梨小食心虫幼虫中肠消化酶和解毒酶相关基因挖掘
发布时间：2021-03-25 21:42
梨小食心虫Grapholitha molesta（Busck）是一种能危害多种蔷薇科果树嫩梢和果实的世界性害虫。它具有典型的季节性转移寄主危害的特点,使得梨小食心虫常猖獗成灾。梨小食心虫的防治过度依赖于化学农药,使得杀伤天敌、污染环境、农药残留和抗性产生等问题日益严重,寻求高效无公害的生物防治方法显得尤为重要。中肠作为昆虫消化和解毒代谢的主要组织器官,在昆虫取食和消化不同寄主植物、生长发育及防御外源有毒物质的过程中起着重要作用,探究以中肠消化酶和解毒酶为靶标的生物农药具有重要意义。本研究通过高通量测序技术,对梨小食心虫幼虫中肠进行转录组测序分析,挖掘高表达的消化酶和解毒酶相关基因,分析了其在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠中的表达情况,为以后以中肠消化酶和解毒酶为靶标的害虫生物防治奠定一定的理论基础。取得的具体研究结果如下:（1）通过二代测序平台对梨小食心虫中肠的转录组进行高通量测序,共获得unigenes 96 419条,比对公共数据库,57 300条unigenes被成功注释。GO分类中,分为三大类生物学进程、细胞组分和分子功能的55个功能区,其中unigenes比例较大的是细胞进程、细...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 梨小食心虫的研究进展
1.1.1 梨小食心虫的危害与发生规律
1.1.2 梨小食心虫生长与环境的关系
1.1.3 梨小食心虫的饲养与防治研究
1.2 昆虫中肠消化酶和解毒酶研究进展
1.2.1 昆虫中肠消化酶的研究
1.2.2 昆虫中肠解毒酶的研究
1.3 转录组测序及其在昆虫学研究中的应用
1.3.1 转录组测序的发展与优势
1.3.2 转录组测序的原理
1.3.3 转录组测序在昆虫中的应用
1.4 研究目的与意义
1.5 研究内容及技术路线
第二章 实验材料和方法
2.1 实验材料
2.1.1 供试昆虫
2.1.2 主要仪器
2.1.3 主要试剂
2.2 实验方法
2.2.1 梨小食心虫幼虫中肠转录组测序及SSR分子标记分析
2.2.2 梨小食心虫中肠高表达基因分析
2.2.3 梨小食心虫中肠消化酶、解毒酶相关基因的表达量检测
第三章 结果与分析
3.1 梨小食心虫幼虫中肠RNA-Seq及转录组de novo组装
3.2 梨小食心虫幼虫中肠Unigenes注释
3.3 梨小食心虫幼虫中肠转录组数据分析
3.3.1 同源性分析
3.3.2 Unigenes的KOG分析
3.3.3 Unigenes的GO分类
3.3.4 Unigenes的KEGG分类
3.4 梨小食心虫幼虫中肠SSR分子标记挖掘
3.5 梨小食心虫幼虫中肠转录组高表达分析
3.5.1 高表达基因的GO分类
3.5.2 高表达基因的KEGG通路分析
3.6 梨小食心虫幼虫中肠高表达基因筛选
3.6.1 消化酶高表达基因的筛选
3.6.2 解毒酶高表达基因的筛选
3.7 消化酶、解毒酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
3.7.1 梨小食心虫中肠RNA的提取
3.7.2 消化酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
3.7.3 解毒酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
第四章 结论
第五章 讨论
5.1 梨小食心虫幼虫中肠转录组及SSR分子标记分析
5.2 梨小食心虫中肠高表达基因分析
5.3 消化酶、解毒酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
参考文献
致谢
个人简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]米象GST基因的表达及其对磷化氢的应答[J]. 叶侃,胡飞,魏兆军. 安徽农业科学. 2019(08)
[2]甜菜夜蛾细胞色素P450基因的克隆与分析[J]. 袁远,高熹,张连根,倪峰,高俨,吴毅歆,喜超,朱家位. 西南农业学报. 2019(02)
[3]二化螟两种P450基因CYP4M38和CYP4M39的时空表达分析[J]. 白琪,鲁艳辉,郑许松,吕仲贤. 浙江农业学报. 2018(04)
[4]梨小食心虫谷胱甘肽S-转移酶GmolGST6的基因克隆、原核表达和酶学特征[J]. 李帅,苏丽,李伯辽,李怡萍,李广伟,仵均祥. 昆虫学报. 2018(04)
[5]绿豆象触角转录组及嗅觉相关基因的分析[J]. 郑海霞,张耀文,张仙红,杨美红. 昆虫学报. 2018(02)
[6]两种农药不同亚致死浓度对梨小食心虫生长发育和繁殖的影响[J]. 庾琴,封云涛,杜恩强,郭晓君,郭贵明,张润祥. 植物保护. 2018(01)
[7]中华蜜蜂幼虫肠道的高表达基因分析[J]. 解彦玲,王鸿权,张璐,侯志贤,刀晨,江亮亮,熊翠玲,郑燕珍,徐细建,黄枳腱,郭睿,陈大福. 浙江农业学报. 2017(09)
[8]中华按蚊八个羧肽酶基因的鉴定及其与吸血餐相关的表达分析（英文）[J]. 史宗畔,支中婧,罗世惠,陈斌,何正波. 昆虫学报. 2017(06)
[9]应用转录组测序高通量发掘东方粘虫SSR标记[J]. 李微,张蕾,程云霞,罗礼智,江幸福. 植物保护学报. 2017(03)
[10]中华蜜蜂幼虫肠道参考转录组的de novo组装及SSR分子标记鉴定[J]. 徐细建,郭睿,骆群,熊翠玲,梁勤,张串联,郑燕珍,张曌楠,黄枳腱,张璐,李汶东,陈大福. 中国农业科学. 2017(06)
博士论文
[1]白假丝酵母菌侵染家蝇幼虫中肠转录组及围食膜蛋白质组学研究[D]. 王宇.贵州医科大学 2016
[2]桔小实蝇消化和解毒代谢相关基因鉴定及其对药剂胁迫的应激反应[D]. 申光茂.西南大学 2013
硕士论文
[1]粘虫细胞色素P450的克隆和特性分析[D]. 刘月庆.东北农业大学 2017
[2]梨小食心虫幼虫中肠胰蛋白酶活性、表达量及与生长发育的关系研究[D]. 赵爱平.西北农林科技大学 2017
[3]基于二代测序的转录组数据分析方法的比较研究[D]. 石浩然.四川农业大学 2016
[4]稻纵卷叶螟转录组及几丁质代谢途径和抗药性基因鉴定[D]. 余海中.安徽农业大学 2015
[5]两种入侵型烟粉虱隐种中肠转录组分析[D]. 叶晓冬.浙江大学 2014
[6]小菜蛾中肠丝氨酸蛋白酶基因的克隆、转录及其酶活的研究[D]. 祝妮.浙江大学 2013
[7]寄主因子对梨小食心虫的发生、生长发育及其产卵选择性的影响[D]. 杨小凡.河北农业大学 2013
[8]陕西古代果树史研究[D]. 刘得腾.西北农林科技大学 2010
本文编号：3100373
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 梨小食心虫的研究进展
1.1.1 梨小食心虫的危害与发生规律
1.1.2 梨小食心虫生长与环境的关系
1.1.3 梨小食心虫的饲养与防治研究
1.2 昆虫中肠消化酶和解毒酶研究进展
1.2.1 昆虫中肠消化酶的研究
1.2.2 昆虫中肠解毒酶的研究
1.3 转录组测序及其在昆虫学研究中的应用
1.3.1 转录组测序的发展与优势
1.3.2 转录组测序的原理
1.3.3 转录组测序在昆虫中的应用
1.4 研究目的与意义
1.5 研究内容及技术路线
第二章 实验材料和方法
2.1 实验材料
2.1.1 供试昆虫
2.1.2 主要仪器
2.1.3 主要试剂
2.2 实验方法
2.2.1 梨小食心虫幼虫中肠转录组测序及SSR分子标记分析
2.2.2 梨小食心虫中肠高表达基因分析
2.2.3 梨小食心虫中肠消化酶、解毒酶相关基因的表达量检测
第三章 结果与分析
3.1 梨小食心虫幼虫中肠RNA-Seq及转录组de novo组装
3.2 梨小食心虫幼虫中肠Unigenes注释
3.3 梨小食心虫幼虫中肠转录组数据分析
3.3.1 同源性分析
3.3.2 Unigenes的KOG分析
3.3.3 Unigenes的GO分类
3.3.4 Unigenes的KEGG分类
3.4 梨小食心虫幼虫中肠SSR分子标记挖掘
3.5 梨小食心虫幼虫中肠转录组高表达分析
3.5.1 高表达基因的GO分类
3.5.2 高表达基因的KEGG通路分析
3.6 梨小食心虫幼虫中肠高表达基因筛选
3.6.1 消化酶高表达基因的筛选
3.6.2 解毒酶高表达基因的筛选
3.7 消化酶、解毒酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
3.7.1 梨小食心虫中肠RNA的提取
3.7.2 消化酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
3.7.3 解毒酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
第四章 结论
第五章 讨论
5.1 梨小食心虫幼虫中肠转录组及SSR分子标记分析
5.2 梨小食心虫中肠高表达基因分析
5.3 消化酶、解毒酶基因在不同龄期梨小食心虫幼虫中肠的表达量
参考文献
致谢
个人简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]米象GST基因的表达及其对磷化氢的应答[J]. 叶侃,胡飞,魏兆军. 安徽农业科学. 2019(08)
[2]甜菜夜蛾细胞色素P450基因的克隆与分析[J]. 袁远,高熹,张连根,倪峰,高俨,吴毅歆,喜超,朱家位. 西南农业学报. 2019(02)
[3]二化螟两种P450基因CYP4M38和CYP4M39的时空表达分析[J]. 白琪,鲁艳辉,郑许松,吕仲贤. 浙江农业学报. 2018(04)
[4]梨小食心虫谷胱甘肽S-转移酶GmolGST6的基因克隆、原核表达和酶学特征[J]. 李帅,苏丽,李伯辽,李怡萍,李广伟,仵均祥. 昆虫学报. 2018(04)
[5]绿豆象触角转录组及嗅觉相关基因的分析[J]. 郑海霞,张耀文,张仙红,杨美红. 昆虫学报. 2018(02)
[6]两种农药不同亚致死浓度对梨小食心虫生长发育和繁殖的影响[J]. 庾琴,封云涛,杜恩强,郭晓君,郭贵明,张润祥. 植物保护. 2018(01)
[7]中华蜜蜂幼虫肠道的高表达基因分析[J]. 解彦玲,王鸿权,张璐,侯志贤,刀晨,江亮亮,熊翠玲,郑燕珍,徐细建,黄枳腱,郭睿,陈大福. 浙江农业学报. 2017(09)
[8]中华按蚊八个羧肽酶基因的鉴定及其与吸血餐相关的表达分析（英文）[J]. 史宗畔,支中婧,罗世惠,陈斌,何正波. 昆虫学报. 2017(06)
[9]应用转录组测序高通量发掘东方粘虫SSR标记[J]. 李微,张蕾,程云霞,罗礼智,江幸福. 植物保护学报. 2017(03)
[10]中华蜜蜂幼虫肠道参考转录组的de novo组装及SSR分子标记鉴定[J]. 徐细建,郭睿,骆群,熊翠玲,梁勤,张串联,郑燕珍,张曌楠,黄枳腱,张璐,李汶东,陈大福. 中国农业科学. 2017(06)
博士论文
[1]白假丝酵母菌侵染家蝇幼虫中肠转录组及围食膜蛋白质组学研究[D]. 王宇.贵州医科大学 2016
[2]桔小实蝇消化和解毒代谢相关基因鉴定及其对药剂胁迫的应激反应[D]. 申光茂.西南大学 2013
硕士论文
[1]粘虫细胞色素P450的克隆和特性分析[D]. 刘月庆.东北农业大学 2017
[2]梨小食心虫幼虫中肠胰蛋白酶活性、表达量及与生长发育的关系研究[D]. 赵爱平.西北农林科技大学 2017
[3]基于二代测序的转录组数据分析方法的比较研究[D]. 石浩然.四川农业大学 2016
[4]稻纵卷叶螟转录组及几丁质代谢途径和抗药性基因鉴定[D]. 余海中.安徽农业大学 2015
[5]两种入侵型烟粉虱隐种中肠转录组分析[D]. 叶晓冬.浙江大学 2014
[6]小菜蛾中肠丝氨酸蛋白酶基因的克隆、转录及其酶活的研究[D]. 祝妮.浙江大学 2013
[7]寄主因子对梨小食心虫的发生、生长发育及其产卵选择性的影响[D]. 杨小凡.河北农业大学 2013
[8]陕西古代果树史研究[D]. 刘得腾.西北农林科技大学 2010
本文编号：3100373
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