喜旱莲子草萜类合成酶基因生物信息学分析及橙花叔醇合酶基因的克隆
发布时间：2021-07-05 12:04
植物挥发出的萜类物质能够影响昆虫的寄主选择行为,其中专食性昆虫识别寄主植物的主要因素是植物的某些挥发物的质和量的不同。莲草直胸跳甲是入侵植物喜旱莲子草的专食性天敌。前期研究表明寄主植物萜类物质DMNT在该昆虫的专性识别中起关键作用。为进一步探究其作用的分子机理,本文主要研究了喜旱莲子草萜类合成酶基因及产生DMNT的关键酶——橙花叔醇合酶基因。1、采用RNA-seq技术,借助Illumina HiSeq2500TM平台对喜旱莲子草进行转录组测序,共获得9.91 Gb reads,经组装拼接得到Transcript 182318条以及83179条Unigene。与Nr、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、KEGG蛋白数据库进行同源性比对后,获得63536条有注释信息的Unigene,构建了喜旱莲子草Unigene数据库,测序结果良好。2、筛选出32条喜旱莲子草萜类合成酶基因,其同源性与藜科甜菜属甜菜基因的同源性较高。参考已报道的萜类合酶基因的家族分类标准,对具有完整开放阅读框的7条序列进行了系统进化分析,其中ApTP7S9、ApTPS17、ApTPS18和ApTPS21分入TPS-...
【文章来源】：山西农业大学山西省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
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【参考文献】：
期刊论文
[1]de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征（英文）[J]. 耿妍,陈玲玲,鲁焕,宁婵娟,BJ?RNLars Olof,李韶山. 热带亚热带植物学报. 2016(02)
[2]大豆橙花叔醇合酶基因克隆及功能鉴定[J]. 梁瑾,王强. 中国油料作物学报. 2015(06)
[3]莲草直胸跳甲在几种非靶标植物上的适合度比较[J]. 赵龙龙,陆俊姣,胡书琴,李娜,马瑞燕. 植物保护学报. 2013(04)
[4]非模式生物转录组研究[J]. 刘红亮,郑丽明,刘青青,权富生,张涌. 遗传. 2013(08)
[5]转录组与RNA-Seq技术[J]. 张春兰,秦孜娟,王桂芝,纪志宾,王建民. 生物技术通报. 2012(12)
[6]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒. 遗传. 2011(11)
[7]植物单萜合酶研究进展[J]. 徐应文,吕季娟,吴卫,郑有良. 生态学报. 2009(06)
[8]植食性昆虫的寄主选择机理及行为调控策略[J]. 陆宴辉,张永军,吴孔明. 生态学报. 2008(10)
[9]入侵植物喜旱莲子草——生物学、生态学及管理[J]. 潘晓云,耿宇鹏,Alejandro SOSA,张文驹,李博,陈家宽. 植物分类学报. 2007(06)
[10]跳甲属昆虫的食性及其生物学意义[J]. 王书永,崔俊芝,李文柱,张勇. 昆虫知识. 2005(04)
博士论文
[1]专食性天敌莲草直胸跳甲对寄主植物选择的嗅觉行为研究[D]. 李娜.山西农业大学 2016
[2]利马豆和水稻DMNT/TMTT合成通路关键基因的鉴定与功能研究[D]. 李峰奇.中国农业科学院 2015
[3]入侵种喜旱莲子草表型可塑性变异和快速适应的分子基础[D]. 高乐旋.复旦大学 2012
[4]入侵杂草的物种分化与局域适应研究[D]. 予茜.武汉大学 2011
本文编号：3266040
【文章来源】：山西农业大学山西省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１多样萜类合成酶合成萜类物质［４６］??Ｆｉｇｕｒｅ．?１－１?Ｔｈｅ?ｆｏｒｍａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｅｒｐｅｎｏｉｄｓ?ｃａｔａｌｙｚｅｄ?ｂｙ?ｖａｒｉｏｕｓ?ｔｙｐｅｓ?ｏｆ?ｔｅｒｐｅｎｅ??
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Ｂａｕｄｏｍｉａ?ｃｏｍｐｍａｃｅｎｓｉｓ?ＵＡＭＨ?ｆ７９２－１．２６％）??Ｏｔｈｅｒ?［１７９２０－２８．４２％］??图３－１与喜旱莲子草转录组基因同源性较高的物种分布??Ｆｉｇｕｒｅ．３－１?Ｈｉｇｈｌｙ?ｈｏｍｏｇｅｎｅｏｕｓ?ｓｐｅｃｉｅｓ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ａ．ｐｈｉｌｏｘｅｒｏｉｄｅｓ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ??Ｏ?？??２１?厂§??１?５?－?－?｜?８??ｆ?！??０３?Ｏ??５?＾?ｉ；?〇＞??１?－?－?－?ｉ?１??１?Ｊｌ?１１１?＼＼＼＼Ｍ?Ｉ?ｌ■■丨丨ｌｌ?．??ｔ?＿?ｉｉ?５?ｉ哺ｎ言１請ｐ議??／?ｐ?綠?Ｍ?、ｉｍｉ??Ｉ?ＳＩ?／?／??ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ?ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?ｐｒｏｃｅｓｓ??图３－２喜旱莲子草转录组Ｇｏ功能分类统计??Ｆｉｇｕｒｅ．３－２?ＧＯ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ?ｏｆ?Ａ．ｐｈｉｌｏｘｅｒｏｉｄｅｓ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ??在ＣＯＧ数据库中对预测的喜旱莲子草转录组基因进行再次分类，共有２０５８７个预??测基因分入到２５个功能组中。其中长度达到１０００?ｂｐ的基因有７８２５个。在２５个功能分??类中
【参考文献】：
期刊论文
[1]de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征（英文）[J]. 耿妍,陈玲玲,鲁焕,宁婵娟,BJ?RNLars Olof,李韶山. 热带亚热带植物学报. 2016(02)
[2]大豆橙花叔醇合酶基因克隆及功能鉴定[J]. 梁瑾,王强. 中国油料作物学报. 2015(06)
[3]莲草直胸跳甲在几种非靶标植物上的适合度比较[J]. 赵龙龙,陆俊姣,胡书琴,李娜,马瑞燕. 植物保护学报. 2013(04)
[4]非模式生物转录组研究[J]. 刘红亮,郑丽明,刘青青,权富生,张涌. 遗传. 2013(08)
[5]转录组与RNA-Seq技术[J]. 张春兰,秦孜娟,王桂芝,纪志宾,王建民. 生物技术通报. 2012(12)
[6]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒. 遗传. 2011(11)
[7]植物单萜合酶研究进展[J]. 徐应文,吕季娟,吴卫,郑有良. 生态学报. 2009(06)
[8]植食性昆虫的寄主选择机理及行为调控策略[J]. 陆宴辉,张永军,吴孔明. 生态学报. 2008(10)
[9]入侵植物喜旱莲子草——生物学、生态学及管理[J]. 潘晓云,耿宇鹏,Alejandro SOSA,张文驹,李博,陈家宽. 植物分类学报. 2007(06)
[10]跳甲属昆虫的食性及其生物学意义[J]. 王书永,崔俊芝,李文柱,张勇. 昆虫知识. 2005(04)
博士论文
[1]专食性天敌莲草直胸跳甲对寄主植物选择的嗅觉行为研究[D]. 李娜.山西农业大学 2016
[2]利马豆和水稻DMNT/TMTT合成通路关键基因的鉴定与功能研究[D]. 李峰奇.中国农业科学院 2015
[3]入侵种喜旱莲子草表型可塑性变异和快速适应的分子基础[D]. 高乐旋.复旦大学 2012
[4]入侵杂草的物种分化与局域适应研究[D]. 予茜.武汉大学 2011
本文编号：3266040
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