希金斯炭疽菌效应分子的预测与筛选以及ChEP011的功能分析
发布时间:2024-03-19 01:59
希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsianum)是一种重要的植物病原真菌,可为害多种十字花科植物,比如萝卜属(Raphanus)和芸薹属(Brassica)中的多种蔬菜作物,引起严重的炭疽病。华南地区高温高湿的气候条件非常有利于十字花科蔬菜如菜心炭疽病的发生,病害严重时产量损失可达30%40%。迄今为止,从细胞水平和分子水平上研究希金斯炭疽菌致病机理的报道甚少。本研究通过对希金斯炭疽菌候选效应分子的预测、筛选和功能分析,旨在更好地了解效应分子在该病菌致病过程中的作用,为病原菌与寄主植物互作分子机制的研究提供重要依据。现将研究结果报道如下。根据最近公布的希金斯炭疽菌全基因组序列,利用生物信息学技术对其候选效应分子进行了预测。通过SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor和TargetP等生物信息学软件和数据库预测获得候选的希金斯炭疽菌外泌蛋白,然后根据蛋白中半胱氨酸的含量和序列大小进行进一步的筛选,最后通过非冗余蛋白质数据库和blastp服务器作进一步分析,筛选获得无同源性或同源性较低的蛋白序列,从而得到13...
【文章页数】:83 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:3932150
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图1.1希金斯炭疽菌的主要地域分布
1图1.1希金斯炭疽菌的主要地域分布注:主要分布于中国、美国、印度、日本以及东南亚等国家和地区
图1.2菜心炭疽病及其病原菌希金斯炭疽菌(Colletotrichumhigginsianum)
洋梨形;分生孢子圆筒形,大小为13~18×3.0~5.5mm,内有1~2个油球(图1.2)(侯明生,1998;李怀芳等,2001)。图1.2菜心炭疽病及其病原菌希金斯炭疽菌(Colletotrichumhigginsianum)(引自何银银,2014)注:(a)症状....
图1.3希金斯炭疽菌的致病过程模式图(引自O’Conneletal.,2012)
3图1.3希金斯炭疽菌的致病过程模式图(引自O’Conneletal.,2012)注:A:附着胞(appressorium);C:分生孢子(conidium);Co:分生孢子梗(conidiophore);PH:初生菌丝(primaryhyphae);SH:次生....
图1.4植物与病原菌互作的Z字模型(引自Jonesetal.,2006)
图1.4植物与病原菌互作的Z字模型(引自Jonesetal.,2006):PAMPs:病原相关分子模式(pathogen-associatedmolecularpatterns);PTI:病原相关分式触发的免疫(PAMP-triggeredimmunity)....
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