秦黑杨1号、2号等美洲黑杨指纹图谱构建及遗传关系分析

发布时间：2020-05-24 23:26

【摘要】：美洲黑杨由于树形优美、材性良好和适应性强等特点,已成为我国重要的造林和绿化树种,近年来,由于通过从国外引种和人工杂交培育等方法,已有很多美洲黑杨优良无性系,但是无性系之间在形态学上差异较小,难以区分,特别是在冬季落叶后,更加难以准确鉴别,影响品种选育及推广。分子标记由于不受环境等因素影响,已广泛应用于植物品种鉴定和遗传关系分析中。本研究以西北农林科技大学渭河试验站秦黑杨1号、2号等12份美洲黑杨无性系为研究对象,利用SSR分子标记技术构建12份美洲黑杨无性系的DNA指纹图谱,并进行遗传关系分析,为美洲黑杨无性系品种鉴定和知识产权保护提供理论科学依据。研究结果如下:1.从25对SSR引物中筛选出5对(PMGC_2217、PMGC_2675、PMGC_2866、WPMS_14、WPMS_17)多态性丰富、扩增效率高、条带清晰的引物,共扩增出清晰条带24条,平均每对引物扩增条带为4.8条,其中,多态性条带23条,多态性比率达到95.8%,扩增产物主要分布在126~348 bp之间。2.对12份种质进行UPGMA聚类分析,遗传相似性系数在0.4583~0.9583之间,平均相似系数为0.6660,变幅为0.5000。秦黑杨1号、秦黑杨2号、陕林3号与I-69杨的遗传相似系数在0.5417-0.6667之间,表明其与I-69杨的遗传差异性均较小。根据聚类结果可将12个美洲黑杨无性系大致分为三个类群,结果大致和引种来源地一致。3.利用5对SSR引物扩增出的24条多态性条带绘制12个无性系指纹图谱。在指纹图谱中,每个无性系的谱带位置和大小都各不相同,说明这12个供试无性系在DNA水平上具有一定的遗传差异,可将12份美洲黑杨种质完全区分开。
【图文】：

平均每对引物扩增出条带为 4.8 条，其中引物 PMGC_2866 最多，扩增出 8 条条带引物 PMGC_2217、PMGC_2675、WPMS_14、WPMS_17 均扩增出 4 条条带。其中多态性条带 23 条，占 95.8%，，每对引物的多态性均较高，除引物 WPMS_17 的多态性为 75%以外，其余四对引物的多态性都为 100%。如图 3-1 是引物 PMGC_2866 和引物 PMGC_2217 的扩增结果图。表 3-1 5 对引物的扩增结果Table.3-1 Amplification results of 5 primers引物名称Name ofprimersTm/℃条带数Number ofbands多态性条带数Number of Polymorphicbands多态性比率Rate of Polymorphicbands（%）PMGC_2217 52 4 4 100%PMGC_2675 52 4 4 100%PMGC_2866 52 8 8 100%WPMS_14 60 4 4 100%WPMS_17 60 4 3 75%

Table 3-3 Genetic similarity coefficient of 12 clones analyzed by SSR编号 Code 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 1.00002 0.7083 1.00003 0.8333 0.5417 1.00004 0.6667 0.9583 0.5833 1.00005 0.8333 0.6250 0.9167 0.6667 1.00006 0.6250 0.8333 0.6250 0.8750 0.7083 1.00007 0.5417 0.7500 0.4583 0.7917 0.5417 0.7500 1.00008 0.6667 0.5417 0.7500 0.5833 0.7500 0.7083 0.4583 1.00009 0.7083 0.6667 0.6667 0.7083 0.7083 0.5833 0.5000 0.7083 1.000010 0.7500 0.6250 0.7500 0.5833 0.6667 0.4583 0.4583 0.5833 0.6250 1.000011 0.5000 0.7083 0.5833 0.7500 0.5833 0.6250 0.6250 0.5000 0.5417 0.7500 1.000012 0.6667 0.8750 0.5833 0.9167 0.6667 0.7917 0.7083 0.5833 0.7083 0.5833 0.6667 注：编号 1~12 同表 2-1。Note: The numbers of materials1~12 are the same as table 2- 1.
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S792.11

【参考文献】

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本文编号：2679164