水稻自然群体苗瘟和穗瘟抗性的全基因组关联分析

发布时间：2021-04-27 19:09

　　水稻（Oryza sativa L.）是世界上主要粮食作物之一,稻瘟病是由真菌Magnaporthe oryzea引起的水稻重要病害之一。在水稻整个生长周期中都有发生,其中以苗瘟和穗瘟的发生更加普遍。实践证明,挖掘和鉴定广谱、高抗稻瘟病基因,培育、推广抗稻瘟病水稻品种是防控稻瘟病最为经济有效的措施。然而,稻瘟病菌的致病性极易变异,携带单个抗性基因的水稻品种在推广种植3-5年后便失效,其抗瘟性会下降甚至丧失。因此,需要鉴定和挖掘新的抗稻瘟病基因,尤其是具有持久抗病性的基因,培育和推广具有持久抗病性的水稻品种,对于控制稻瘟病的发生、稳定水稻产量具有很重要的意义。全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study,GWAS）方法以大量表型数据和分子标记数据作为支撑,找到与性状相关联的SNP（Single Nucleotide Polymorphisms）位点,进一步对SNP位点内的候选基因进行预测和分析,找到相关性状控制的关键基因,具有省时且效率高的特点,在有利基因发掘和鉴定研究中有很好地应用前景。本研究对201份已测序的水稻自然群体材料的苗瘟抗性进行全基因组关联分... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：80 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一部分 文献综述
    第一章 水稻抗稻瘟病研究进展
        1.1 稻瘟病的发生与危害
        1.2 水稻抗稻瘟病基因的鉴定
        1.3 水稻抗稻瘟病基因的克隆和功能研究
    第二章 水稻全基因组关联分析研究
        2.1 全基因关联分析方法及试验设计
        2.2 全基因组关联分析的一般步骤
            2.2.1 种质材料的选择
            2.2.2 目标性状选择
            2.2.3 群体结构分析
            2.2.4 表型性状鉴定
            2.2.5 基因型测定
        2.3 水稻全基因关联分析的研究进展
第二部分 研究报告
    第三章 水稻苗瘟抗性的全基因组关联分析
        3.1 材料与方法
            3.1.1 供试品种
            3.1.2 供试菌株
            3.1.3 稻瘟病菌的培养
            3.1.4 幼苗培育
            3.1.5 接种
            3.1.6 病情调查
            3.1.7 群体材料分析
            3.1.8 全基因组关联分析
            3.1.9 关联SNP位点、候选基因
        3.2 结果与分析
            3.2.1 苗瘟抗性表型数据分析
            3.2.2 苗期稻瘟病抗性的全基因组关联分析
        3.3 讨论
    第四章 水稻穗瘟抗性的全基因组关联分析
        4.1 材料与方法
            4.1.1 供试品种
            4.1.2 供试菌株
            4.1.3 稻瘟病菌的培养
            4.1.4 幼苗培育
            4.1.5 接种
            4.1.6 穗瘟表型鉴定
            4.1.7 群体材料分析
            4.1.8 全基因组关联分析
            4.1.9 关联SNP位点、候选基因
        4.2 结果与分析
            4.2.1 穗瘟抗性表型数据分析
            4.2.2 穗瘟数据表型-SNP标记的全基因组关联分析
        4.3 讨论
全文结论
创新之处
参考文献
附表1
附表2
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]Identification of the novel recessive gene pi55（t） conferring resistance to Magnaporthe oryzae[J]. HE XiuYing 1,2 , LIU XinQiong 3 , WANG Li 1 , WANG Ling 1 , LIN Fei 1 , CHENG YongSheng 2 , CHEN ZhaoMing 2 , LIAO YaoPing 2* & PAN QingHua 1* 1 State Key Laboratory of Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Laboratory of Plant Resistance and Genetics, College of Natural Resources and Environment Sciences, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China; 2 Rice Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 510640, China; 3 Key Biotechnology Laboratory of State Ethnic Affairs Commission, College of Life Science, South-Central University for Nationalities, Wuhan 43074, China.  Science China（Life Sciences）. 2012(02)
[2]水稻稻瘟病抗性基因的归类分析及其功能研究进展[J]. 刘鹏,魏毅东,陈由强,张建福,谢华安.  分子植物育种. 2011(02)
[3]水稻抗病性基因的克隆和功能研究进展[J]. 鄂志国,王磊.  遗传. 2009(10)
[4]水稻稻瘟病抗性基因研究进展[J]. 刘文强,李小湘,王淑红,段永红,吴建利.  杂交水稻. 2009(03)
[5]水稻稻瘟病抗性基因的分子定位及克隆研究进展[J]. 杨勤忠,林菲,冯淑杰,王玲,潘庆华.  中国农业科学. 2009(05)
[6]太湖流域粳稻地方品种黑壳子粳抗稻瘟病基因的分子定位[J]. 李培富,史晓亮,王建飞,刘超,张红生.  中国水稻科学. 2007(06)
[7]关联分析在作物种质资源分子评价中的应用[J]. 王荣焕,王天宇,黎裕.  植物遗传资源学报. 2007(03)
[8]水稻稻瘟病抗性基因定位与克隆研究进展[J]. 刘占领,雷财林,程治军,李伟,王久林,时克.  作物杂志. 2007(03)
[9]稻瘟病抗病基因Pi15的精细定位（英文）[J]. 潘庆华,胡珍娣,谷坂隆俊,王玲.  Acta Botanica Sinica. 2003(07)
[10]水稻稻瘟病菌有性世代形成条件的优化[J]. 张国珍,马秋娟,彭友良.  植物病理学报. 2002(02)



本文编号：3164005