尖孢镰刀菌侵染后三年桐、千年桐根部比较转录组及Vf/VmLRR-RLKs初步分析
发布时间：2021-11-05 12:38
油桐（Vernicia fordii）是原产中国的世界著名工业油料树种,由其种子提炼而得的桐油是一种优质干性油,广泛用于工、农、渔、军事及医药等领域,同时因其清洁、安全、可再生等特点可作为重要的生物柴油原料。1939年以来,油桐枯萎病的爆发使大片油桐林被毁,严重制约了油桐的种植及产业发展,且该病在2007年卷土重来,再次让我国油桐产业蒙受损失。油桐枯萎病发病历时长、分布广、危害重、损失大,多年来难以从根本上进行有效防治,从分子水平对油桐枯萎病抗性相关基因的挖掘有助于对油桐抗枯萎病机理进行解析。油桐枯萎病主要侵害三年桐,而同属的千年桐具有抗枯萎病能力。本文将油桐枯萎病病原菌[尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）]侵染感病三年桐和抗病千年桐,对侵染前后不同时期的根部组织进行RNA-seq测序,分析两个物种响应油桐枯萎病的基因表达模式及差异,发现富亮氨酸重复类受体蛋白（Leucine-rich repeat receptor-like protein,LRR-RLK）基因家族在抗病千年桐中作为中心基因参与千年桐对枯萎病的应答。我们对两个树种的LRR-RLK基因家族着重进行了比较...
【文章来源】：中国林业科学研究院北京市
【文章页数】：129 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
研究的技术路线
图 2-1 三年桐 RNA-seq 结果 Transcripts 长度分布统计Fig.2-1 Length distribution of transcripts of RNA-seq of V.fordii
图 2-1 三年桐 RNA-seq 结果 Transcripts 长度分布统计Fig.2-1 Length distribution of transcripts of RNA-seq of V.fordii
【参考文献】：
期刊论文
[1]三年桐、千年桐感染枯萎病病原菌后的生理反应[J]. 杨素素,高暝,朱慧萍,刘英冠,汪阳东,陈益存. 林业科学研究. 2014(06)
[2]植物与尖孢镰刀菌的互作机制研究现状[J]. 梁丽琴,李健强,杨宇红,凌键,谢丙炎. 中国农学通报. 2014(21)
[3]直系同源基因的识别方法与数据库[J]. 杨婧,黄原,汪晓阳. 生命科学研究. 2013(03)
[4]基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析[J]. 曾地刚,陈秀荔,谢达祥,赵永贞,杨春玲,马宁,李咏梅,陈晓汉. 基因组学与应用生物学. 2013(03)
[5]参与植物防御反应的LRR型蛋白结构与功能[J]. 张盈玉,马荣才. 中国农业科技导报. 2009(03)
[6]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong. Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)
[7]不同南瓜砧木品种对网纹甜瓜生长发育的影响[J]. 陈幼源,陈绯翔. 上海农业学报. 2002(04)
[8]植物防御系统中抗病相关基因的研究进展[J]. 万里红,周奕华,陈正华. 遗传. 2002(04)
[9]AM真菌和镰刀菌对西瓜根系几种酶活性的影响[J]. 李敏,刘润进,赵洪海. 菌物系统. 2001(04)
[10]植株调整对无土栽培网纹甜瓜不同品种产量和品质的影响[J]. 陈幼源. 上海农业学报. 2000(02)
博士论文
[1]达尔文氏棉旱胁迫转录组测序、EST-SSR开发及高密度遗传图谱构建[D]. 陈浩东.中国农业科学院 2013
[2]热胁迫下丹参次生代谢比较转录组学研究[D]. 李东.四川农业大学 2011
硕士论文
[1]基于RNA-Seq技术的国产沉香转录组测序及数字基因表达谱分析[D]. 吴宏清.江西农业大学 2013
[2]基于RNA-seq测序的梅花转录组分析[D]. 石文芳.北京林业大学 2012
[3]中华蜜蜂转录组测序及雌性蜜蜂基因表达分析[D]. 刘亭亭.江西农业大学 2012
[4]江南卷柏孢子发育转录组分析及其与拟南芥种子成熟发育转录组特征的比较[D]. 张彦.复旦大学 2012
本文编号：3477812
【文章来源】：中国林业科学研究院北京市
【文章页数】：129 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
研究的技术路线
图 2-1 三年桐 RNA-seq 结果 Transcripts 长度分布统计Fig.2-1 Length distribution of transcripts of RNA-seq of V.fordii
图 2-1 三年桐 RNA-seq 结果 Transcripts 长度分布统计Fig.2-1 Length distribution of transcripts of RNA-seq of V.fordii
【参考文献】：
期刊论文
[1]三年桐、千年桐感染枯萎病病原菌后的生理反应[J]. 杨素素,高暝,朱慧萍,刘英冠,汪阳东,陈益存. 林业科学研究. 2014(06)
[2]植物与尖孢镰刀菌的互作机制研究现状[J]. 梁丽琴,李健强,杨宇红,凌键,谢丙炎. 中国农学通报. 2014(21)
[3]直系同源基因的识别方法与数据库[J]. 杨婧,黄原,汪晓阳. 生命科学研究. 2013(03)
[4]基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析[J]. 曾地刚,陈秀荔,谢达祥,赵永贞,杨春玲,马宁,李咏梅,陈晓汉. 基因组学与应用生物学. 2013(03)
[5]参与植物防御反应的LRR型蛋白结构与功能[J]. 张盈玉,马荣才. 中国农业科技导报. 2009(03)
[6]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong. Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)
[7]不同南瓜砧木品种对网纹甜瓜生长发育的影响[J]. 陈幼源,陈绯翔. 上海农业学报. 2002(04)
[8]植物防御系统中抗病相关基因的研究进展[J]. 万里红,周奕华,陈正华. 遗传. 2002(04)
[9]AM真菌和镰刀菌对西瓜根系几种酶活性的影响[J]. 李敏,刘润进,赵洪海. 菌物系统. 2001(04)
[10]植株调整对无土栽培网纹甜瓜不同品种产量和品质的影响[J]. 陈幼源. 上海农业学报. 2000(02)
博士论文
[1]达尔文氏棉旱胁迫转录组测序、EST-SSR开发及高密度遗传图谱构建[D]. 陈浩东.中国农业科学院 2013
[2]热胁迫下丹参次生代谢比较转录组学研究[D]. 李东.四川农业大学 2011
硕士论文
[1]基于RNA-Seq技术的国产沉香转录组测序及数字基因表达谱分析[D]. 吴宏清.江西农业大学 2013
[2]基于RNA-seq测序的梅花转录组分析[D]. 石文芳.北京林业大学 2012
[3]中华蜜蜂转录组测序及雌性蜜蜂基因表达分析[D]. 刘亭亭.江西农业大学 2012
[4]江南卷柏孢子发育转录组分析及其与拟南芥种子成熟发育转录组特征的比较[D]. 张彦.复旦大学 2012
本文编号：3477812
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