基于DNA技术识别樟科木材
发布时间：2021-01-17 23:02
樟科Lauraceae木材解剖结构相似,传统形态解剖学方法很难做出准确鉴定,基于分子标记的树种鉴定技术准确而且高效。本研究通过增加木粉质量与DNA缓冲液体积比、温浴时间等改良木质部基因组DNA提取;用改良CTAB-SDS法、CTAB法和试剂盒法提取樟科木质部DNA,筛选了木质部DNA提取方法,初步建立楠属木材DNA提取技术体系;利用ISSR和RAPD技术对樟科16种192株木质部DNA进行扩增,构建多态性鉴别图谱,比较两分子标记差别;DNA条形码对叶绿体基因psb A-trnH间隔区DNA克隆测序,通过序列差异区别16树种,构建系统进化树。具体结果如下:（1）通过增加木粉质量与DNA缓冲液体积比、温浴时间,改变缓冲液成分等参数,将DNA样品OD260/280值从1.1-1.5提升到1.8-2.0,提高了DNA纯度。（2）3种方法提取的DNA质量差别明显,改良CTAB-SDS法最适合提取楠属木质部DNA。DNA浓度:改良CTAB-SDS法最高、试剂盒法最低;DNA纯度:改良CTAB-SDS法和CTAB法提取的DNA样品纯度高,OD260/值为1.7-2.0,满足扩增要求,试剂盒法提取的D...
【文章来源】：南京林业大学江苏省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2-1台式冷冻离心机
3、梯度 PCR 扩增仪（9700，图 2-3）：设定 PCR 的程序及其扩增；4、琼脂糖水平电泳仪（图 2-4）及全自动凝胶成像仪（Gel X 1650，图 2-5）：检测分析 PCR 扩增结果及观察、拍照、保存；5、电热恒温水槽及震荡型恒温金属浴：特定温度下温浴试剂；6、磁力搅拌器（Wise Stir）及涡旋机：用于混匀试剂；7、电子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低温冰箱（Kaltis）：贮藏实验材料和试剂；9、高温高压灭菌锅（Hirayama）、制冰机（Sanyo）、微波炉（Midea）、恒温培养箱（Binder）、摇床（IKAKS 4000）、移液枪（Eppendorf）及枪头、烘箱、研钵及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
3、梯度 PCR 扩增仪（9700，图 2-3）：设定 PCR 的程序及其扩增；4、琼脂糖水平电泳仪（图 2-4）及全自动凝胶成像仪（Gel X 1650，图 2-5）：检测分析 PCR 扩增结果及观察、拍照、保存；5、电热恒温水槽及震荡型恒温金属浴：特定温度下温浴试剂；6、磁力搅拌器（Wise Stir）及涡旋机：用于混匀试剂；7、电子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低温冰箱（Kaltis）：贮藏实验材料和试剂；9、高温高压灭菌锅（Hirayama）、制冰机（Sanyo）、微波炉（Midea）、恒温培养箱（Binder）、摇床（IKAKS 4000）、移液枪（Eppendorf）及枪头、烘箱、研钵及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
【参考文献】：
期刊论文
[1]3种楠木DNA提取及其ISSR标记鉴别[J]. 王英,骆嘉言,钟文翰,石江涛,樊帅. 四川农业大学学报. 2016(04)
[2]太湖洞庭地区红桔种质资源基因组提取及ISSR亲缘关系分析[J]. 朱沛煌,周坤杰,郭天玮,储春荣,季孔庶. 林业科技开发. 2015(05)
[3]不同产地猫豆遗传多样性的ISSR分析[J]. 邱亚玲,秦民坚,戴轶群,及佳,谢国勇,吴刚,朱艳. 中国实验方剂学杂志. 2015(06)
[4]华山松针叶基因组DNA不同提取方法比较[J]. 谢冬梅,陈国明,何德,李翠新. 广西林业科学. 2014(04)
[5]玉米种质材料遗传多样性的ISSR分析[J]. 祁丽婷,李中青,赵晋峰,李齐霞,李颜芳,王瑞,孙万荣,王敏,王枫叶. 安徽农业科学. 2014(34)
[6]降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定[J]. 余敏,张浩,刘盛全,金青,李大周. 林产化学与工业. 2014(05)
[7]28个果桑品种（系）的遗传多样性ISSR分析[J]. 黄盖群,佟万红,危玲,殷浩,何宁佳,刘刚,郑继川,姚永权,李永远. 西南农业学报. 2014(05)
[8]滇西南地区樟科17种木材解剖特征研究[J]. 孙瑾,王晓静,王飞,徐恩光,高振忠. 华南农业大学学报. 2014(05)
[9]美洲黑杨新无性系的ISSR鉴别及SCAR标记转化[J]. 李薇,王永进,樊军锋. 西北林学院学报. 2014(04)
[10]25份槭属优良种质资源亲缘关系的ISSR分析[J]. 林乐静,林立,祝志勇. 广西植物. 2015(01)
博士论文
[1]基于DNA条形码的濒危木材识别技术研究[D]. 焦立超.中国林业科学研究院 2015
硕士论文
[1]浙江楠EST-SSR标记开发及天然种群遗传多样性研究[D]. 丁亚军.浙江农林大学 2014
[2]水杉木材DNA提取及DNA条形码分析[D]. 杨路路.湖北大学 2011
[3]樟科植物DNA Barcode及香樟系统地理学的初步研究[D]. 高大伟.华东师范大学 2008
本文编号：2983758
【文章来源】：南京林业大学江苏省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2-1台式冷冻离心机
3、梯度 PCR 扩增仪（9700，图 2-3）：设定 PCR 的程序及其扩增；4、琼脂糖水平电泳仪（图 2-4）及全自动凝胶成像仪（Gel X 1650，图 2-5）：检测分析 PCR 扩增结果及观察、拍照、保存；5、电热恒温水槽及震荡型恒温金属浴：特定温度下温浴试剂；6、磁力搅拌器（Wise Stir）及涡旋机：用于混匀试剂；7、电子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低温冰箱（Kaltis）：贮藏实验材料和试剂；9、高温高压灭菌锅（Hirayama）、制冰机（Sanyo）、微波炉（Midea）、恒温培养箱（Binder）、摇床（IKAKS 4000）、移液枪（Eppendorf）及枪头、烘箱、研钵及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
3、梯度 PCR 扩增仪（9700，图 2-3）：设定 PCR 的程序及其扩增；4、琼脂糖水平电泳仪（图 2-4）及全自动凝胶成像仪（Gel X 1650，图 2-5）：检测分析 PCR 扩增结果及观察、拍照、保存；5、电热恒温水槽及震荡型恒温金属浴：特定温度下温浴试剂；6、磁力搅拌器（Wise Stir）及涡旋机：用于混匀试剂；7、电子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低温冰箱（Kaltis）：贮藏实验材料和试剂；9、高温高压灭菌锅（Hirayama）、制冰机（Sanyo）、微波炉（Midea）、恒温培养箱（Binder）、摇床（IKAKS 4000）、移液枪（Eppendorf）及枪头、烘箱、研钵及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
【参考文献】：
期刊论文
[1]3种楠木DNA提取及其ISSR标记鉴别[J]. 王英,骆嘉言,钟文翰,石江涛,樊帅. 四川农业大学学报. 2016(04)
[2]太湖洞庭地区红桔种质资源基因组提取及ISSR亲缘关系分析[J]. 朱沛煌,周坤杰,郭天玮,储春荣,季孔庶. 林业科技开发. 2015(05)
[3]不同产地猫豆遗传多样性的ISSR分析[J]. 邱亚玲,秦民坚,戴轶群,及佳,谢国勇,吴刚,朱艳. 中国实验方剂学杂志. 2015(06)
[4]华山松针叶基因组DNA不同提取方法比较[J]. 谢冬梅,陈国明,何德,李翠新. 广西林业科学. 2014(04)
[5]玉米种质材料遗传多样性的ISSR分析[J]. 祁丽婷,李中青,赵晋峰,李齐霞,李颜芳,王瑞,孙万荣,王敏,王枫叶. 安徽农业科学. 2014(34)
[6]降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定[J]. 余敏,张浩,刘盛全,金青,李大周. 林产化学与工业. 2014(05)
[7]28个果桑品种（系）的遗传多样性ISSR分析[J]. 黄盖群,佟万红,危玲,殷浩,何宁佳,刘刚,郑继川,姚永权,李永远. 西南农业学报. 2014(05)
[8]滇西南地区樟科17种木材解剖特征研究[J]. 孙瑾,王晓静,王飞,徐恩光,高振忠. 华南农业大学学报. 2014(05)
[9]美洲黑杨新无性系的ISSR鉴别及SCAR标记转化[J]. 李薇,王永进,樊军锋. 西北林学院学报. 2014(04)
[10]25份槭属优良种质资源亲缘关系的ISSR分析[J]. 林乐静,林立,祝志勇. 广西植物. 2015(01)
博士论文
[1]基于DNA条形码的濒危木材识别技术研究[D]. 焦立超.中国林业科学研究院 2015
硕士论文
[1]浙江楠EST-SSR标记开发及天然种群遗传多样性研究[D]. 丁亚军.浙江农林大学 2014
[2]水杉木材DNA提取及DNA条形码分析[D]. 杨路路.湖北大学 2011
[3]樟科植物DNA Barcode及香樟系统地理学的初步研究[D]. 高大伟.华东师范大学 2008
本文编号：2983758
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