寡孢节丛孢StuA基因突变株的表型及转录组分析

发布时间：2023-04-08 05:19

　　食线虫真菌是一类土壤微生物,作为线虫的天敌,它们对于维持线虫在土壤.生态外境中的种群动态平衡发挥着十分重要的作用。寡孢节丛孢(Arthrobotrys oilgospora)是研究捕食线虫真菌与线虫相互作用的模式菌株,它能产生三维菌网捕捉线虫。2011年,本课题组报道了寡孢节丛孢的基因组序列,为进一步研究捕食器官形成的分子机制奠定了基础。本论文以△AAoStA突变株为研究对象,比较了寡孢节丛孢原始菌株和△AoStuA突变株表型特征的差异。同时,通过转录组测序比较△AoStuA突变株和原始菌株经线虫提取液诱导不同时间点的基因表达水平变化,对显著差异表达基因进行了 GO基因功能富集分析和KEGG pathway分析。主要实验结果如下:1、寡孢节丛孢野生株和AoStuA基因突变株的表型特征比较△AoStuA突变株在PDA等培养基上的生长速率显著低于原始菌株,产孢率显著降低,且大部分孢子形态畸形,呈现不完全发育,孢子的萌发率也低于原始菌株,萌发后的菌丝分化程度明显弱于原始菌株,并且不能产生三维菌网,捕杀线虫的能力丧失,对NaCl、H202和SDS的抗性减弱,胞外蛋白酶水解活性下降。2、寡孢节丛...

【文章页数】：111 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1 食线虫真菌的研究进展
    2 APSES蛋白家族的研究进展
    3 荧光定量PCR的应用
    4 转录组学的研究进展
    5 本论文的选题依据及研究意义
第二章 寡孢节丛孢野生菌株与△AoStuA突变株的表型比较
    1 前言
    2 实验材料和仪器
        2.1 实验菌株
        2.2 主要培养基
        2.3 主要生化试剂
        2.4 实验仪器
    3 实验方法
        3.1 生长速率测定和形态观察
        3.2 产孢能力及孢子形态比较
        3.3 杀线虫能力比较
        3.4 逆境生长情况比较
        3.5 胞外蛋白酶实验
    4 实验结果
        4.1 生长速率测定和形态观察
        4.2 产孢能力及孢子形态比较
        4.3 杀线虫能力比较
        4.4 逆境生长情况比较
        4.5 胞外蛋白酶活性比较
    5 讨论
        5.1 生长速率的比较
        5.2 产孢能力及孢子形态比较
        5.3 逆境生长情况比较
        5.4 胞外蛋白酶水解活性比较
第三章 寡孢节丛孢和△AoStuA突变株RT-PCR及转录组分析
    1 前言
    2 实验材料、试剂、仪器
        2.1 实验菌株
        2.2 主要培养基
        2.3 主要试剂
        2.4 主要仪器设备
    3 实验方法
        3.1 诱导实验和转录时间点的确定
        3.2 高通量测序样品的制备
        3.3 荧光定量RCR
        3.4 RNA-Seq
    4 实验结果
        4.1 转录时间点的确定
        4.2 RNA质量检测结果
        4.3 荧光定量结果
        4.4 转录组测序数据分析
        4.5 讨论
全文小结及展望
参考文献
附录
    附录1 荧光定量引物序列
    附录2 RT-PCR结果
    附录3 部分未经注释基因的RPKM值列表
    附录4 常用的数据库和网上生物学资源
    附录5 硕士期间发表和待发表的论文
    附录6 硕士期间所获荣誉
致谢



本文编号：3786087