中国瘿蜂科部分属种DNA条形码及系统发育研究
发布时间：2021-07-27 00:14
虫瘿是自然界极常见的生物现象,是植物与昆虫互作的奇特产物,而瘿蜂是致瘿昆虫的主要类群之一。瘿蜂栖息于完全封闭的虫瘿内,高效截获寄主植物的营养而严重危害植物。由于其高度隐蔽导致防治难度大,生产实践急需建立准确而高效的瘿蜂昆虫鉴定体系。DNA条形码技术作为新兴的物种鉴定技术,受到广泛关注。本研究首次将DNA条形码技术应用于我国瘿蜂科昆虫,基于COⅠ、COⅡ、28SrDNA基因序列以及联合数据集COⅠ+COⅡ+28SrDNA,对4属22种瘿蜂科昆虫进行碱基成分、种内及种间遗传距离、系统发育检验,运用邻接法、最大似然法、最小进化法等方法构建了瘿蜂科昆虫系统发育树。通过分析得出如下结果:1、瘿蜂科昆虫的碱基分析结果显示,COⅠ、COⅡ序列以及联合数据集A+T含量均显著高于G+C含量,而28SrDNA基因序列G+C含量则高于A+T含量;COI基因序列变异位点数占总位点数的比列最高,其次为COⅡ和联合数据集,最后为28SrDNA,说明COⅠ基因序列对近缘种的区分优势更明显;碱基替换分析中,COⅠ基因序列转换与颠换的比值为0.69,COⅡ基因序列转换与颠换的比值为0.64,表现出线粒体基因高突变性的特...
【文章来源】：浙江农林大学浙江省
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
COⅠ基因序列的PCR扩增结果
图 3.1 COⅠ基因序列的 PCR 扩增结果Fig 3.1 The PCR amplication results of the COⅠgene sequence6(Synergus): S.ishikarii; S.symbioticus; S.gifuensis; S.belizinellus; S.snecrus): S.globosus; S.shanzhukui; S.shirakashii; S.sp.1; S. nantoui; S. gilvusricus): A.mukaigawae; A. kashiwaphilus; A. flavus;
图 3.3 28SrDNA 基因序列的 PCR 扩增结果Fig 3.3 The PCR amplication results of the 28SrDNA gene sequence(Synergus): S.ishikarii; S.symbioticus; S.gifuensis; S.belizinellus; Secrus): S.globosus; S.shanzhukui; S.shirakashii; S.sp.1; S. nantoui; S. gilvucus): A.mukaigawae; A. kashiwaphilus; A. flavus;因序列的分析成及位点MEGA5.1 软件，将所得序列以及 GenBank 下载序列进行同源性因序列组成进行统计分析，所有序列共包含 162 个保守位点（C3 个变异位点（V：Variable sites），294 个简约信息位点（Pin sites），198 个单核苷酸多态性位点（S：Singleton sites）。瘿蜂的变异位点，在近缘种的区分上具有明显的优势。的 COⅠ序列进行碱基组成分析，结果显示，四种碱基的平均），T（41.8%），C（14.2%），G（12.2%），AT 含量（73.6%）明4%），具有明显的 AT 偏向性，与昆虫线粒体基因具有高 AT 含码子第一位点 A+T 含量为 89.3%，第二位点 A+T 含量为 66.6
【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA条形码技术在昆虫学中的应用[J]. 赵广宇,李虎,杨海林,彩万志. 植物保护学报. 2014(02)
[2]DNA条形码在昆虫分类中的应用[J]. 宋南,刘杰,彩万志,赵忠懿. 四川动物. 2013(03)
[3]DNA条形码在膜翅目昆虫中的应用分析[J]. 周青松,张同心,于芳,罗阿蓉,牛泽清,朱朝东,张彦周. 应用昆虫学报. 2013(01)
[4]基于线粒体COⅠ基因片段的麻蝇属（双翅目:麻蝇科）部分种类DNA分类研究[J]. 张明,张东. 应用昆虫学报. 2013(01)
[5]虫瘿多样性及其与寄主植物和环境间关系[J]. 郭瑞,王义平,吴鸿. 环境昆虫学报. 2012(03)
[6]唾液成分在刺吸式昆虫与植物关系中的作用[J]. 严盈,刘万学,万方浩. 昆虫学报. 2008(05)
[7]DNA条形编码在蚜虫类昆虫中的应用[J]. 王剑峰,乔格侠. 动物分类学报. 2007(01)
[8]线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究[J]. 王备新,杨莲芳. 昆虫知识. 2002(02)
[9]线粒体DNA用作分子标记的可靠性和研究前景[J]. 牛屹东,李明,魏辅文,冯祚建. 遗传. 2001(06)
[10]分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J]. 成新跃,周红章,张广学. 动物分类学报. 2000(02)
博士论文
[1]赤眼蜂分子鉴定及其种群分化研究[D]. 付海滨.沈阳农业大学 2006
硕士论文
[1]中国木蠹蛾科14种昆虫的DNA条形码研究[D]. 李婧.北京林业大学 2013
[2]中国瘿蜂科昆虫系统分类研究[D]. 郭瑞.浙江农林大学 2012
[3]基于COI和28S rDNA的叶蜂科昆虫分子系统研究[D]. 刘艳霞.中南林业科技大学 2012
[4]DNA条形码技术在主要实蝇类害虫识别中的应用[D]. 刘慎思.西南大学 2012
[5]不同寄主植物栗瘿蜂mtDNA COⅠ和COⅡ基因部分序列及其系统进化关系分析[D]. 陆鹏飞.中南林业科技大学 2011
本文编号：3304661
【文章来源】：浙江农林大学浙江省
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
COⅠ基因序列的PCR扩增结果
图 3.1 COⅠ基因序列的 PCR 扩增结果Fig 3.1 The PCR amplication results of the COⅠgene sequence6(Synergus): S.ishikarii; S.symbioticus; S.gifuensis; S.belizinellus; S.snecrus): S.globosus; S.shanzhukui; S.shirakashii; S.sp.1; S. nantoui; S. gilvusricus): A.mukaigawae; A. kashiwaphilus; A. flavus;
图 3.3 28SrDNA 基因序列的 PCR 扩增结果Fig 3.3 The PCR amplication results of the 28SrDNA gene sequence(Synergus): S.ishikarii; S.symbioticus; S.gifuensis; S.belizinellus; Secrus): S.globosus; S.shanzhukui; S.shirakashii; S.sp.1; S. nantoui; S. gilvucus): A.mukaigawae; A. kashiwaphilus; A. flavus;因序列的分析成及位点MEGA5.1 软件，将所得序列以及 GenBank 下载序列进行同源性因序列组成进行统计分析，所有序列共包含 162 个保守位点（C3 个变异位点（V：Variable sites），294 个简约信息位点（Pin sites），198 个单核苷酸多态性位点（S：Singleton sites）。瘿蜂的变异位点，在近缘种的区分上具有明显的优势。的 COⅠ序列进行碱基组成分析，结果显示，四种碱基的平均），T（41.8%），C（14.2%），G（12.2%），AT 含量（73.6%）明4%），具有明显的 AT 偏向性，与昆虫线粒体基因具有高 AT 含码子第一位点 A+T 含量为 89.3%，第二位点 A+T 含量为 66.6
【参考文献】：
期刊论文
[1]DNA条形码技术在昆虫学中的应用[J]. 赵广宇,李虎,杨海林,彩万志. 植物保护学报. 2014(02)
[2]DNA条形码在昆虫分类中的应用[J]. 宋南,刘杰,彩万志,赵忠懿. 四川动物. 2013(03)
[3]DNA条形码在膜翅目昆虫中的应用分析[J]. 周青松,张同心,于芳,罗阿蓉,牛泽清,朱朝东,张彦周. 应用昆虫学报. 2013(01)
[4]基于线粒体COⅠ基因片段的麻蝇属（双翅目:麻蝇科）部分种类DNA分类研究[J]. 张明,张东. 应用昆虫学报. 2013(01)
[5]虫瘿多样性及其与寄主植物和环境间关系[J]. 郭瑞,王义平,吴鸿. 环境昆虫学报. 2012(03)
[6]唾液成分在刺吸式昆虫与植物关系中的作用[J]. 严盈,刘万学,万方浩. 昆虫学报. 2008(05)
[7]DNA条形编码在蚜虫类昆虫中的应用[J]. 王剑峰,乔格侠. 动物分类学报. 2007(01)
[8]线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究[J]. 王备新,杨莲芳. 昆虫知识. 2002(02)
[9]线粒体DNA用作分子标记的可靠性和研究前景[J]. 牛屹东,李明,魏辅文,冯祚建. 遗传. 2001(06)
[10]分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J]. 成新跃,周红章,张广学. 动物分类学报. 2000(02)
博士论文
[1]赤眼蜂分子鉴定及其种群分化研究[D]. 付海滨.沈阳农业大学 2006
硕士论文
[1]中国木蠹蛾科14种昆虫的DNA条形码研究[D]. 李婧.北京林业大学 2013
[2]中国瘿蜂科昆虫系统分类研究[D]. 郭瑞.浙江农林大学 2012
[3]基于COI和28S rDNA的叶蜂科昆虫分子系统研究[D]. 刘艳霞.中南林业科技大学 2012
[4]DNA条形码技术在主要实蝇类害虫识别中的应用[D]. 刘慎思.西南大学 2012
[5]不同寄主植物栗瘿蜂mtDNA COⅠ和COⅡ基因部分序列及其系统进化关系分析[D]. 陆鹏飞.中南林业科技大学 2011
本文编号：3304661
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