中国杨属物种DNA条形码及分子系统学初步研究
发布时间：2021-06-28 06:19
杨属物种由于严格的异交性质和广泛的种间杂交使得根据形态特征很难区分。DNA条形码是一种通过标准的DNA片段来实现物种快速鉴定的方法,因此杨属物种的DNA条形码研究有利于天然种质资源的鉴别和保护。本研究对中国杨属17个代表种69个样本选取核基因组片段DSH10、DSH28和叶绿体片段matK、ndhF、ycf1、atpH-atpI进行DNA条形码研究,结果表明单拷贝核基因DSH10和DSH28和ITS的物种区分能力相当,都要明显优于叶绿体片段,无论是单片段还是多片段组合,其中三个核基因组片段组合的物种分辨率最高（47.06%）,能够区分出胡杨（Populus euphrantica）、毛白杨（P. tomentosa）、辽杨（P. maximowiczii）、山杨（P. davidiana）、圆叶杨（P. rotundifolia）、梧桐杨（P.pseudomaximowiczii）、大叶杨（P. lasiocarpa）和三脉青杨（P. trinervis）,表明核基因组片段更适合杨属物种的鉴别。最高物种分辨率的片段组合仍然不能区分一半的物种,因此需从技术方法上进行改进,本研究推荐引入特...
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1. 引言
1.1 DNA条形码概述
1.1.1 DNA条形码研究历史
1.1.2 DNA条形码技术规范
1.1.3 影响植物DNA条形码物种分辨率的因素
1.1.4 植物DNA条形码的展望
1.2 研究对象概述
1.2.1 中国杨属植物概述
1.2.2 杨属的分子系统学研究进展
1.2.3 研究目的和意义
2. 中国杨属部分物种的DNA条形码研究
2.1 材料与方法
2.1.1 材料
2.1.2 实验方法
2.2 结果
2.2.1 序列分析
2.2.2 DNABARCODING GAP分析
2.2.3 物种鉴定成功率分析
2.3 讨论
2.3.1 核基因片段比叶绿体基因片段更适合杨属DNA条形码研究
2.3.2 不同分析方法的鉴定效果比较
2.3.3 提高杨属DNA条形码鉴定效果的探讨
3. 中国杨属物种的分子系统学研究
3.1 材料与方法
3.1.1 材料与引物
3.1.2 实验方法
3.2 结果
3.3 讨论
4. 结论
参考文献
个人简介
导师简介
获得成果目录清单
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于叶绿体片段序列的杨属系统发育关系分析[J]. 员涛,李佳蔓,周安佩,颜璐茜,纵丹,李旦,何承忠. 植物生理学报. 2015(08)
[2]植物DNA条形码、物种形成和分类学[J]. 刘建全. 生物多样性. 2015(03)
[3]利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征[J]. 雷淑芸,张发起,Khan Gulzar,王久利,刘海瑞,陈世龙. 林业科学研究. 2015(01)
[4]“中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台”简介[J]. 李长昊,程涛,董文攀,周世良. 生物多样性. 2014(01)
[5]生命条形码与生命之树[J]. 陈之端,李德铢. 植物分类与资源学报. 2013(06)
[6]结合叶绿体和核DNA序列变异可提高云杉属物种的分子鉴别率[J]. 邹嘉宾,王茜,李丽丽,刘建全. 植物分类与资源学报. 2013(03)
[7]中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[J]. 陈士林,姚辉,韩建萍,辛天怡,庞晓慧,石林春,罗焜,宋经元,侯典云,石上梅,钱忠直. 中国中药杂志. 2013(02)
[8]新一代植物志:iFlora[J]. 李德铢,王雨华,伊廷双,王红,高连明,杨俊波. 植物分类与资源学报. 2012(06)
[9]关于植物DNA条形码研究技术规范[J]. 高连明,刘杰,蔡杰,杨俊波,张挺,李德铢. 植物分类与资源学报. 2012(06)
[10]Comparison of phylobetadiversity indices based on community data from Gutianshan forest plot[J]. FENG Gang 1,2,ZHANG JinLong 1,2,PEI NanCai 3,RAO MiDe 4,MI XiangCheng 1,REN HaiBao 1 & MA KePing 1 1 State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093,China;2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China;3 Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry,Guangzhou 510520,China;4 College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua 321004,China. Chinese Science Bulletin. 2012(06)
博士论文
[1]杨属分子系统发育及三个山杨物种的生物地理学研究[D]. 杜淑辉.中国林业科学研究院 2014
硕士论文
[1]基于DNA条形码的系统发生树构建[D]. 莫瑞峰.吉林大学 2014
[2]基于基因组条形码可视化的分枝杆菌的分子进化的初步研究[D]. 张莹.吉林大学 2013
[3]基于ISSR与ITS序列分析四川乡土杨属植物的亲缘关系[D]. 王明福.四川农业大学 2012
[4]DNA条形码在天南星科芋族植物研究中的应用[D]. 刘宇婧.中央民族大学 2011
[5]四川乡土杨属植物的系统发育与亲缘关系研究[D]. 丁云海.四川农业大学 2010
[6]姜科药用植物DNA条形码鉴定研究[D]. 石林春.西北农林科技大学 2009
本文编号：3253793
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1. 引言
1.1 DNA条形码概述
1.1.1 DNA条形码研究历史
1.1.2 DNA条形码技术规范
1.1.3 影响植物DNA条形码物种分辨率的因素
1.1.4 植物DNA条形码的展望
1.2 研究对象概述
1.2.1 中国杨属植物概述
1.2.2 杨属的分子系统学研究进展
1.2.3 研究目的和意义
2. 中国杨属部分物种的DNA条形码研究
2.1 材料与方法
2.1.1 材料
2.1.2 实验方法
2.2 结果
2.2.1 序列分析
2.2.2 DNABARCODING GAP分析
2.2.3 物种鉴定成功率分析
2.3 讨论
2.3.1 核基因片段比叶绿体基因片段更适合杨属DNA条形码研究
2.3.2 不同分析方法的鉴定效果比较
2.3.3 提高杨属DNA条形码鉴定效果的探讨
3. 中国杨属物种的分子系统学研究
3.1 材料与方法
3.1.1 材料与引物
3.1.2 实验方法
3.2 结果
3.3 讨论
4. 结论
参考文献
个人简介
导师简介
获得成果目录清单
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于叶绿体片段序列的杨属系统发育关系分析[J]. 员涛,李佳蔓,周安佩,颜璐茜,纵丹,李旦,何承忠. 植物生理学报. 2015(08)
[2]植物DNA条形码、物种形成和分类学[J]. 刘建全. 生物多样性. 2015(03)
[3]利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征[J]. 雷淑芸,张发起,Khan Gulzar,王久利,刘海瑞,陈世龙. 林业科学研究. 2015(01)
[4]“中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台”简介[J]. 李长昊,程涛,董文攀,周世良. 生物多样性. 2014(01)
[5]生命条形码与生命之树[J]. 陈之端,李德铢. 植物分类与资源学报. 2013(06)
[6]结合叶绿体和核DNA序列变异可提高云杉属物种的分子鉴别率[J]. 邹嘉宾,王茜,李丽丽,刘建全. 植物分类与资源学报. 2013(03)
[7]中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[J]. 陈士林,姚辉,韩建萍,辛天怡,庞晓慧,石林春,罗焜,宋经元,侯典云,石上梅,钱忠直. 中国中药杂志. 2013(02)
[8]新一代植物志:iFlora[J]. 李德铢,王雨华,伊廷双,王红,高连明,杨俊波. 植物分类与资源学报. 2012(06)
[9]关于植物DNA条形码研究技术规范[J]. 高连明,刘杰,蔡杰,杨俊波,张挺,李德铢. 植物分类与资源学报. 2012(06)
[10]Comparison of phylobetadiversity indices based on community data from Gutianshan forest plot[J]. FENG Gang 1,2,ZHANG JinLong 1,2,PEI NanCai 3,RAO MiDe 4,MI XiangCheng 1,REN HaiBao 1 & MA KePing 1 1 State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093,China;2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China;3 Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry,Guangzhou 510520,China;4 College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua 321004,China. Chinese Science Bulletin. 2012(06)
博士论文
[1]杨属分子系统发育及三个山杨物种的生物地理学研究[D]. 杜淑辉.中国林业科学研究院 2014
硕士论文
[1]基于DNA条形码的系统发生树构建[D]. 莫瑞峰.吉林大学 2014
[2]基于基因组条形码可视化的分枝杆菌的分子进化的初步研究[D]. 张莹.吉林大学 2013
[3]基于ISSR与ITS序列分析四川乡土杨属植物的亲缘关系[D]. 王明福.四川农业大学 2012
[4]DNA条形码在天南星科芋族植物研究中的应用[D]. 刘宇婧.中央民族大学 2011
[5]四川乡土杨属植物的系统发育与亲缘关系研究[D]. 丁云海.四川农业大学 2010
[6]姜科药用植物DNA条形码鉴定研究[D]. 石林春.西北农林科技大学 2009
本文编号：3253793
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