华山松及其近缘种的群体遗传学和物种形成研究
发布时间:2021-05-14 00:58
物种群体遗传变异的地理分布模式和群体分化历史研究,可以解析过去山脉隆升引起的地理隔离和冰川发育所引起的气候动荡等地质、气候历史事件对物种形成具体进化过程的影响。华山松是我国中西部地区分布的特有松属植物,隶属于松属(Pinus)单维管束松亚属(Subgen.Strobus)五针松组(Sect.Cembra),是我国主要的造林树种和森林更新树种。华山松、红松、偃松和乔松同属五针松组的四个近缘物种,但它们在生存环境、自然地理分布区上呈现出明显的隔离,在形态学、木材解剖以及细胞学方面也各有其特征。本文通过采用不同进化尺度的基因标记研究了华山松的群体遗传多样性和遗传结构,评估了群体间的基因流,进而探讨了导致华山松种内分化的地理和环境隔离因素。同时,还采用六个核基因座位研究了华山松及其近缘种红松、乔松和偃松的核苷酸多态性和物种形成历史。主要结果如下:采集华山松自然地理分布区域内52个群体共696个个体,利用12对SSR标记引物进行PCR扩增,并采用毛细管电泳进行基因分型,对所得数据进行统计分析。结果发现,华山松物种具有较高水平的遗传多样性:He=0.6045,Ho=0.4390,I=1.1224,...
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:91 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
1.1 群体遗传学
1.1.1 群体遗传学概述
1.1.2 群体遗传学主要研究内容
1.1.3 群体遗传学研究中用到的分子标记
1.1.4 裸子植物群体遗传学研究进展
1.2 物种形成
1.2.1 物种形成概述
1.2.2 裸子植物种内分化和物种形成研究进展
1.3 华山松及其近缘种的研究进展
1.3.1 华山松的研究概况
1.3.2 华山松及其近缘种红松、偃松和乔松研究概述
1.4 本研究的目的和意义
第二章 华山松的群体结构和种内分化历史
2.1 实验材料
2.2 基于SSR标记探讨华山松群体结构
2.2.1 实验方法
2.2.2 实验结果
2.3 基于cpDNA和单拷贝核基因探讨华山松种内分化
2.3.1 材料和方法
2.3.2 数据分析
2.3.3 实验结果
2.4 结论和讨论
2.4.1 华山松自然群体的遗传多样性
2.4.2 华山松种内遗传分化和群体间基因流
2.4.3 华山松群体间遗传关系
第三章 华山松及其近缘种的物种分化
3.1 材料和方法
3.1.1 样品采集
3.1.2 DNA提取、PCR扩增和测序
3.1.3 数据分析
3.2 研究结果
3.2.1 核苷酸多态性
3.2.2 中性检验
3.2.3 群体遗传结构
3.2.4 基因谱系结构
3.2.5 群动态历史和种间分化
3.3 讨论
3.3.1 核苷酸多态性
3.3.2 群体遗传结构和物种分化
结论和展望
参考文献
攻读硕士学位期间取得的科研成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]A hybrid swarm population of Pinus densiflora × P. sylvestris inferred from sequence analysis of chloroplast DNA and morphological characters[J]. Young Hee Joung,Jerry L. Hill,Jung Oh Hyun,Ding Mu,Juchun Luo,Do Hyung Lee,Takayuki Kawahara,Jeung Keun Suh,Mark S. Roh. Journal of Forestry Research. 2013(01)
[2]啮齿动物和鸟类对红松种子的消耗[J]. 姚晓琳,朴正吉,李步杭,张健,王绪高,叶吉,郝占庆. 应用生态学报. 2008(08)
[3]五针松组起源中国[J]. 彭镇华. 安徽农业大学学报. 1999(01)
硕士论文
[1]松属五针松组物种的分子鉴定研究[D]. 杨辰.兰州大学 2014
本文编号:3184961
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:91 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
1.1 群体遗传学
1.1.1 群体遗传学概述
1.1.2 群体遗传学主要研究内容
1.1.3 群体遗传学研究中用到的分子标记
1.1.4 裸子植物群体遗传学研究进展
1.2 物种形成
1.2.1 物种形成概述
1.2.2 裸子植物种内分化和物种形成研究进展
1.3 华山松及其近缘种的研究进展
1.3.1 华山松的研究概况
1.3.2 华山松及其近缘种红松、偃松和乔松研究概述
1.4 本研究的目的和意义
第二章 华山松的群体结构和种内分化历史
2.1 实验材料
2.2 基于SSR标记探讨华山松群体结构
2.2.1 实验方法
2.2.2 实验结果
2.3 基于cpDNA和单拷贝核基因探讨华山松种内分化
2.3.1 材料和方法
2.3.2 数据分析
2.3.3 实验结果
2.4 结论和讨论
2.4.1 华山松自然群体的遗传多样性
2.4.2 华山松种内遗传分化和群体间基因流
2.4.3 华山松群体间遗传关系
第三章 华山松及其近缘种的物种分化
3.1 材料和方法
3.1.1 样品采集
3.1.2 DNA提取、PCR扩增和测序
3.1.3 数据分析
3.2 研究结果
3.2.1 核苷酸多态性
3.2.2 中性检验
3.2.3 群体遗传结构
3.2.4 基因谱系结构
3.2.5 群动态历史和种间分化
3.3 讨论
3.3.1 核苷酸多态性
3.3.2 群体遗传结构和物种分化
结论和展望
参考文献
攻读硕士学位期间取得的科研成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]A hybrid swarm population of Pinus densiflora × P. sylvestris inferred from sequence analysis of chloroplast DNA and morphological characters[J]. Young Hee Joung,Jerry L. Hill,Jung Oh Hyun,Ding Mu,Juchun Luo,Do Hyung Lee,Takayuki Kawahara,Jeung Keun Suh,Mark S. Roh. Journal of Forestry Research. 2013(01)
[2]啮齿动物和鸟类对红松种子的消耗[J]. 姚晓琳,朴正吉,李步杭,张健,王绪高,叶吉,郝占庆. 应用生态学报. 2008(08)
[3]五针松组起源中国[J]. 彭镇华. 安徽农业大学学报. 1999(01)
硕士论文
[1]松属五针松组物种的分子鉴定研究[D]. 杨辰.兰州大学 2014
本文编号:3184961
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