水稻种质资源关联分析定位苗期稻瘟病抗性QTL

发布时间：2024-02-20 04:47

　　水稻是世界上最重要的粮食作物之一,稻瘟病是水稻三个病害中最严重的一种病害,培育和推广抗稻瘟病品种是防治稻瘟病最经济有效的方法。本研究利用2套来源广泛的水稻核心种质资源分别鉴定了对5个和3个稻瘟病菌株的抗性,筛选抗稻瘟病的种质资源,结合全基因组高密度的基因型解析水稻苗期抗稻瘟病的遗传基础,定位影响水稻抗稻瘟病的主效QTL和候选基因,挖掘重要主效QTL的有利等位基因,为分子育种改良水稻稻瘟病抗性提供种质资源和基因资源。具体结果如下:(1)利用5个强致病力的稻瘟病菌株对一套由447个品种组成的籼粳核心种质资源进行抗性鉴定(实验一),发现种质资源的稻瘟病抗性变异十分丰富,其中籼稻对HLJ13-856的抗性显著高于粳稻,而粳稻对GD00-193的抗性显著高于籼稻;核心种质中筛选到8个籼稻和12个粳稻品种对全部5个菌株均表现为抗病;对GD00-193、GD17-CQ16和HB1708 3个菌株的抗性彼此间都存在显著的正相关。(2)实验一中,利用全基因组关联分析共定位到68个影响抗5个稻瘟病菌株的主效QTL,其中有12个位点同时影响2个或2个以上菌株的抗性,2个QTL在两个亚种中均定位到;从14个位...

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【部分图文】：

图2-1籼粳两个亚种的群体结构与LDFig.2-1PopulationstructureandLDofxianandgenggermplasms注：A图为籼稻的主成分分析图和群体结构图；B图为粳稻的主成分分析图和群体结构图；C图为籼稻（红的）和粳稻（蓝色）的LD

17籼稻分成了两个亚群。为了去除群体结构，我们将其中一个亚群的17个品种（IRGC号分别为117280，117684，117826，117880，117881，121063，121089，121145，121156，121632，121639，121689，121722，1217....

图2-2籼粳核心种质对5个稻瘟病菌株的抗性的频率分布

图2-4籼粳核心种质对稻瘟病5个菌株抗性关联分析的曼哈顿图和QQ图

29图2-4籼粳核心种质对稻瘟病5个菌株抗性关联分析的曼哈顿图和QQ图Fig.2-4ManhattanandQQplotsofSNPsassociatedwithresistancetofiveblaststrainsA：籼稻种质资源对GD00-193的抗性关联；B：粳稻种质资源....

图3.2重要QTL候选区间曼哈顿图与候选基因的单倍型分析

51图3.2重要QTL候选区间曼哈顿图与候选基因的单倍型分析Fig.3-2ManhattanplotofimportantQTLandhaplotypeanalysisofcandidategenesA：qGD001-4；B：qGD004-1；C：qGD004-4；D：qGD08....

本文编号：3903865