小麦与小麦孢囊线虫互作早期的转录组分析

发布时间：2023-05-19 05:16

　　小麦孢囊线虫Heterodera avenae会被小麦根所吸引然后开始侵染小麦,但是这个阶段小麦和线虫间的互作过程尚有很多是未知的。本研究通过mRNA转录组测序的方法分析了吸引阶段小麦和H avenae的转录应答反应;采用qPCR的方法对筛选的差异表达基因进行了表达量变化趋势的验证;通过烟草(Nicotiana benthamiana 瞬时表达系统,对H.avenae 差异基因中的预测效应因子基因进行了植物防御抑制性检验。与它们各自的活动性一致,不移动的寄主小麦根有93个差异表达基因(27个上调,66个下调),而活动的植物寄生线虫H.avenae反应比较活跃,共有879个差异表达基因(867个上调,12个下调)。其中,相当数量的小麦差异表达基因(大部分是下调基因)参与生物胁迫通路,而线虫的差异基因中有若干个预测效应因子基因上调表达。其中的一个预测的类几丁质酶效应因子基因可以抑制BAX激发的烟草叶片细胞的程序性坏死。这些实验结果表明在线虫寄生的吸引阶段,H.avenae比小麦反应更活跃。线虫的应答反应主要涉及基因的上调表达,其中包括至少一个抑制植物防御的预测效应因子基因(类几丁质酶基因)...

【文章页数】：70 页

【学位级别】：博士

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摘要
Abstract
第一章 前言
    1.1 小麦孢囊线虫病概述
        1.1.1 小麦孢囊线虫病的分布和危害
        1.1.2 小麦孢囊线虫的生活习性
        1.1.3 小麦孢囊线虫的防治概况
    1.2 吸引阶段线虫-寄主的互作研究
    1.3 转录组测序在H.avenae研究中的应用
    1.4 植物寄生线虫效应因子对寄主防御反应的影响
        1.4.1 植物寄生线虫效应因子概述
        1.4.2 植物寄生线虫效应因子对寄主防御反应的影响
    1.5 烟草BT-PCD的抑制筛选体系在效应因子功能研究中的应用
    1.6 本研究的目的与意义
第二章 材料与方法
    2.1 试验材料及试剂
    2.2 试验方法
        2.2.0 小麦根尖对线虫的吸引
        2.2.1 植物组织内线虫染色
        2.2.2 总RNA提取及检测
        2.2.3 RNA文库构建、质控及上机测序
        2.2.4 生物信息学分析
        2.2.5 差异表达基因验证
        2.2.6 线虫效应因子预测
        2.2.7 BT-PCD的抑制性检测
第三章 结果与讨论
    3.1 小麦根对线虫的吸引
    3.2 小麦根组织转录组数据
        3.2.1 测序数据产出统计
        3.2.2 转录组数据与参考基因组序列比对
        3.2.3 小麦差异表达基因分析
    3.3 线虫转录组数据
        3.3.1 测序数据产出统计
        3.3.2 转录组测序数据组装
        3.3.3 测序数据与组装结果的比对统计
        3.3.4 Havenae差异表达基因分析
    3.4 讨论
参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3819726