1)1-8 Statistics of Total Mercury Distribution in Different Parts of Rice Pla根尖 根 主茎 茎 叶 118.005 366.105 253.952 6.3334 16.986 57.483 308.916 185.216 6.222 10.629 V 144.246 224.371 181.501 1.275 18.314 373.450 747.378 454.322 9.087 49.958 9.957 127.353 63.872 4.739 3.870
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于稳定同位素标记和平行反应监测的蛋白质组学定量技术用于肝癌生物标志物的筛选和验证[J]. 王素兰,高华萍,张菁,叶翔. 色谱. 2017(09)
[2]贵州某典型汞矿区流域水稻中总汞和甲基汞含量及暴露风险[J]. 李瑞阳,徐晓航,许志东,敖明,商立海,仇广乐,汤顺林. 环境科学研究. 2016(12)
[3]重金属单一与复合污染下水稻对铬的富集特征[J]. 梁延鹏,李宗林,张学洪,刘杰,黄海涛,曾鸿鹄. 生态环境学报. 2016(09)
[4]大气汞浓度升高对水稻叶片生理效应的影响研究[J]. 陈剑,王章玮,张晓山,秦普丰,陆海军. 生态毒理学报. 2016(01)
[5]镉胁迫下锌对水稻植物螯合肽合成的影响[J]. 于莎莎,卞英芳,杨欢,孙伟华,曹赵云. 浙江农业科学. 2015(11)
[6]植物重金属胁迫耐受机制[J]. 李洋,于丽杰,金晓霞. 中国生物工程杂志. 2015(09)
[7]基于iTraq技术的加拿大一枝黄花提取物作用下铜绿微囊藻细胞差异表达蛋白[J]. 黄莹莹,白羽,王艳,孔海南. 中国环境科学. 2015(06)
[8]重金属污染土壤中Cd、Cr、Pb元素向水稻的迁移累积研究[J]. 陈慧茹,董亚玲,王琦,刘斌美,吴跃进,王钰. 中国农学通报. 2015(12)
[9]水稻根系响应镉胁迫的蛋白质差异表达[J]. 肖清铁,王经源,郑新宇,戎红,张国君,王良华,谢惠玲,李艺,陈珊,林瑞余,林文雄. 生态学报. 2015(24)
[10]2014年中国稻米产业研究[J]. 刘笑然,兰敦臣,李越. 中国粮食经济. 2014(12)
博士论文
[1]柔嫩艾美耳球虫入侵DF1细胞的转录组学及蛋白质组学分析[D]. 王秀臻.山东农业大学 2018
[2]基于TMT技术的关于弥漫性特发性骨肥厚症的血清蛋白质组学研究[D]. 韩岳.天津医科大学 2016
[3]水稻重金属积累的品种与环境效应及调控技术研究[D]. 曹方彬.浙江大学 2014
[4]水稻应答铝毒害的根蛋白质组学研究及OsTCTP功能分析[D]. 王占旗.浙江大学 2014
[5]mTRAQ/MRM定量技术在AKR家族分析中的应用[D]. 章申燕.中国科学院北京基因组研究所 2013
[6]耐铜和敏铜水稻（Oryza sativa L.）品种根响应铜胁迫的蛋白质组学比较研究[D]. 宋玉峰.南京农业大学 2011
[7]水稻铬毒害和耐性的生理与分子机理研究[D]. 曾凡荣.浙江大学 2010
[8]汞胁迫下水稻根蛋白质组学及抗性相关基因功能分析[D]. 王飞娟.浙江大学 2010
[9]水稻耐镉的基因型差异及外源GSH缓解镉毒的机理研究[D]. 蔡悦.浙江大学 2010
硕士论文
[1]我国水稻主产区大米总汞分布特征的初步分析[D]. 赵慧芳.贵州师范大学 2017
[2]耐砷与砷敏感野生稻鉴定及其砷耐性差异的蛋白质组学研究[D]. 王娟.浙江农林大学 2014
[3]稻田生态系统中总汞和甲基汞的分布研究[D]. 黄中伟.河南理工大学 2012
[4]金属汞对视觉系统危害的毒理学研究[D]. 苏雯.中南大学 2012
[5]水稻抗镉胁迫响应的差异蛋白组学研究[D]. 戎红.福建农林大学 2009
[6]重金属胁迫对水稻伤害机理及水稻耐性机制的研究[D]. 杨小勇.扬州大学 2002
本文编号：3088210
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