滇重楼辣椒轻斑驳病毒分离物的鉴定及全基因组序列分析

发布时间：2025-01-04 01:00

　　 滇重楼(Paris polyphylla var. yunnanensis)是多年生草本植物,其药用部位为地下根茎,是一种重要的中药材。为明确侵染滇重楼的病毒病原,对采自云南省曲靖市的滇重楼进行透射电镜观察、DASELISA和RT-PCR技术检测。在透射电镜下观察到杆状病毒粒子,大小为(200～300)nm×(20～36)nm。对采集到的7份病样进行DAS-ELISA检测,结果表明,其中5份病样呈阳性。通过RT-PCR技术扩增、克隆获得1个全长为6 357 bp的曲靖分离物PMMoV-QJ的全基因组序列。将PMMoV-QJ的全基因组序列与国内外已经报道的10个PMMoV分离物进行同源性分析比对,其同源性为99.42%～99.81%。基于全基因序列的系统发育分析表明,PMMoV-QJ与韩国分离物亲缘关系密切。本研究明确了该分离物的亲缘关系,从分子水平鉴定该分离物,为后续滇重楼病毒病的预防提供理论依据。

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图1 田间滇重楼病叶症状

对采集到的7份病样进行DAS-ELISA检测，结果表明，其中5份病样呈阳性（表2）。图2滇重楼病叶中提纯得到的杆状病毒粒子

图2 滇重楼病叶中提纯得到的杆状病毒粒子

图1田间滇重楼病叶症状2.4PMMoV-QJRT-PCR扩增结果

图3 不同来源的PMMo V分离物的全基因组序列系统进化树

将PMMoV-QJ的基因全序列与上述10个PM-MoV分离物进行比对后，通过MEGA7.0软件，采用Neighbor-Joining聚类分析方法构建系统进化树（图3）。结果表明，将所有PMMoV分离物聚集在一起，形成两大支系群体。PMMoV-QJ与中国葫芦岛分离物PMMoV-Hu....

本文编号：4022656