草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析

发布时间：2024-02-16 06:22

　　【目的】草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫。本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析。【方法】利用高通量测序技术对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。【结果】经de novo组装共获得209 002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp。共有46 198条(57.43%) unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1 713条(2.13%) unigene在所有数据库中均能获得注释。在GO数据库中获得205 269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3 408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路。共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异。通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9 162个上调和6 399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著...

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【部分图文】：

图1草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫转录组unigene序列长度分布

草地贪夜蛾转录组数据组装后的unigene序列与CDD,KOG,COG,NR,NT,PFAM,Swiss-Prot和TrEMBL等多个数据库比对,共有46198条(57.43%)unigene在至少1个数据库中获得功能注释,1713条(2.13%)unigene在....

图2草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫转录组unigene在NR数据库的同源物种分布

根据GO数据库注释结果,共有205269条草地贪夜蛾unigene被划分为68个功能分类(图4),生物学过程注释到的unigene最多,共有91666个,占44.66%,其中注释较多的功能分别为细胞过程(14535个,7.08%)、代谢过程(11439个,5.57%)....

图3草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫转录组unigene的KOG功能分类

表3草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫转录组中与解毒相关基因的统计Table3Statisticsofunigenesassociatedwithdetoxificationinthetranscriptomesofmaleadultandthe5th....

图4草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫转录组unigene的GO功能分类

图3草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫转录组unigene的KOG功能分类根据KEGG数据库注释结果,主要分为5大类功能,包括代谢(1815个,29.25%)、有机系统(1496个,24.11%)、遗传信息处理(1118个,18.01%)、细胞过程(917个,14.78....

本文编号：3900975