桥山古侧柏群的遗传多样性分析及黄帝手植柏DNA指纹图谱的构建

发布时间：2020-11-14 22:09

　　 侧柏是我国重要的造林树种,具有水土保持、防风固沙、园林绿化等作用。黄帝陵所在的桥山古侧柏群体存在丰富的基因资源,探讨该古侧柏群体的遗传多样性,制定合适的基因资源保护策略,对于侧柏基因资源的保护和利用具有重要意义。黄帝手植柏位于黄帝陵轩辕庙的院内,相传它为轩辕黄帝亲手栽植,被认为是世界上最古老的侧柏,具有重要的科学和文化价值。但是,利用表型性状对黄帝手植柏的克隆植株进行鉴定较为困难。本文将利用SRAP分子标记技术对桥山的古侧柏群及黄帝手植柏进行分析,探讨该古侧柏群的遗传多样性,构建黄帝手植柏DNA指纹图谱,为黄帝陵古侧柏群基因资源保护与黄帝手植柏及其克隆植株的分子鉴定提供依据。主要研究结果如下:(1)22对引物组合共扩增出272个条带,其中多态性条带188个,多态性比率为69.12%;引物组合Me3Em15和Me4Em9的多态性比率高达100%,多态性比率最小的为引物组合Me4Em10,为52.94%;每个引物组合平均扩增出多态性条带8个。在相似系数为0.68处,可以将古侧柏分为5类,黄帝手植柏自成一类,第二类包括17株,第三类包括6株,第四类包括4株,第五类包括2株。(2)找到黄帝手植柏特异标记6个,分别为:Me4Em9-150、Me4Em9-1600、Me4Em9-1700、Me10Em4-80、Me10Em4-90、Me10Em4-120。利用这6个标记同时对黄帝手植柏进行鉴定,发生错误的概率为5.4×10~(-8)%,正确的概率为99.9999999%。说明这6个标记可以作为黄帝手植柏的DNA指纹图谱,对黄帝手植柏进行分子鉴定。
【学位单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：S718.5
【部分图文】：

图3-1 引物组合Me3Em4的扩增结果Figure 3-1 Fingerprint of primer combination Me3Em4注：泳道1为Marker，泳道2为黄帝手植柏，其它泳道为采自桥山的古侧柏。Note: Lane 1 is molecular weight marker. Lane 2 is DNA fingerprint of the old Chinese arborvitae plantedby Huang Di. The rest lanes are DNA fingerprints of old trees from the Qiao mountain.3.1.2 聚类分析利用 SRAP 数据计算了桥山古侧柏群体内各植株之间的相似系数（表 3-2），相似系数的范围为 0.48~0.85。图 3-2 是聚类分析的结果，在相似系数为 0.68 处，可以将古侧柏分为 5 类，黄帝手植柏自成一类，第二类包括 17 株，第三类包括 6 株

图3-2 古侧柏植株的聚类分析图Figure 3-2 Dendrogram showing genetic relationships among the old trees.注：编号1为黄帝手植柏，其它为采自桥山的古侧柏。Note: No. 1 is the old Chinese arborvitae planted by Huang Di. The rest are old trees from the Qiaomountain.3.2 黄帝手植柏 DNA 指纹图谱的构建利用筛选出的 22 对引物组合对采自桥山的 30 株古侧柏及黄帝手植柏进行了分析，找到黄帝手植柏特异标记 6 个，分别为：Me4Em9-150、Me4Em9-1600、Me4Em9-1700、Me10Em4-80、Me10Em4-90、Me10Em4-120（图 3-3、图 3-4）。14

图3-3 引物组合Me4Em9的扩增结果Figure 3-3 Fingerprint of primer combination Me4Em9注：泳道9为Marker，泳道10为黄帝手植柏，其它泳道为采自桥山的古侧柏。箭头所示为黄帝手植柏特异标记Me4Em9-150、Me4Em9-1600、 Me4Em9-1700。Note: Lane 9 is molecular weight marker. Lane 10 is DNA fingerprint of the old Chinese arborvitae plantedby Huang Di. The rest lanes are DNA fingerprints of old trees from the Qiao mountain. The arrows indicatethe rare DNA fragments of the old Chinese arborvitae planted by Huang Di (Me4Em9-150, Me4Em9-1600,Me4Em9-1700).图3-4 引物组合Me10Em4的扩增结果Figure 3-4 Fingerprint of primer combination Me10Em4注：泳道5为Marker，泳道6为黄帝手植柏，其它泳道为采自桥山的古侧柏。箭头所示为黄帝手植柏的特异标记Me10Em4-80、Me10Em4-90、Me10Em4-120。Note: Lane 5 is molecular weight marker. Lane 6 is DNA fingerprint of the old Chinese arborvitae plantedby Huang Di. The rest lanes are DNA fingerprints of old trees from the Qiao mountain. The arrows indicatethe rare DNA fragments of the old Chinese arborvitae planted by Huang Di (Me10Em4-80, Me10Em4-90,Me10Em4-120).
【参考文献】

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本文编号：2884002