马铃薯A病毒在云南省的发生及其P3蛋白序列分析

发布时间：2022-04-23 07:46

　　【目的】了解马铃薯A病毒在云南省的发生分布情况,明确云南省分离物变异情况。【方法】用DAS-ELSIA的方法,检测云南省19个种植马铃薯县（市）的389个样品;对5个地区的阳性样品用RT-PCR扩增马铃薯A病毒P3蛋白基因,克隆测序,使用DNAMAN及DNAStar等软件分析序列,采用MEGA 6.0邻接法（Neighbor-Joining,NJ）构建系统进化树。【结果】DAS-ELISA检测389个样品,PVA的检出率为20.82%。用P3蛋白基因特异性引物从云南5个不同地区的PVA阳性样品中扩增得到1041bp的目的片段;比较分析了云南省5个地区马铃薯A病毒分离物之间,及与国内外13个分离物的P3蛋白和PIPO蛋白同源性,发现云南省5个地区PVA分离物之间P3蛋白和PIPO蛋白氨基酸序列同源性分别为98.8%～99.7%和97.6%～100.0%;与国内外13个分离物P3蛋白和PIPO蛋白的氨基酸序列同源性分别为90.8%～99.1%和90.5%～100.0%。系统进化树显示,云南省5个分离物与湖南省分离物（KF977085）亲缘关系最近;PVA马铃薯分离物和新西兰树番茄分离物之间... 

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 马铃薯病样
        1.1.2 仪器与试剂
    1.2 方法
        1.2.1 ELISA检测
        1.2.2 植物总RNA提取
        1.2.3 引物的设计与合成
        1.2.4 RT-PCR扩增、克隆
        1.2.5 序列分析
2 结果与分析
    2.1 ELISA检测结果
    2.2 PVA P3蛋白基因RT-PCR扩增、克隆、测序
    2.3 云南省不同地区PVA分离物之间P3及PIPO蛋白序列分析
    2.4 云南省和其他已报道的PVA分离物的P3蛋白及PIPO蛋白序列同源性分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于ROI快速检测与融合特征的马铃薯病害识别[J]. 范振军,李小霞.  西南农业学报. 2019(03)
[2]甘肃省马铃薯主要病毒病发生情况调查[J]. 齐恩芳,刘石,贾小霞,文国宏,吕和平,黄伟,高彦萍.  植物保护. 2018(04)
[3]云南马铃薯A病毒分布及其外壳蛋白分子变异分析[J]. 王东,张磊,董家红,张仲凯.  西南农业学报. 2012(02)
[4]马铃薯Y病毒属病毒P3和P3-PiPo蛋白功能研究进展[J]. 崔晓艳,陈新,顾和平,张红梅,陈华涛,袁星星.  微生物学通报. 2012(01)
[5]马铃薯A病毒及其风险分析[J]. 张洪峰,陈阳婷,孟兴,谭家兴,张敏,宁红.  植物检疫. 2010(04)

硕士论文
[1]呼和浩特周边地区马铃薯病毒病的田间调查及分子鉴定[D]. 秦亚南.内蒙古大学 2018
[2]重庆马铃薯病毒病病害调查及病原鉴定[D]. 吴畏.西南大学 2015
[3]马铃薯病毒快速检测技术的建立与应用[D]. 时妍.河南工业大学 2012
[4]乌鲁木齐地区马铃薯病毒和类病毒的分子鉴定及检测技术研究[D]. 董代幸.新疆农业大学 2010



本文编号：3646867