A-to-I RNA编辑调控禾谷镰刀菌FgRID1基因的功能研究

发布时间：2021-03-20 10:44

　　小麦赤霉病是一种世界范围内广泛流行的农作物病害,不仅会造成小麦产量的降低,更为重要的是,感病的小麦会大量积累真菌毒素,且在后续加工过程中,很难被去除,因此造成严重的食品安全问题。禾谷镰刀菌是小麦赤霉病的主要致病菌,其有性子囊孢子作为重要的初侵染源,在小麦赤霉病的发生过程中起到了至关重要的作用。对禾谷镰刀菌的有性发育开展研究,有助于揭示小麦赤霉病病害循环的特点,为有效防控提供理论参考。在研究A-to-I的RNA编辑对PUK1-like基因的影响时发现预测为RID1同源基因的FGRRES₀8648也发生编辑,Rid1编码一个DNA甲基转移酶,是目前已知的唯一一个直接介导重复片段诱导点突变（RIP,Repeat-induced point mutation）的蛋白,而RIP机制是一种特异发生于丝状真菌有性阶段的遗传机制,可以限制重复DNA片段在基因组中的积累,有效维护基因组稳定性,对丝状真菌的生长发育至关重要。我们在禾谷镰刀菌中鉴定了RID1的同源基因FgRID1（FGRRES₀8648）。对RNA-seq数据进行分析,发现FgRID1预测的内含子... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

粗糙脉孢菌有性生殖发生过程

图 1-2.禾谷镰刀菌有性生殖过程(Hallen et al., 2007)Fig.1-2. Sexual development of Fusarium graminearum in carrot agar cultures: 0, 24,144 h20μm; 48, 72, 96 h Bar =10μm(Hallen et al., 2007)1.3 A to I RNA 编辑特定发生于禾谷镰刀菌的有性生殖阶段2016 年 Liu 等人在禾谷镰刀菌有性生殖阶段首次发现并通过 RNA 测序数据实 FgPUK1 基因(Perithecium unique kinase 1，FGRRES_01058)的激酶结构域中两

1 ml 0.5M EDTA（pH 8.0）补水至 500 ml, 灭菌 20 min，室温保存。16、100mg/ml 氨苄青霉素2g 氨苄青霉素14ml 无水乙醇6ml DDW溶解完全后分装到 2ml 的离心管中，于-20℃保存。2.1.1.3 仪器超净实验工作台、Bio-RAD PCR 仪、Eppendorf 移液器、凝胶成像系统、电泳设备、床、离心管、涡旋仪、低温冰箱、水浴锅、高压灭菌锅、恒温培养箱等。2.1.2 试验方法2.1.2.1 引物设计及片段扩增在禾谷镰刀菌基因组数据库下载 FgRID1(FGRRES_08648)基因序列及基因上下2000bp 序列。用 Premier Primer 5 设计引物，各引物的位置如图，其中 2R、3F 的端加上潮霉素磷酸转移酶基因(hph)同源序列。

【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦赤霉病发生特点及防治措施[J]. 刘庆宝.  现代农业. 2015(10)
[2]麦类赤霉病研究进展[J]. 喻大昭.  植物保护. 2009(03)
[3]小麦赤霉病菌源种类和禾谷镰刀菌的特性及变异研究综述[J]. 何家泌.  国外农学.植物保护. 1992(04)



本文编号：3090870