NaHCO 3 胁迫下吉尔吉斯白桦转录组分析及BkGRAS2基因的遗传转化

发布时间：2021-11-21 05:02

　　GRAS蛋白家族是一种植物特有的转录因子家族,该家族包含八个亚族：HAM、 DELLA、PAT1、SCR、SHR、LISCL、LS和SCL3。GRAS蛋白一般由400-700个氨基酸构成,其C末端是保守的、N末端是可变的。GRAS家族成员在植物的生长与发育、信号转导、生物胁迫、非生物胁迫中发挥重要的作用。本研究结合白桦（吉尔吉斯白桦,缩写为Bk）的转录组数据和GRAS蛋白家族的特征,筛选出19个BkGRAS家族成员,对其进行生物信息学分析,成功地从吉尔吉斯白桦中隆了BkGRAS2基因,并对其进行了盐胁迫下表达模式验证、亚细胞定位、转化拟南芥,得到的结果如下：在吉尔吉斯白桦盐胁迫转录数据分析中,我们筛选出与非生物胁迫相关的13类转录因子家族：GRAS、WRKY、Zinc finger protein、NAC、MYB、bHLH、HSF、 MADS、ERF、bZIP、AP2、ARF和HD-ZIP等。本研究主要对GRAS家族成员进行研究。吉尔吉斯白桦GRAS家族的生物信息学分析鉴定出19个BkGRAS蛋白均含有典型的LHRⅠ、VHIID、LHRⅡ、PFYRE和SW结构域；蛋白质二级结构主要以α... 

【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－１?ＧＲＡＳ基因家族结构图解??Ｆｉｇ．?１－１?Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ＧＲＡＳ?ｇｅｎｅ?ｆａｍｉｌｙ??

后获得ｕｎｉｇｅｎｅｓ分别为６６，４６７条和巧，５１７条，ｕｎｉｇｅｎｅｓ的平均长度分别为５９２ｂｐ、??６３６ｂｐ。两个文库共同拼接出Ａｌｌ－ｕｎｉｇｅｎｅｓ为６０５４５条，其平均长度为７５８ｂｐ。转录组产??量与组装质量统计见表２－１，ｃｏｎｔｉｇ、ｕｎｉｇｅｎｅ及ａｌｌ－ｕｎｉｇｅｎｅ序列长度分布见图２－１、２－??２、２－３，０．６％?ＮａＨＣ〇３胁迫４化文库和对照组文库中的ｃｏｎｔｉｇ序列长度及ｕｎｉｇｅｎｅ序列??长度在２００ｂｐ－３０００ｂｐ均有分布，且在＞３０００ｂｐ范围也有分布，但未见有２００ｂｐ序列长度??ｆｉｔｉ?ａｌｌ－ｕｎｉｇｅｎｅ?〇??－６－??

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【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3508824