基于ISSR和SSR标记的青钱柳天然群体结构及遗传多样性研究
发布时间:2021-12-31 15:16
青钱柳[Cyclocarya paliurus(Batal)Iljinskaja]树姿优美,果似铜钱,为优良的观赏绿化树种;且具有降血压、降血糖和降血脂等功效,为重要的药用木本植物。本研究对我国青钱柳的天然群体进行资源调查,并运用分子标记和形态标记的方法分析了天然群体的遗传多样性与遗传结构,旨在为资源的开发利用和种质资源保存提供科学依据。主要研究结果如下:1.青钱柳天然群体特点对30个天然群体进行调查发现,小群体(群体内个体数量不足20株)达22个,大群体(个体数量≥30株)有5个;植株胸径分布呈“L”型,2030cm径阶的植株比例最高,达33.5%;其次为3040cm,占23%;多数群体的林下小苗较多,在光照充足的条件下,其天然更新较好。2.种子形态在群体间的变异种子形态研究(千粒重、体积、直径、厚度)发现,群体间种子的变异系数均在30%以内,Shannon-weaver遗传多样性指数H均小于1.0,表明群体间种子形态的遗传多样性较低。3.基于ISSR标记的群体遗传分析9条ISSR引物在来自29个群体的244个个体中扩增获得120条多态性片...
【文章来源】:南京林业大学江苏省
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
青钱柳天然群体的地理分布
图 2-2 青钱柳天然群体大小(A)和所有植株胸径径阶分布图(B)Fig. 2-2 Population size (A) and distribution of DBH for all individuals (B) of C. paliurus2.2.3 天然群体种子形态遗传多样性本次调查共有 22 个群体采集到种子(表 2-1)。研究表明,种子千粒重平均值为 14(93.38~226.72g);种子体积平均值为 0.175cm3(0.107~0.232 cm3);无翅直径平为 0.891cm(0.746~0.995cm),有翅直径平均值为 4.53cm(3.50~5.87cm);厚度平为 0.756cm(0.580~0.913cm)(表 2-2)。种子形态的遗传多样性指数 H 均小于 1.0(表 2-3),表明不同群体间种子形态遗样性较低,不存在显著的表型变异。将群体所在地理位置与种子形态指标进行相关分现,种子形态与环境因子无显著相关(表 2-3)。
m数(Gst)(Yeh et al., 1999)。NTSY-pc 软件基于非加权算术平均配对(UPGMA)法进行群体聚类GenAlEx v.6.5 软件 Mxcomp 程序对群体的遗传距离与地理距离相关kall et al., 2012)。使用分子方差分析(AMOVA)方法估计群体内部化程度,并对不同群体做主坐标分析(PCA 分析)。STRUCTURE 2.3.4 软件基于贝叶斯模型聚类分析方法对群体进行聚遵循 Hardy-Weinberg 平衡)(Evanno et al., 2005 )。具体分析过目(K)为 2~15,并假定位点都是独立的,依据马尔可夫链蒙特卡 次循环和 100,000 个迭代的老化期中,计算 10 次对数后验概率,均k;选取计算中最大的Δk 值,从而确定最可能的模型(Shafiei-Astani 与分析A 质量和浓度凝胶电泳检测可知所提 DNA 片段比较完整(图 3-1)。微量分光0/280< 2.0,说明 DNA 纯度较高,适合进一步的 PCR 扩增反应。
【参考文献】:
期刊论文
[1]雌雄异型异熟青钱柳幼龄林开花习性及交配系统分析[J]. 毛霞,刘晶晶,李晓春,秦健,洑香香. 南京林业大学学报(自然科学版). 2016(06)
[2]青钱柳种质资源亲缘关系的ISSR分析评价[J]. 陈秀娟,柏明娥,王丽玲,张都海,徐高福,王燕飞. 中国林副特产. 2016(04)
[3]中国特有植物南川百合群体遗传多样性研究[J]. 赵玉倩,丁瑞华,李玉帆,刘正权,贾桂霞. 分子植物育种. 2016(03)
[4]金线兰及近缘种植物遗传多样性ISSR分子标记分析[J]. 叶炜,江金兰,李永清,雷伏贵,周建金,胡启镔,魏道智. 植物遗传资源学报. 2015(05)
[5]生活史性状和取样策略对植物微卫星遗传多样性参数估算的影响[J]. 杜夏瑾,黎啸峰,吴敏,王丽. 湖南师范大学自然科学学报. 2015(04)
[6]叶用银杏种质资源黄酮和萜内酯类含量及AFLP遗传多样性分析[J]. 吴岐奎,邢世岩,王萱,孙立民. 园艺学报. 2014(12)
[7]基于SSR和ISSR的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析[J]. 王惠梅,吴国林,江绍琳,黄奇娜,奉保华,黄长干,江绍玫,吴建利. 植物遗传资源学报. 2015(01)
[8]四川西部濒危植物桃儿七遗传多样性的RAPD分析[J]. 肖猛,李群,郭亮,唐琳,王丽,陈放. 生态学报. 2015(05)
[9]野生毛花猕猴桃果实表型性状及SSR遗传多样性分析[J]. 汤佳乐,黄春辉,吴寒,郎彬彬,曲雪艳,徐小彪. 园艺学报. 2014(06)
[10]杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析[J]. 欧阳磊,陈金慧,郑仁华,徐阳,林宇峰,黄金华,叶代全,方扬辉,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
本文编号:3560488
【文章来源】:南京林业大学江苏省
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
青钱柳天然群体的地理分布
图 2-2 青钱柳天然群体大小(A)和所有植株胸径径阶分布图(B)Fig. 2-2 Population size (A) and distribution of DBH for all individuals (B) of C. paliurus2.2.3 天然群体种子形态遗传多样性本次调查共有 22 个群体采集到种子(表 2-1)。研究表明,种子千粒重平均值为 14(93.38~226.72g);种子体积平均值为 0.175cm3(0.107~0.232 cm3);无翅直径平为 0.891cm(0.746~0.995cm),有翅直径平均值为 4.53cm(3.50~5.87cm);厚度平为 0.756cm(0.580~0.913cm)(表 2-2)。种子形态的遗传多样性指数 H 均小于 1.0(表 2-3),表明不同群体间种子形态遗样性较低,不存在显著的表型变异。将群体所在地理位置与种子形态指标进行相关分现,种子形态与环境因子无显著相关(表 2-3)。
m数(Gst)(Yeh et al., 1999)。NTSY-pc 软件基于非加权算术平均配对(UPGMA)法进行群体聚类GenAlEx v.6.5 软件 Mxcomp 程序对群体的遗传距离与地理距离相关kall et al., 2012)。使用分子方差分析(AMOVA)方法估计群体内部化程度,并对不同群体做主坐标分析(PCA 分析)。STRUCTURE 2.3.4 软件基于贝叶斯模型聚类分析方法对群体进行聚遵循 Hardy-Weinberg 平衡)(Evanno et al., 2005 )。具体分析过目(K)为 2~15,并假定位点都是独立的,依据马尔可夫链蒙特卡 次循环和 100,000 个迭代的老化期中,计算 10 次对数后验概率,均k;选取计算中最大的Δk 值,从而确定最可能的模型(Shafiei-Astani 与分析A 质量和浓度凝胶电泳检测可知所提 DNA 片段比较完整(图 3-1)。微量分光0/280< 2.0,说明 DNA 纯度较高,适合进一步的 PCR 扩增反应。
【参考文献】:
期刊论文
[1]雌雄异型异熟青钱柳幼龄林开花习性及交配系统分析[J]. 毛霞,刘晶晶,李晓春,秦健,洑香香. 南京林业大学学报(自然科学版). 2016(06)
[2]青钱柳种质资源亲缘关系的ISSR分析评价[J]. 陈秀娟,柏明娥,王丽玲,张都海,徐高福,王燕飞. 中国林副特产. 2016(04)
[3]中国特有植物南川百合群体遗传多样性研究[J]. 赵玉倩,丁瑞华,李玉帆,刘正权,贾桂霞. 分子植物育种. 2016(03)
[4]金线兰及近缘种植物遗传多样性ISSR分子标记分析[J]. 叶炜,江金兰,李永清,雷伏贵,周建金,胡启镔,魏道智. 植物遗传资源学报. 2015(05)
[5]生活史性状和取样策略对植物微卫星遗传多样性参数估算的影响[J]. 杜夏瑾,黎啸峰,吴敏,王丽. 湖南师范大学自然科学学报. 2015(04)
[6]叶用银杏种质资源黄酮和萜内酯类含量及AFLP遗传多样性分析[J]. 吴岐奎,邢世岩,王萱,孙立民. 园艺学报. 2014(12)
[7]基于SSR和ISSR的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析[J]. 王惠梅,吴国林,江绍琳,黄奇娜,奉保华,黄长干,江绍玫,吴建利. 植物遗传资源学报. 2015(01)
[8]四川西部濒危植物桃儿七遗传多样性的RAPD分析[J]. 肖猛,李群,郭亮,唐琳,王丽,陈放. 生态学报. 2015(05)
[9]野生毛花猕猴桃果实表型性状及SSR遗传多样性分析[J]. 汤佳乐,黄春辉,吴寒,郎彬彬,曲雪艳,徐小彪. 园艺学报. 2014(06)
[10]杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析[J]. 欧阳磊,陈金慧,郑仁华,徐阳,林宇峰,黄金华,叶代全,方扬辉,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
本文编号:3560488
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