菜豆普通花叶病毒(BCMV)花生条纹株系复制和翻译调控的初步研究
发布时间:2021-03-23 14:56
菜豆普通花叶病毒(Bean common mosaic virus,BCMV)为马铃薯Y病毒科(Pot yviridae)、马铃薯Y病毒属(Potyvirus)成员,病毒粒体呈线状,含有1条正义单链RNA,5’端没有帽子结构但带有病毒基因组结合蛋白VPg,3’端有poly(A)尾;基因组全长约10 kb,包含一个大的开放阅读框,编码一个多聚蛋白,此多聚蛋白经蛋白酶切割产生10个成熟的功能蛋白,其中Nib蛋白具有依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)活性,负责基因组正负链间的复制。通过RACE技术,克隆来自山东不同地区花生样品中的BCMV 5’UTR及3’UTR序列;发现BCMV的5’UTR及3’UTR序列比较保守,但3’UTR的poly(A)存在长度差异。通过构建萤火虫荧光素酶(Fluc)的融合载体,分析了BCMV 5’UTR和3’UTR对不依赖帽子翻译的调控作用。(1)BCMV的5’UTR对翻译有明显的正调控作用,表明其具备IRES活性;突变分析显示其调控翻译的核心区域位于5’末端的第一个大茎环。(2)3’UTR对5’UTR的翻译正调控起抑制作用,可能原因是3’UTR和5’UTR间存...
【文章来源】:山东农业大学山东省
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
BCMV的基因组结构
德镇(JN)四个地区采集的花生发病部位的植物总 RNA(图2),利用 RT-PCR检测 BCMV,所用引物为 PS-9619-F和 Q0(附表 1)。RT-PCR产物的电泳结果显示,花生条纹病疑似症状的花生总 RNA中可以检测到对应的 BCMV片段,PCR产物长度约为 500 bp(图 3),与目的扩增片段的大小相符(图 3)并经过测序确认。图 2不同地区花生病样的总 RNAHMW:泰安化马湾;QJD:泰安邱家店;JN:济南万德镇;QD:青岛莱西Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locationsHMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao.图 3 BCMV的 RT-PCR 检测HMW:泰安化马湾;QJD:泰安邱家店;JN:济南万德镇;QD:青岛莱西Fig.3 Detection of BCMV by RT-PCRM:DL5000 DNA Marker;HMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao
0,花生条纹病疑似症状的花生总 RNA中可以检测约为 500 bp(图 3),与目的扩增片段的大小相符图 2不同地区花生病样的总 RNAW:泰安化马湾;QJD:泰安邱家店;JN:济南万德镇;QD:青岛Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locations:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi QHMW QJD JN QD
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草番茄斑萎病毒病防治措施[J]. 李四光,何孝兵,杨亚,丁伟. 植物医生. 2015(06)
[2]2014年云南番茄、辣椒上番茄斑萎病毒属病毒与传毒蓟马的发生特点[J]. 郑雪,陈永对,吴阔,张丽珍,苏晓霞,郑宽瑜,张洁,董家红. 南方农业学报. 2015(03)
[3]番茄斑萎病毒属病毒非结构蛋白NSs的生物信息学分析[J]. 郑宽瑜,董家红,苏晓霞,方琦,郑雪,张仲凯. 西南农业学报. 2014(02)
[4]6种杀虫剂对烟田番茄斑萎病毒属病毒传毒蓟马的药效试验[J]. 张洁,陈永对,吴阔,刘春明,肖俊华,郑雪,董家红,李宏光. 江苏农业科学. 2014(04)
[5]植物中依赖RNA的RNA聚合酶6(RDR6)研究进展[J]. 吴冰月,陈华涛,许晓明,崔瑾,陈新. 华北农学报. 2013(S1)
[6]昆明番茄斑萎病毒不同分离物N基因遗传多样性分析[J]. 尹跃艳,董家红,徐兴阳,端永明,张仲凯. 西南农业学报. 2013(01)
[7]北京地区发现番茄斑萎病毒[J]. 李飞,吴青君,徐宝云,谢文,王少丽,张友军. 植物保护. 2012(06)
[8]番茄斑萎病毒TSWV的鉴定及抗病种质的筛选[J]. 邱树亮,王孝宣,杜永臣,高建昌,国艳梅,朱德蔚,胡鸿,李宝聚,石延霞. 园艺学报. 2012(06)
[9]西花蓟马传播番茄斑萎病毒研究进展[J]. 杨帆,刘万学,张国安,万方浩. 环境昆虫学报. 2011(02)
[10]寄主植物接种番茄斑萎病毒对西花蓟马种群的影响[J]. 朱秀娟,张治军,吕要斌. 昆虫学报. 2011(04)
硕士论文
[1]西花蓟马在不同寄主植物上对番茄斑萎病毒传播效率的研究[D]. 张玉秀.南京农业大学 2013
[2]花生条纹病毒分子变异分析和马铃薯Y病毒蛋白的表达纯化[D]. 侯珊珊.山东农业大学 2011
本文编号:3095992
【文章来源】:山东农业大学山东省
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
BCMV的基因组结构
德镇(JN)四个地区采集的花生发病部位的植物总 RNA(图2),利用 RT-PCR检测 BCMV,所用引物为 PS-9619-F和 Q0(附表 1)。RT-PCR产物的电泳结果显示,花生条纹病疑似症状的花生总 RNA中可以检测到对应的 BCMV片段,PCR产物长度约为 500 bp(图 3),与目的扩增片段的大小相符(图 3)并经过测序确认。图 2不同地区花生病样的总 RNAHMW:泰安化马湾;QJD:泰安邱家店;JN:济南万德镇;QD:青岛莱西Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locationsHMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao.图 3 BCMV的 RT-PCR 检测HMW:泰安化马湾;QJD:泰安邱家店;JN:济南万德镇;QD:青岛莱西Fig.3 Detection of BCMV by RT-PCRM:DL5000 DNA Marker;HMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao
0,花生条纹病疑似症状的花生总 RNA中可以检测约为 500 bp(图 3),与目的扩增片段的大小相符图 2不同地区花生病样的总 RNAW:泰安化马湾;QJD:泰安邱家店;JN:济南万德镇;QD:青岛Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locations:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi QHMW QJD JN QD
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草番茄斑萎病毒病防治措施[J]. 李四光,何孝兵,杨亚,丁伟. 植物医生. 2015(06)
[2]2014年云南番茄、辣椒上番茄斑萎病毒属病毒与传毒蓟马的发生特点[J]. 郑雪,陈永对,吴阔,张丽珍,苏晓霞,郑宽瑜,张洁,董家红. 南方农业学报. 2015(03)
[3]番茄斑萎病毒属病毒非结构蛋白NSs的生物信息学分析[J]. 郑宽瑜,董家红,苏晓霞,方琦,郑雪,张仲凯. 西南农业学报. 2014(02)
[4]6种杀虫剂对烟田番茄斑萎病毒属病毒传毒蓟马的药效试验[J]. 张洁,陈永对,吴阔,刘春明,肖俊华,郑雪,董家红,李宏光. 江苏农业科学. 2014(04)
[5]植物中依赖RNA的RNA聚合酶6(RDR6)研究进展[J]. 吴冰月,陈华涛,许晓明,崔瑾,陈新. 华北农学报. 2013(S1)
[6]昆明番茄斑萎病毒不同分离物N基因遗传多样性分析[J]. 尹跃艳,董家红,徐兴阳,端永明,张仲凯. 西南农业学报. 2013(01)
[7]北京地区发现番茄斑萎病毒[J]. 李飞,吴青君,徐宝云,谢文,王少丽,张友军. 植物保护. 2012(06)
[8]番茄斑萎病毒TSWV的鉴定及抗病种质的筛选[J]. 邱树亮,王孝宣,杜永臣,高建昌,国艳梅,朱德蔚,胡鸿,李宝聚,石延霞. 园艺学报. 2012(06)
[9]西花蓟马传播番茄斑萎病毒研究进展[J]. 杨帆,刘万学,张国安,万方浩. 环境昆虫学报. 2011(02)
[10]寄主植物接种番茄斑萎病毒对西花蓟马种群的影响[J]. 朱秀娟,张治军,吕要斌. 昆虫学报. 2011(04)
硕士论文
[1]西花蓟马在不同寄主植物上对番茄斑萎病毒传播效率的研究[D]. 张玉秀.南京农业大学 2013
[2]花生条纹病毒分子变异分析和马铃薯Y病毒蛋白的表达纯化[D]. 侯珊珊.山东农业大学 2011
本文编号:3095992
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