40株尖镰孢菌SRAP遗传多样性分析

发布时间：2021-04-28 21:59

　　[目的]明确尖镰孢菌种内遗传多样性与亲缘关系为尖镰孢菌的分类鉴定及该类病害综合防控提供理论依据。[方法]本试验利用筛选出的12对SRAP引物,对40株尖镰孢菌进行PCR扩增,用POPGENE Version 1.32软件计算遗传多样性参数,用NTSYS-pc Version 2.10s软件对供试菌株进行聚类分析与主成分分析。[结果]共扩增出125个谱带,多态性位点比例达100%,平均每对引物产生多态性条带10.4条。供试菌株的平均Nei’s基因多样性指数（H）和Shannon信息指数（I）分别为0.1 876和0.3 139。晋中地区菌株的Nei’s基因多样性指数和Shannon’s指数均最大（0.172,0.2876）,遗传分化水平最高,多样性最丰富。地理群体间遗传分化系数（Gst）和基因流（Nm）分别为0.3 106、1.1 098,省内3个居群间的遗传距离较其与河北居群间的遗传距离近,表明4个尖镰孢菌群体间存在一定的遗传分化,群体内遗传多样性大于群体间的多样性。地理群体间遗传距离与地理距离存在一定的相关性。聚类与主成分分析结果表明,菌株SRAP类群划分与其寄主和地理来源没有明显相... 

【文章来源】：山西农业大学学报(自然科学版). 2020,40(05)北大核心

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 供试菌株
    1.2 试验方法
        1.2.1 供试菌株培养与菌株DNA提取
        1.2.2 供试菌株的SRAP-PCR扩增
    1.3 数据分析
2 结果与分析
    2.1 引物筛选与供试菌株的遗传多样性分析
    2.2 不同地理来源尖镰孢菌遗传多样性分析
    2.3 不同地理来源尖镰孢菌的遗传一致度和遗传距离分析
    2.4 晋中地区不同寄主来源尖镰孢菌遗传多样性分析
    2.5 供试尖镰孢菌遗传相似性与聚类分析
    2.6 供试尖镰孢菌主成分分析（PCA)
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SRAP分子标记的24个黑木耳栽培菌株遗传分析[J]. 史灵燕,张云龙,刘保卫,郑素月.  食用菌. 2019(06)
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[3]四川省不同地域的核盘菌遗传多样性分析[J]. 杨潇湘,梁洁,黄小琴,张蕾,伍文宪,周西全,刘勇.  植物病理学报. 2019(02)
[4]基于SRAP标记的黄瓜霜霉菌遗传多样性分析[J]. 白玲玲,刘行风,陈政瑜,周莹莹,刘丽,张艳菊,张奥,杨森.  植物保护. 2017(04)
[5]瓜类枯萎病菌遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析[J]. 田叶韩,侯圆圆,彭彩云,王永阳,何邦令,高克祥.  应用生态学报. 2017(03)
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[7]四川西南部小麦白粉菌群体毒性及遗传多样性分析[J]. 雷雨,刘娜,龚国淑,张敏,王旭,祁小波,周游,陈华保,杨继芝,游琴,刘烨珏.  植物病理学报. 2015(05)
[8]水稻茄丝核菌SRAP引物筛选与体系优化[J]. 刘志恒,胡积祥,侯悦,黄欣阳,魏松红.  植物保护学报. 2013(05)
[9]33株尖孢镰刀菌遗传多样性的ISSR分析[J]. 张述义,李新凤,韦晓艳,王建明.  生态学杂志. 2013(05)
[10]辽宁省辣椒疫病菌多态性及致病力分化研究初探[J]. 王辉,刘长远,赵奎华,孙军德.  微生物学通报. 2012(02)

博士论文
[1]山西镰刀菌种类鉴定及遗传多样性分析研究[D]. 李新凤.山西农业大学 2013



本文编号：3166247