橡胶树红根病菌响应己唑醇胁迫的蛋白质组学研究
发布时间：2020-08-17 08:56
【摘要】：本研究通过对对照组自然生长的橡胶树红根病病菌GP020菌株和进行低浓度己唑醇胁迫12小时处理后的菌丝,使用酚抽提法,提取蛋白,并通过FASS方法进行酶解及ITRAQ染料标记,之后进行Ph-RP液相分离及RPLC-MS液相色谱-质谱联用,并使用生物信息学软件及数据库,分析所得到的肽段信息,并通过Uniprot及RNA-Sequecing数据库进行检索,对蛋白质进行注释和分析。通过iTRAQ技术的筛选和鉴定,对蛋白质进行相对定量,共得到谱图147663张,通过proteinpilot软件进行分析后,Unique匹配到的谱图数量为49236张,共鉴定到31853个Unique肽段,3241个蛋白丰度差异倍数达到1.3倍以上,268个蛋白表达出现差异,通过KEGG信号通路分析,差异表达蛋白分布于146个信号通路中,其中上调表达蛋白121个,下调表达蛋白147个。以CK为对照组,显著富集的pathway通路分别是:能量代谢中的碳代谢、糖酵解/糖异生能力、二羧酸代谢、三羧酸循环,氨基酸生物合成和核糖体代谢。说明农药胁迫下橡胶树红根病菌发生了复杂的应激反应。信号转导途径中,HIF-1、RIG-I-like receptor、MAPK、FoxO及NOD-like receptor等5个信号通道中有5蛋白表达上调,与GO分析和COG分析一致。一个SGT1-like蛋白在受胁迫的橡胶树红根病病菌中表达明显上调1.62倍,与之贯穿的蛋白质组-转录组联合分析结果也印证了这一上调表达趋势,其上调表达推测是橡胶树红根病菌受到己唑醇胁迫后的耐药性应激反应,可能与橡胶树红根病菌对己唑醇的基础耐药性(basal fungicide tolerance)有关。
【学位授予单位】：海南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S763.7
【图文】：
图１邋ｉｔｒａｑ原理示意图逡逑Ｆｉｇ．邋１邋ｉｔｒａｑ邋Ｔｈｅｏｒｙ邋Ｓｋｅｔｃｈ邋Ｍａｐ逡逑图１邋（图片来源于网络ｈｔｔｐ：／／胃．ｆｉｔｇｅｎｅ．邋ｃｏｍ／）过程是ｉＴＲＡＱ定量蛋白质组逡逑学原理，该图显示了邋ｉＴＲＡＱ定量技术的基本原理及主要步骤，ｉＴＲＡＱ定量方法最多可逡逑Ｗ在一次串联质谱操作中同时比较八个样品中的蛋白的相对含量，主要步骤如图中所逡逑示，分别为蛋白提取、膜蛋白酶水解、Ｌ油ｅｌ标记、样品混合、化ｇｈ邋ｐＨ反相色谱预逡逑分离、液相串联质谱分析。在一级质谱时，平衡基团可Ｗ确保无论用哪种报告离子标逡逑记肤段，都显示为相同的质荷比值。在二级质谱时，平衡基团发生中性丢失，而报告逡逑离子的强度则可Ｗ反映r蓝蔚南喽苑岫戎怠Ｍ贾凶钕路轿徽牛停樱停悠淄迹嶙晡义献永胱又屎杀戎担葑拔胱忧慷取＃父霾噬灞硎荆椋裕遥粒咽约恋模钢直ǜ胬胱樱义掀涓叨确直鸫砹死叨蔚南喽院
本文编号：2795103
【学位授予单位】：海南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S763.7
【图文】：
图１邋ｉｔｒａｑ原理示意图逡逑Ｆｉｇ．邋１邋ｉｔｒａｑ邋Ｔｈｅｏｒｙ邋Ｓｋｅｔｃｈ邋Ｍａｐ逡逑图１邋（图片来源于网络ｈｔｔｐ：／／胃．ｆｉｔｇｅｎｅ．邋ｃｏｍ／）过程是ｉＴＲＡＱ定量蛋白质组逡逑学原理，该图显示了邋ｉＴＲＡＱ定量技术的基本原理及主要步骤，ｉＴＲＡＱ定量方法最多可逡逑Ｗ在一次串联质谱操作中同时比较八个样品中的蛋白的相对含量，主要步骤如图中所逡逑示，分别为蛋白提取、膜蛋白酶水解、Ｌ油ｅｌ标记、样品混合、化ｇｈ邋ｐＨ反相色谱预逡逑分离、液相串联质谱分析。在一级质谱时，平衡基团可Ｗ确保无论用哪种报告离子标逡逑记肤段，都显示为相同的质荷比值。在二级质谱时，平衡基团发生中性丢失，而报告逡逑离子的强度则可Ｗ反映r蓝蔚南喽苑岫戎怠Ｍ贾凶钕路轿徽牛停樱停悠淄迹嶙晡义献永胱又屎杀戎担葑拔胱忧慷取＃父霾噬灞硎荆椋裕遥粒咽约恋模钢直ǜ胬胱樱义掀涓叨确直鸫砹死叨蔚南喽院
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