两种特色油料植物的油脂代谢和NBS类抗病相关基因的鉴定与分析
发布时间:2022-02-04 21:50
植物种子油是人类营养所需脂肪酸的重要来源,是食品、医药、化工和生物燃油等工业的优质原料。大豆、油菜等普通油料作物的种子油主要由棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸和亚麻酸等5种脂肪酸组成。与之不同的是,一些未完全驯化的植物种子能高水平积累具有独特营养和工业应用价值的珍稀脂肪酸。野生植物斑鸠菊(Verrnonia galamensis)种子油中富含斑鸠菊酸(顺-12,13-环氧-顺-9-十八碳烯酸,vernolic acid),这种天然环氧脂肪酸可用于制造高分子聚合物、塑料、尼龙、粘合剂、油漆和生物农药等高值工业品。亚麻荠(Camelina sativa)种子油富含ω-3脂肪酸,这种对人类大脑和心血管系统极为有益的健康型脂肪酸可用于功能食品、保健医药品和其它化工品加工中。此外,亚麻荠的抗病、虫、杂草及逆境能力极强。这两种特色油料植物已被认为是具有广阔开发应用前景的新型工业油料作物。深入解析这些珍稀脂肪酸的生物合成和调控机制,以及特有农艺性状的遗传基础,可为这两种特色油料植物的遗传改良、栽培驯化、基于种子油脂高附加值产品的研发和商业化提供科学参考。为解析斑鸠菊种子高水平合成积累珍稀斑鸠菊酸的分子机...
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-1斑鸠菊4个样品的总RNA电泳图??Fig.2-1?Total?RNA?isolated?from?four?samples?of?V.galamensis??
从图2-2可以看出,颜色越深,表明该位置的碱基Q值就越大,图中若上方的颜色越深,??说明斑鸠菊测序数据的质量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨晒_■严■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??图2-2测序碱基质量分布图??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??转录组文库的cDNA是被随机打断的,由于其随机性和碱基间的互补性,理论上来??讲每个测序循环过程中碱基“G”和“C”、“T”和“A”的含量应分别对等,且整个测序过程中??其含量应呈水平趋势。从T01样品中碱基含量分布情况来看(图2-3),虽然在整体上??碱基对的含量比较对等,但序列前端的部分碱基分布波动较大,或许是因为转录组测序??过程中所用的合成酶对Reads前端的碱基存有明显偏好性而导致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
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【参考文献】:
期刊论文
[1]斑鸠菊果实中总黄酮的提取工艺研究[J]. 孙美利,李蕾,王和宇,张晶,徐暾海,刘铜华. 世界科学技术-中医药现代化. 2015(05)
[2]‘红阳’猕猴桃全基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析[J]. 文欢,刘永立. 果树学报. 2015(03)
[3]斑鸠菊属药用植物化学成分研究[J]. 孙美利,李蕾,张舒媛,薛峰,张晶,徐暾海,刘铜华. 长春中医药大学学报. 2014(03)
[4]番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析[J]. 刘云飞,万红建,韦艳萍,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,周国治,杨悦俭. 核农学报. 2014(05)
[5]植物NBS-LRR抗病基因的结构、功能、进化起源及其应用[J]. 刘云飞,万红建,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,周国治,韦艳萍,杨悦俭. 分子植物育种. 2014(02)
[6]基于油桐种子3个不同发育时期转录组的油脂合成代谢途径分析[J]. 陈昊,蒋桂雄,龙洪旭,谭晓风. 遗传. 2013(12)
[7]甘蓝型油菜BnDGAT1基因表达的特异性分析[J]. 马燕斌,吴霞,王霞,杜春芳,孙璇,王新胜,范建春,李燕娥. 西北植物学报. 2013(10)
[8]小桐子磷脂二酰甘油酰基转移酶(JcPDAT1)cDNA的克隆与功能鉴定[J]. 徐荣华,邱丽俊,阳天泉,王如玲,田波,刘爱忠. 中国油料作物学报. 2013(02)
[9]植物油脂合成代谢及调控的研究进展[J]. 周丹,赵江哲,柏杨,张群,井文,章文华. 南京农业大学学报. 2012(05)
[10]高通量测序技术及其应用[J]. 王兴春,杨致荣,王敏,李玮,李生才. 中国生物工程杂志. 2012(01)
博士论文
[1]大豆与烟草棕榈油酸代谢工程[D]. 薛金爱.山西农业大学 2014
[2]超积累东南景天转录组学分析与ZIP家族基因功能研究[D]. 高峻.浙江大学 2013
[3]植物环丙烯脂肪酸合成的研究[D]. 焦晓明.中国农业科学院 2013
硕士论文
[1]油桐种子油体发育规律和FADX、PDAT1基因克隆表达[D]. 李虹侠.中国科学院研究生院(武汉植物园) 2015
[2]核桃胚脂肪积累期转录组分析[D]. 张楠.山东农业大学 2014
[3]紫苏种子油脂代谢及限速酶DGAT1基因的表达分析[D]. 张玲慧.山西农业大学 2014
[4]毒根斑鸠菊与疏花卫矛化学成分的研究[D]. 于瑞同.青岛科技大学 2013
[5]基于转录组测序的茯苓酸生物合成途径研究[D]. 陈杰.华中农业大学 2013
[6]EPA合成相关酶基因对棉花的遗传转化[D]. 桂丽娟.山东农业大学 2013
[7]蓖麻FAH12、FAD2与FAE1基因干扰载体的构建与高油酸蓖麻的遗传转化[D]. 邢超.湖南农业大学 2013
[8]油桐FAD2与DGAT2基因的功能分析[D]. 崔琴琴.中国林业科学研究院 2013
[9]人参根、茎、叶转录组测序及差异表达基因分析[D]. 林艳玲.长春中医药大学 2013
[10]石油冲击与石油战略的国际比较[D]. 杨坤.西南财经大学 2012
本文编号:3614003
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-1斑鸠菊4个样品的总RNA电泳图??Fig.2-1?Total?RNA?isolated?from?four?samples?of?V.galamensis??
从图2-2可以看出,颜色越深,表明该位置的碱基Q值就越大,图中若上方的颜色越深,??说明斑鸠菊测序数据的质量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨晒_■严■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??图2-2测序碱基质量分布图??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??转录组文库的cDNA是被随机打断的,由于其随机性和碱基间的互补性,理论上来??讲每个测序循环过程中碱基“G”和“C”、“T”和“A”的含量应分别对等,且整个测序过程中??其含量应呈水平趋势。从T01样品中碱基含量分布情况来看(图2-3),虽然在整体上??碱基对的含量比较对等,但序列前端的部分碱基分布波动较大,或许是因为转录组测序??过程中所用的合成酶对Reads前端的碱基存有明显偏好性而导致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
从图2-2可以看出,颜色越深,表明该位置的碱基Q值就越大,图中若上方的颜色越深,??说明斑鸠菊测序数据的质量就越好。??Quality?Distribution??40?—??■?:?l?;???.*?丨丨晒_■严■■??30?■?■??〇>??I??圣20??"ro??a??10??0????^???±?^??〇?50?1?00?1?50?200?250??Cycle?Number??图2-2测序碱基质量分布图??Fig.2-2?Distribution?of?base?quality?value??转录组文库的cDNA是被随机打断的,由于其随机性和碱基间的互补性,理论上来??讲每个测序循环过程中碱基“G”和“C”、“T”和“A”的含量应分别对等,且整个测序过程中??其含量应呈水平趋势。从T01样品中碱基含量分布情况来看(图2-3),虽然在整体上??碱基对的含量比较对等,但序列前端的部分碱基分布波动较大,或许是因为转录组测序??过程中所用的合成酶对Reads前端的碱基存有明显偏好性而导致|871。??Base?Distribution??so?????.??A??T??40?C??〇??t30?i,?f?丨??i?W"??1?I??10?-??
【参考文献】:
期刊论文
[1]斑鸠菊果实中总黄酮的提取工艺研究[J]. 孙美利,李蕾,王和宇,张晶,徐暾海,刘铜华. 世界科学技术-中医药现代化. 2015(05)
[2]‘红阳’猕猴桃全基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析[J]. 文欢,刘永立. 果树学报. 2015(03)
[3]斑鸠菊属药用植物化学成分研究[J]. 孙美利,李蕾,张舒媛,薛峰,张晶,徐暾海,刘铜华. 长春中医药大学学报. 2014(03)
[4]番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析[J]. 刘云飞,万红建,韦艳萍,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,周国治,杨悦俭. 核农学报. 2014(05)
[5]植物NBS-LRR抗病基因的结构、功能、进化起源及其应用[J]. 刘云飞,万红建,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,周国治,韦艳萍,杨悦俭. 分子植物育种. 2014(02)
[6]基于油桐种子3个不同发育时期转录组的油脂合成代谢途径分析[J]. 陈昊,蒋桂雄,龙洪旭,谭晓风. 遗传. 2013(12)
[7]甘蓝型油菜BnDGAT1基因表达的特异性分析[J]. 马燕斌,吴霞,王霞,杜春芳,孙璇,王新胜,范建春,李燕娥. 西北植物学报. 2013(10)
[8]小桐子磷脂二酰甘油酰基转移酶(JcPDAT1)cDNA的克隆与功能鉴定[J]. 徐荣华,邱丽俊,阳天泉,王如玲,田波,刘爱忠. 中国油料作物学报. 2013(02)
[9]植物油脂合成代谢及调控的研究进展[J]. 周丹,赵江哲,柏杨,张群,井文,章文华. 南京农业大学学报. 2012(05)
[10]高通量测序技术及其应用[J]. 王兴春,杨致荣,王敏,李玮,李生才. 中国生物工程杂志. 2012(01)
博士论文
[1]大豆与烟草棕榈油酸代谢工程[D]. 薛金爱.山西农业大学 2014
[2]超积累东南景天转录组学分析与ZIP家族基因功能研究[D]. 高峻.浙江大学 2013
[3]植物环丙烯脂肪酸合成的研究[D]. 焦晓明.中国农业科学院 2013
硕士论文
[1]油桐种子油体发育规律和FADX、PDAT1基因克隆表达[D]. 李虹侠.中国科学院研究生院(武汉植物园) 2015
[2]核桃胚脂肪积累期转录组分析[D]. 张楠.山东农业大学 2014
[3]紫苏种子油脂代谢及限速酶DGAT1基因的表达分析[D]. 张玲慧.山西农业大学 2014
[4]毒根斑鸠菊与疏花卫矛化学成分的研究[D]. 于瑞同.青岛科技大学 2013
[5]基于转录组测序的茯苓酸生物合成途径研究[D]. 陈杰.华中农业大学 2013
[6]EPA合成相关酶基因对棉花的遗传转化[D]. 桂丽娟.山东农业大学 2013
[7]蓖麻FAH12、FAD2与FAE1基因干扰载体的构建与高油酸蓖麻的遗传转化[D]. 邢超.湖南农业大学 2013
[8]油桐FAD2与DGAT2基因的功能分析[D]. 崔琴琴.中国林业科学研究院 2013
[9]人参根、茎、叶转录组测序及差异表达基因分析[D]. 林艳玲.长春中医药大学 2013
[10]石油冲击与石油战略的国际比较[D]. 杨坤.西南财经大学 2012
本文编号:3614003
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