链格孢菌比较基因组及bZIP转录因子功能研究

发布时间：2024-04-01 21:28

　　柑橘褐斑病是柑橘上的重要病害,可引起大量落叶、落果、枯梢等严重问题。柑橘褐斑病菌可分泌一种寄主专化性毒素(Host Selective Toxins,HSTs)-ACT毒素,只专化性为害特定基因型的橘、葡萄柚、杂交橘橙或橘柚。病菌分生孢子在萌发时即可产生ACT毒素,这些毒素进入细胞后破坏其质膜系统,引起电解质渗漏和细胞死亡,然后从死亡的寄主细胞获取营养而生长。目前对柑橘褐斑病的病原种类尚有争议,为了解决这个问题,本研究对来自我国不同地区、不同柑橘品种上分离的78个链格孢菌株进行了全基因组测序和比较分析。转录因子又称为反式作用元件,其DNA结合域能与特定的靶基因上游启动子区域的顺式作用元件产生特异性结合,从而调控靶基因时空表达,调控生命活动。碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物特有的DNA结合域氨基端富含碱性氨基酸,羧基端含有亮氨酸拉链的转录因子家族。虽然bZIP转录因子家族基因在一些真菌有所报道,但在链格孢属真菌尚无系统研究。本研究首先通过生物信息学分析方法鉴定了柑橘褐斑病菌Z7菌株中的所有bZIP转录因子,利用同源重组技术敲除其中13个bZI...

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【部分图文】：

图１．１?２０１６年世界主要柑橘类水果生产国家的产量统计表（计量单位：吨）??Ｆｉｇ．?１．１?Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ?ｓｔａｔｉｓｔｉｃ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｗｏｒｌｄ＇ｓ?ｍａｊｏｒ?ｃｉｔｒｕｓ?ｆｒｕｉｔ?ｐｒｏｄｕｃｅｒ?ｉｎ?２０１６?（ｔｏｎｓ）??Ｄａｔａ?ｓｏｕｒｃｅ：?Ｅｃｏｎｏｍｉｃ?ａｎｄ?Ｓｏｃｉａｌ?Ｄｅｐａｒ?

?第一章绪论??万亩，总产量为３７９２万吨，占世界柑橘产量的２６％?（见图１．１）。在中国，柑橘种植面积已??经超过苹果，产量略低于苹果，是全国第二大水果。栽培柑橘的省、直辖市、自治区共有??２２个，主要集中在广西、湖南、广东、湖北、四川、福建、江西、重庆、浙江、和云南１〇??个....

图１．２链格孢褐斑病、粗柠檬叶斑病和墨西哥莱蒙叶斑病的分布??Ｆｉｇ．?１．２?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ａｌｔｅｍａｒｉａ?ｃｉｔｒｕｓ?ｄｉｓｅａｓｅ?ｉｎ?ｔｈｅ?ｗｏｒｌｄ??

产生黑腐病症状。因此，柑橘黑腐病病原菌可能包括来自不同遗传谱系的链格孢（４??。在四种链格孢引起的柑橘病害中，以相■橘褐斑病在全世界分布最广，对世界??柑橘产业的破坏最为严重（见图１．２）。??－５０?Ｗ??＊＂■?．？■＞?＜？？，－?，？Ｓ＊ｋ??－１００?０?１００?２６０....

图１．６粗糙脉孢菌ＣＹＳ３的ＤＮＡ保守结合位点??－

Ａｓｐａｒｔａｔｅ??甲確氰酸合成Ｂ途轻??图１．５真菌甲硫氨酸的生物合成机制??Ｆｉｇ．?１．５?Ｓｕｌｆａｔｅ?ａｓｓｉｍｉｌａｔｉｏｎ?ａｎｄ?ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ?ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ｉｎ?ｆｕｎｇｉ??１．３．２真菌甲硫氨酸合成途径的关键基因??....

图２．２?利用Ｍａｕｖｅ对ＳＰＡｄｅｓ和ＡＬＬＰＡＴＨＳ－ＬＧ拼接Ｚ７基因组与Ａ?ａｌｔＮＬ０３００３参??考基因组的比较（第一排为ＡＬＬＰＡＴＨＳ－ＬＧ拼接的基因组，第二排为ＳＰＡｄｅｓ拼接的基因组，??第三排为Ａ?ｓｏ／＜７？ｚ＿?ａｌｔＮＬ０３００３的参考基因组）??

?？?Ｉ?Ｉ?ＩＰ?Ｉ?Ｊ?＾?ＩＰ?ｓ?ｌ?ｉｗ?ｍ??图２．１利用ＭＵＭＭＥＲ对ＳＰＡｄｅｓ和ＡＬＬＰＡＴＨＳ－ＬＧ拼接Ｚ７基因组的比较（横坐标为??ＳＰＡｄｅｓ拼接结果，以ＳＰ开头代表不同Ｓｃａｆｆｏｌｄｓ，纵坐标为ＡＬＬＰＡＴＨＳ－ＬＧ，以ＳＡ开头）??Ｆｉｇ．２．１?Ｃ....

本文编号：3945336