2-甲-4-氯丙酸对映体在拟南芥中的吸收运转、亚细胞分布及相关分子对接研究

发布时间：2022-02-09 11:14

　　2-甲-4-氯丙酸（2-（4-chloro-2-methylphenoxy）propanoic acid,mecoprop,MCPP）是一种常用的具有手性的激素型除草剂。随着对手性农药及相关机制的深入认识,相关研究发现具有两个互为镜像的对映体（enantiomer）的MCPP在对靶标双子叶植物的除草活性方面存在显著的手性选择性（chiral selectivity）,R型的MCPP是具有显著除草活性的有效体,而S型的除草活性则较为低下。为了探究产生这种选择性差异的主要原因,本研究以两种角度来构建思路和进行实验:首先以核素示踪技术与差速离心方法探究MCPP的两个互为镜像的对映体在双子叶模式植物拟南芥（Arabidopsis thaliana）中的吸收、运转和亚细胞水平（subcellular-level）的分布规律,再利用计算机辅助药物设计（Computer-aided drug design,CADD）中包含的分子对接方法以及能够构建目标蛋白模型的同源模建手段（Homology Modeling）,研究和预测拟南芥中MCPP对应的靶标受体蛋白与两个手性对映体的结合强度与结合情况,拟从配... 

【文章来源】：浙江大学浙江省211工程院校985工程院校教育部直属院校

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．２天然生长素及植物激素类农药在拟南芥细胞核中的??信号响应机制路示意图??

?第一章文献综述???数情况下一级结构足以决定高级结构。２．蛋白质结构进化比对应ＤＮＡ序列进化??缓慢和保守得多，相较ＤＮＡ序列更稳定，容错率也更高［５９＿６１］。用同源建模方法??构建模型的准确度依赖于目标蛋白与参考蛋白序列的统一性，当目标蛋白序列与??参考蛋白有３０％相似度时，即可认为满足同源建模的条件；有５０％及以上的相??似度时被认为可以模拟出高精度的蛋白质结构模型，在主链上的均方根偏差??（Ｒｏｏｔ?Ｍｅａｎ?Ｓｑｕａｒｅｄ?Ｅｒｒｏｒ，?ＲＭＳＤ）能够迗到小于１埃的水平。同源模建需要历经??的过程见图，补充说明与详细解释如下：??ｘ??

图１．５?ＴＩＲ１的结构模型与结合位点（灰色小分子ＩＡＡ所在位置为结合位置）??Ｆｉｇ．?１．５?３Ｄ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＴＩＲ１?ａｎｄ?ｉｔｓ?ｄｏｃｋｉｎｇ?ｌｏｃａｔｉｏｎ??图１．６ＴＩＲ１与ＩＡＡ的结合口袋中及结合的关键氨基酸残基??Ｆｉｇ．ｌ?．６?Ｃｒｕｃｉａｌ?ａｍｉｎｏ?ａｃｉｄ?ｒｅｓｉｄｕｅｓ?ｉｎ?ｐｏｃｋｅｔ?ｗｈｅｒｅ?ＴＩＲ１?ｂｉｎｄｓ?ｗｉｔｈ?ＩＡＡ??２２??

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]核酸—配体分子对接方法的研究[D]. 黄艺佳.华东理工大学 2014



本文编号：3616906