基于转录组测序开发的一个小麦叶锈菌特异分子标记

发布时间：2021-04-11 16:17

　　小麦叶锈菌毒性变异频繁,新的毒性小种不断出现,往往导致小麦抗叶锈病品种在推广种植几年后的抗性丧失。因此,开发用于田间小麦叶锈病的诊断与预测预报的特异性分子标记具有重要意义。在前期已经完成小麦叶锈菌PHNT转录组测序的基础上,本研究拟在数据库中挑选候选效应蛋白,利用实时荧光定量PCR明确其在叶锈菌侵染小麦后不同时间点的表达模式,根据差异表达分析筛选出候选效应蛋白,再根据编码候选效应蛋白的基因序列设计引物,对小麦叶锈菌PHNT基因组DNA进行PCR扩增,旨在开发小麦叶锈菌特异性分子标记。结果在转录组数据库中筛选出24个候选效应蛋白,qPCR检测明确其中17个具有明显的表达差异。PCR扩增结果表明,基于候选效应蛋白基因PTTG-05290设计的引物在小麦叶锈菌PHNT中获得一条920 bp的条带,且在检测的25种叶锈菌生理小种中均稳定存在,而在小麦条锈菌、菜豆锈菌、枣树锈菌、柳树锈菌、苹果树锈菌及芦苇锈菌6种锈菌中不能获得有效扩增,表明该引物在小麦叶锈菌中具有特异性。qPCR结果表明,PTTG-05290在叶锈菌侵染小麦4 d时达到表达高峰,表达量为0 d的218倍,而0.5 d时便大量检测... 

【文章来源】：植物遗传资源学报. 2020,21(05)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

部分候选效应蛋白的表达模式

为了明确PTTG-05290基因在小麦叶锈菌不同生理小种中的分布情况，提取25个不同小麦叶锈菌生理小种夏孢子基因组DNA，利用特异性引物进行扩增。经1%琼脂糖凝胶电泳检测，结果表明，在检测的25个生理小种中均能获得同样大小的扩增条带，说明该引物不仅适用于叶锈菌生理小种PHNT，而且适用于所有叶锈菌生理小种（图3）。图3 PTTG-05290在叶锈菌不同生理小种中的部分扩增结果

PTTG-05290在叶锈菌不同生理小种中的部分扩增结果

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]番茄病害早期快速诊断与生理信息快速检测方法研究[D]. 鲍一丹.浙江大学 2013

硕士论文
[1]小麦条锈菌效应蛋白Hasp190调控寄主免疫的分子机理研究[D]. 庞丽静.西北农林科技大学 2019
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本文编号：3131574