竹纹枯叶蛾和青黄枯叶蛾线粒体基因组特征及系统发育研究

发布时间：2021-03-31 06:58

　　竹纹枯叶蛾和青黄枯叶蛾是鳞翅目枯叶蛾科纹枯叶蛾属和黄枯叶蛾属昆虫,其幼虫取食重要经济植物,是重要的经济害虫。目前有关两种枯叶蛾的研究主要集中于形态学和生物学方面。本研究利用PCR和测序技术测得两种枯叶蛾线粒体基因组全序列,分析其基因结构、组成、排列等特征;基于竹纹枯叶蛾、青黄枯叶蛾以及35种现有鳞翅目昆虫线粒体基因组蛋白质编码基因的氨基酸、核苷酸序列和2个r RNA基因序列建立系统树。结论如下:1.竹纹枯叶蛾和青黄枯叶蛾的线粒体基因组全长分别为15,368bp和15,281bp,登录号（GenBank accession number）为KU870700和KU884483,AT含量为80.19%和80.87%。两者都具有37个基因（13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因）和1个AT富集区。两种枯叶蛾的tRNA基因的前三个的排列方式典型tRNAMet-tRNAIle-tRNAGln位于AT富集区和ND2之间,剩余基因的排列则与其它昆虫一致。两种枯叶蛾线粒体基因组分别存在18和11个基因间隔区（总长为192bp和149bp）,9和12个基因重叠区（总长为26bp和49b... 

【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第1章 引言
    1.1 枯叶蛾科研究概述
        1.1.1 竹纹枯叶蛾概述
        1.1.2 青黄枯叶蛾概述
    1.2 线粒体概述
        1.2.1 鳞翅目线粒体概述
            1.2.1.1 鳞翅目线粒体特征
        1.2.2 鳞翅目昆虫线粒体DNA的应用
            1.2.2.1 生物分类学
            1.2.2.2 物种起源与遗传分化
            1.2.2.3 性别比例
        1.2.3 鳞翅目线粒体DNA研究现状
    1.3 系统发生树的构建
    1.4 研究目的和意义
    1.5 本文研究内容
第2章 竹纹枯叶蛾和青黄枯叶蛾线粒体基因组序列的扩增及分析
    2.1 实验材料与方法
        2.1.1 样品采集与保存
        2.1.2 主要仪器和试剂
        2.1.3 实验方法
            2.1.3.1 样品处理
            2.1.3.2 总DNA提取
            2.1.3.3 PCR引物设计
            2.1.3.4 序列扩增
            2.1.3.5 PCR产物的检测与测序
            2.1.3.6 线粒体基因组序列拼接、注释和分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 竹纹枯叶蛾线粒体基因组
            2.2.1.1 基因组结构
            2.2.1.2 碱基含量分析
            2.2.1.3 蛋白质编码基因序列分析
            2.2.1.4 t RNA和r RNA基因分析
            2.2.1.5 AT富集区分析
            2.2.1.6 基因间隔区和基因重叠区分析
        2.2.2 青黄枯叶蛾线粒体基因组
            2.2.2.1 基因组结构
            2.2.2.2 碱基含量分析
            2.2.2.3 蛋白质编码基因序列分析
            2.2.2.4t RNA和r RNA基因分析
            2.2.2.5 AT富集区分析分析
            2.2.2.6 基因间隔区和基因重叠区分析
        2.2.3 同源性分析
    2.3 小结与讨论
        2.3.1 两种枯叶蛾线粒体基因组结构与碱基含量分析
        2.3.2 两种枯叶蛾线粒体蛋白质编码基因分析
        2.3.3 两种枯叶蛾线粒体t RNA与r RNA基因分析
        2.3.4 两种枯叶蛾线粒体AT富集区分析
第3章 基于线粒体基因组序列对鳞翅目系统发育的研究
    3.1 分析方法
        3.1.1 物种选取
        3.1.2 系统树的构建
    3.2 结果和分析
        3.2.1 NJ树
        3.2.2 MP树
        3.2.3 ML树
        3.2.4 BI树
    3.3 小结和讨论
第4章 结论与展望
    4.1 结论
    4.2 本研究的不足之处
    4.3 展望
致谢
参考文献
硕士期间科研成果和获奖


【参考文献】：
期刊论文
[1]家蚕的变态发育过程及其激素调控[J]. 李琼艳.  现代农业科技. 2015(18)
[2]线粒体形态的动态变化及其生物学意义[J]. 李佳.  中学生物教学. 2014(06)
[3]基于昆虫共生菌沃尔巴克氏体的蚊媒和蚊媒病控制研究进展[J]. 潘晓玲,刘起勇,奚志勇.  中国媒介生物学及控制杂志. 2014(01)
[4]鳞翅目昆虫比较线粒体基因组学研究进展[J]. 王维,孟智启,石放雄,李风波.  科学通报. 2013(30)
[5]昆虫诱食剂与农药混用防治小菜蛾的效果[J]. 李芳功,杨芳,冯振群.  中国植保导刊. 2013(07)
[6]基于线粒体COⅠ基因的齿小蠹属昆虫DNA条形码研究[J]. 常虹,郝德君,肖荣堂,刘勇,钱路,安榆林,杨晓军.  昆虫学报. 2012(09)
[7]栎黄枯叶蛾生物学特性研究[J]. 王世飞,宗世祥,张金桐,齐忠,张永飞.  山西农业大学学报(自然科学版). 2012(03)
[8]无瓣海桑主要害虫绿黄枯叶蛾的取食行为研究[J]. 邓艳,吴耀军,张文英,杨振德,李德伟.  中国森林病虫. 2012(01)
[9]鳞翅目简介[J]. 卢荣俊.  硅谷. 2010(04)
[10]DNA条形码与生物分类学研究[J]. 葛家文,王好转.  畜牧与饲料科学. 2009(05)

博士论文
[1]鳞翅目线粒体基因组分析及部分蛾类DNA条形码鉴定[D]. 武宇鹏.山西大学 2013

硕士论文
[1]栎黄枯叶蛾空间分布与防控技术初探[D]. 章一巧.北京林业大学 2013
[2]五种灰蝶线粒体基因组比较研究及其系统发生分析[D]. 张兰兰.安徽师范大学 2013
[3]六种粉蝶线粒体基因组比较研究及其系统发生分析[D]. 郝娟娟.安徽师范大学 2013
[4]中国野桑蚕线粒体基因组研究[D]. 夏玉玲.西南农业大学 2003



本文编号：3111012