NaHCO 3 胁迫下柽柳(T.hispida)根部差异表达蛋白质的研究
发布时间:2021-11-24 10:57
土壤盐碱化作为一种重要的非生物限制性因子严重影响植物的生长发育和区域分布,我国的盐碱化土壤面积约为1亿hm2,面对我国越来越严重的土壤盐碱化,利用分子育种方法提高林木耐盐性和培育耐盐新品种是切实有效解决土壤盐碱化的途径。柽柳具有极强的抗盐碱能力,能在0.5%~1%的盐碱地上生长,是改造盐碱地的优良树种,通过蛋白质组学手段研究柽柳势在必行。本实验以刚毛柽柳(Tamarix hispida Willd.)为材料进行碳酸氢钠胁迫处理0h、12h、24h和48h,利用iTRAQ定量技术分离并鉴定各处理时间下响应盐胁迫的根部差异表达蛋白质,并对差异蛋白的功能进行了深入分析,为阐明柽柳响应盐胁迫的分子机理提供了理论基础,并为阐明盐生木本植物的耐盐机制提供了丰富而强有力的数据。本研究共鉴定出521个差异蛋白质,碳酸氢钠处理12h,表达发生变化的蛋白质为294个,其中上调表达蛋白质为151个,下调表达蛋白质为143个;碳酸氢钠处理24h,表达发生变化的蛋白质为263个,其中上调表达蛋白质124个,下调表达蛋白质139个;碳酸氢钠处理48h,表达发生变化的蛋白质为166个,其中上调表达蛋白质78个,下调...
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 引言
1.2 盐胁迫蛋白质组学研究
1.2.1 盐胁迫对光合作用相关蛋白的影响
1.2.2 盐胁迫对活性氧清除相关蛋白的影响
1.2.3 盐胁迫对跨膜运输与渗透调节相关蛋白的影响
1.2.4 盐胁迫对信号转导相关蛋白的影响
1.3 柽柳盐胁迫的研究
1.3.1 盐胁迫对柽柳生理指标的影响
1.3.2 柽柳响应盐胁迫基因功能的研究
1.4 研究的目的与意义
2 盐胁迫下柽柳根部蛋白质的鉴定及功能分析
2.1 材料
2.1.1 材料处理与取材
2.1.2 试验试剂配制
2.2 实验方法
2.2.1 iTRAQ分析
2.2.2 数据库选择与Mascot搜索
2.2.3 GO注释与COG注释
2.3 结果与讨论
2.3.1 柽柳根部总蛋白质的鉴定
2.3.2 柽柳根部总蛋白质的功能注释
2.3.3 柽柳根部响应盐胁迫差异蛋白质的鉴定
2.3.4 柽柳根部响应盐胁迫差异蛋白质的GO分析
2.3.5 柽柳根部响应盐胁迫差异蛋白质的功能聚类分析
2.4 本章小结
3 柽柳根部差异蛋白质定量PCR的分析
3.1 材料
3.1.1 实验材料
3.1.2 主要药剂与仪器
3.2 试验方法
3.2.1 柽柳根部RNA提取
3.2.2 反转录
3.2.3 荧光定量PCR
3.3 结果与讨论
3.3.1 差异蛋白质与其mRNA水平的关联分析
3.3.2 差异蛋白质的功能分析
3.4 本章小结
4 柽柳根部差异蛋白质与转录水平分析
4.1 实验方法
4.2 结果与讨论
4.2.1 柽柳根部差异蛋白质与转录水平的相关性分析
4.2.2 柽柳根部差异蛋白质与转录水平的功能分析
4.3 本章小结
结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]盐胁迫对亚麻荠幼苗生理生化指标的影响[J]. 李晓雅,赵翠珠,程小军,贾庆利,李长圣,刘明喆,Chaofu Lu,张猛. 西北农业学报. 2015(04)
[2]刚毛柽柳TheIF1A基因的互作蛋白及其表达模式分析[J]. 赵震,杨桂燕,张凤娇,高彩球. 林业科学研究. 2015(01)
[3]盐胁迫对中国柽柳幼苗生理特性的影响[J]. 朱金方,刘京涛,陆兆华,夏江宝,柳海宁,金悦. 生态学报. 2015(15)
[4]刚毛柽柳TheIF1A基因转入酵母的抗逆能力分析[J]. 杨桂燕,于丽丽,赵玉琳,赵震,高彩球. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(05)
[5]柽柳ThERF1与其他ERF家族成员的互作[J]. 聂显光,及晓宇,刘羽佳,刘文进,王玉成. 东北林业大学学报. 2014(08)
[6]柽柳ThERF1基因上游调控因子W-box互作蛋白[J]. 臧丹丹,刘文进,王玉成. 东北林业大学学报. 2014(02)
[7]植物体内活性氧的研究及其在植物抗逆方面的应用[J]. 薛鑫,张芊,吴金霞. 生物技术通报. 2013(10)
[8]柽柳谷胱甘肽转移酶基因(ThGSTZ1)转入酵母的抗逆能力分析[J]. 杨桂燕,郭宇聪,王玉成,高彩球. 安徽农业科学. 2013(28)
[9]植物应答非生物胁迫的代谢组学研究进展[J]. 滕中秋,付卉青,贾少华,孟薇薇,戴荣继,邓玉林. 植物生态学报. 2011(01)
[10]盐处理对多枝柽柳光合作用和渗调物质的影响[J]. 王伟华,张希明,闫海龙,梁少民,杨小林. 干旱区研究. 2009(04)
本文编号:3515837
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 引言
1.2 盐胁迫蛋白质组学研究
1.2.1 盐胁迫对光合作用相关蛋白的影响
1.2.2 盐胁迫对活性氧清除相关蛋白的影响
1.2.3 盐胁迫对跨膜运输与渗透调节相关蛋白的影响
1.2.4 盐胁迫对信号转导相关蛋白的影响
1.3 柽柳盐胁迫的研究
1.3.1 盐胁迫对柽柳生理指标的影响
1.3.2 柽柳响应盐胁迫基因功能的研究
1.4 研究的目的与意义
2 盐胁迫下柽柳根部蛋白质的鉴定及功能分析
2.1 材料
2.1.1 材料处理与取材
2.1.2 试验试剂配制
2.2 实验方法
2.2.1 iTRAQ分析
2.2.2 数据库选择与Mascot搜索
2.2.3 GO注释与COG注释
2.3 结果与讨论
2.3.1 柽柳根部总蛋白质的鉴定
2.3.2 柽柳根部总蛋白质的功能注释
2.3.3 柽柳根部响应盐胁迫差异蛋白质的鉴定
2.3.4 柽柳根部响应盐胁迫差异蛋白质的GO分析
2.3.5 柽柳根部响应盐胁迫差异蛋白质的功能聚类分析
2.4 本章小结
3 柽柳根部差异蛋白质定量PCR的分析
3.1 材料
3.1.1 实验材料
3.1.2 主要药剂与仪器
3.2 试验方法
3.2.1 柽柳根部RNA提取
3.2.2 反转录
3.2.3 荧光定量PCR
3.3 结果与讨论
3.3.1 差异蛋白质与其mRNA水平的关联分析
3.3.2 差异蛋白质的功能分析
3.4 本章小结
4 柽柳根部差异蛋白质与转录水平分析
4.1 实验方法
4.2 结果与讨论
4.2.1 柽柳根部差异蛋白质与转录水平的相关性分析
4.2.2 柽柳根部差异蛋白质与转录水平的功能分析
4.3 本章小结
结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]盐胁迫对亚麻荠幼苗生理生化指标的影响[J]. 李晓雅,赵翠珠,程小军,贾庆利,李长圣,刘明喆,Chaofu Lu,张猛. 西北农业学报. 2015(04)
[2]刚毛柽柳TheIF1A基因的互作蛋白及其表达模式分析[J]. 赵震,杨桂燕,张凤娇,高彩球. 林业科学研究. 2015(01)
[3]盐胁迫对中国柽柳幼苗生理特性的影响[J]. 朱金方,刘京涛,陆兆华,夏江宝,柳海宁,金悦. 生态学报. 2015(15)
[4]刚毛柽柳TheIF1A基因转入酵母的抗逆能力分析[J]. 杨桂燕,于丽丽,赵玉琳,赵震,高彩球. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(05)
[5]柽柳ThERF1与其他ERF家族成员的互作[J]. 聂显光,及晓宇,刘羽佳,刘文进,王玉成. 东北林业大学学报. 2014(08)
[6]柽柳ThERF1基因上游调控因子W-box互作蛋白[J]. 臧丹丹,刘文进,王玉成. 东北林业大学学报. 2014(02)
[7]植物体内活性氧的研究及其在植物抗逆方面的应用[J]. 薛鑫,张芊,吴金霞. 生物技术通报. 2013(10)
[8]柽柳谷胱甘肽转移酶基因(ThGSTZ1)转入酵母的抗逆能力分析[J]. 杨桂燕,郭宇聪,王玉成,高彩球. 安徽农业科学. 2013(28)
[9]植物应答非生物胁迫的代谢组学研究进展[J]. 滕中秋,付卉青,贾少华,孟薇薇,戴荣继,邓玉林. 植物生态学报. 2011(01)
[10]盐处理对多枝柽柳光合作用和渗调物质的影响[J]. 王伟华,张希明,闫海龙,梁少民,杨小林. 干旱区研究. 2009(04)
本文编号:3515837
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