基于ISSR标记的合江方竹遗传多样性分析

发布时间：2020-06-09 09:37

【摘要】：合江方竹(Chimonobambusa hejiangensis)是禾本科竹亚科倭竹族寒竹属具有良好的食用价值的竹种,被视为良好的秋季笋用竹;特产于川黔之交的合江、赤水、古蔺、叙永等县(市)。目前,尚未有针对原产区合江方竹群体的遗传多样性研究,为了给产区合江方竹的栽培利用、育种以及保护提供一定的理论参考依据,本研究利用ISSR引物对合江方竹的遗传多样性进行了分析,并在此基础上提出了合江方竹的保护和利用建议。其主要结果如下:本实验选用了11条ISSR引物用于扩增合江方竹DNA,共扩增出151条带,其中具有多态性的条带130条,多态性比率86.1%。平均每条引物扩增出13.7条带,平均每条引物扩增出的多态性条带数11.8条。观测等位基因数Na在1.35-1.90之间,平均为1.71。有效等位基因数Ne在1.0751-1.3618之间,平均为1.2645。平均杂合度(H)在0.0578-0.2405之间,平均为0.1729。Shannon's多样性指数(I)在0.1030-0.3857之间,平均为0.2782。合江方竹物种水平平均杂合度H为0.1729、Shannon’s多样性指数I平均值为0.2782,表明物种水平遗传多样性较低。在同一地域,由于海拔差异以及人为活动的强弱均导致了居群遗传多样性的不同,总体而言,合江方竹的遗传多样性随着海拔的变化而变化,呈现出正相关关系。在所选十个居群当中,以宝源1(BY 1)居群的平均杂合度H、Shannon’s多样性指数I最高,二郎坝(ELB)居群次之。尽管合江方竹遗传分化程度较大,然而主要的遗传分化仍在居群内部,占61.67%;而其基因流较低,表明不同合江方竹居群之间的基因交流少,种群之间的基因分化水平低。利用NTSYS 2.1软件,以UPGMA法构建合江方竹居群群体遗传关系聚类图。10个居群的聚类图可在遗传相似系数为0.88时分为三个大支。福宝(FB)居群单独为一支;大石(DS)居群、两河口(LHK)居群和宝源3(BY 3)居群聚为一支;宝源1(BY1)居群、黄荆(HJ)居群、水尾(SW)居群聚为一小支后再与长期(CQ)居群、二郎坝(ELB)居群、宝源2(BY 2)居群所形成的小支聚为一个包含六个居群的大支。
【图文】：

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合江方竹作为优良的笋用竹，能为产区的农民带来实实在在的利益，对要绿水青山，又要金山银山”的可持续发展规划中可以发挥切切实实的作用止，关于合江方竹的研究主要为种子育苗（张家贤，1991）、出笋成竹规律1991；王光剑，2016）、营养成分（苟光前，2010）、分子系统学（马师，培利用（李平，2011；刘跃钧，2012；马师，，2016，2017）等。而在遗传多面，仅有对于其栽培于浙江丽水和杭州的两个合江方竹种群有过报道（刘跃而对原产区的合江方竹的遗传多样性，则尚未见报道。因此，本研究采用已经分子标记技术，研究产区合江方竹的遗传多样性，可以为产区合江方竹的栽种以及保护提供一定的理论参考资料。1.5 技术路线本研究拟采用如下技术路线图进行。

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贵州大学 2019 届硕士研究生学位论文基于 ISSR 标记的合江方竹遗传多样性分析第二章材料与方法2.1 材料2.1.1 生物材料本研究所用合江方竹（Chimonobambusa hejiangensis C.D. Chu et C.S. Chao）取自贵州省赤水市，以及四川的合江县、古蔺县和叙永县。经贵州大学竹类研究所苟光前教授鉴定为合江方竹，凭证标本存放于贵州大学生科院植物标本室。
【学位授予单位】：贵州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：S795

【参考文献】