基于SSR标记的杉木重要性状关联分析研究
发布时间：2022-07-20 15:04
杉木[Cunninghamia lanceolata（Lamb.）Hook.]是我国南方特有的优良速生用材树种,分布遍及南方17个省区。本研究以来自11个地理种源的188个杉木无性系为实验材料,测定了木材的纤维素和木质素含量数据,并分析其变异规律。开发了一套杉木木材形成相关基因内的SSR标记,结合自主开发的EST-SSR标记,分析了杉木优株群体的遗传多样性和群体结构。通过关联分析寻找与重要表型性状相关联的SSR位点,并挖掘其优异等位变异。主要研究结果如下:（1）结合范式纤维洗涤分析法和近红外光谱建立了杉木纤维素和木质素含量预测模型,相关系数分别达到了0.9409和0.9468,表明模型预测效果较好,可以用来预测真实值。通过对纤维素和木质素含量变异分析发现,其含量的总体变异系数均较小,分别为6.00%和5.89%。方差分析表明纤维素含量在不同无性系间存在极显著差异。（2）克隆得到10个杉木木材形成相关基因的全长序列,共覆盖杉木基因组长度为32785bp,从中找到13个SSR位点,共开发出7对多态性SSR引物,检测到17个等位变异,平均每对引物产生2.429个等位变异,多态性引物占总设计引...
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 文献综述
1.1 杉木木材生长和材质性状研究进展
1.1.1 生长性状
1.1.2 物理力学性质及解剖特征
1.1.3 化学组成
1.1.4 各性状间相关性
1.1.5 杉木多性状综合选择
1.2 近红外光谱技术在木材材性分析中的应用
1.2.1 化学性质
1.2.2 物理力学性质
1.2.3 解剖性质
1.3 基于SSR标记的林木遗传多样性研究进展
1.3.1 SSR分子标记
1.3.2 基于SSR标记的林木遗传多样性研究
1.4 林木关联分析的研究进展
1.4.1 关联分析的概念
1.4.2 关联分析的方法和步骤
1.4.3 关联分析在林木中的研究进展
1.5 立题依据和研究意义
2 杉木纤维素和木质素含量的近红外模型建立及变异分析
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 纤维素、木质素测定
2.1.3 近红外光谱(NIR)的采集
2.1.4 模型的建立与评价
2.1.5 未知样品的预测与数据分析
2.2 结果与分析
2.2.1 杉木木材近红外光谱图描述
2.2.2 纤维素含量近红外模型的建立与评价
2.2.2.1 样品的选择
2.2.2.2 模型的建立
2.2.3 木质素含量近红外模型的建立与评价
2.2.3.1 样品的选择
2.2.3.2 模型的建立
2.2.4 杉木纤维素和木质素含量变异分析
2.2.4.1 种源间变异分析
2.2.4.2 无性系间变异分析
2.3 结论与讨论
3 杉木木材形成相关基因内SSR标记的开发
3.1 材料与方法
3.1.1 植物材料
3.1.2 总DNA的提取
3.1.3 SSR位点搜寻及引物开发
3.1.4 SSR位点扩增及电泳检测
3.1.5 SSR位点多态性分析
3.2 结果与分析
3.2.1 杉木木材形成相关基因内SSR位点的发现
3.2.2 SSR位点PCR扩增引物的设计及多态性分析
3.3 结论与讨论
4 杉木优株群体遗传多样性和群体结构分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 EST-SSR引物设计
4.1.3 基因组DNA的提取和EST-SSR标记的开发
4.1.4 群体遗传多样性分析
4.1.5 群体结构分析
4.1.6 多态性位点的连锁不平衡分析
4.2 结果与分析
4.2.1 DNA提取及多态性引物开发
4.2.2 杉木优株群体遗传多样性分析
4.2.3 杉木优株群体遗传结构分析
4.2.4 连锁不平衡分析
4.3 结论与讨论
5 杉木重要性状关联分析及优异等位变异的发掘
5.1 材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 重要表型性状与分子标记的关联分析
5.1.3 优异位点及优异等位变异的确认
5.2 结果与分析
5.2.1 重要性状与标记的关联分析
5.2.2 生长性状优异等位变异
5.2.3 材质性状优异等位变异
5.3 结论与讨论
6 结论与展望
6.1 主要结论
6.2 研究展望
参考文献
个人简介
论文发表情况
学术交流活动
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析[J]. 江锡兵,汤丹,龚榜初,赖俊声. 园艺学报. 2015(12)
[2]杉木应压木木质部细胞形态特征及主要代谢成分表征[J]. 张胜龙,刘京晶,楼雄珍,刘洋,童再康,黄华宏. 北京林业大学学报. 2015(05)
[3]21年生杉木优良无性系生长与材质性状研究[J]. 朱安明,赖树华,段爱国,张建国,孙建军,邓宗富. 林业科技通讯. 2015(04)
[4]杉木无性系主要经济性状遗传变异和无性系选择[J]. 何贵平,林阳峰,程亚平,徐肇友,曹高铨,王帮顺. 浙江林业科技. 2015(01)
[5]30年生不同生长势杉木的胸径和树高的生长动态[J]. 刘丽颖,张绍轩,任佳佳,孟京辉,李磊. 西北林学院学报. 2014(06)
[6]杉木无性系生长和木材品质性状遗传变异研究[J]. 李荣丽,黄寿先,梁机,周传明,何长虹,李龙梅,唐国强. 南方农业学报. 2014(09)
[7]杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发[J]. 徐阳,陈金慧,李亚,洪舟,王颖,赵亚琦,王新民,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
[8]马尾松生长和产脂性状在SSR和ESTP标记不同基因型间的变异研究[J]. 何韵,刘天颐,蔡燕灵,曾令海,黄少伟. 广东林业科技. 2013(06)
[9]杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析[J]. 欧阳磊,陈金慧,郑仁华,徐阳,林宇峰,黄金华,叶代全,方扬辉,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
[10]基于近红外光谱技术的人工林杨木苯醇抽提物质量分数的预测[J]. 刘镇波,孙凤亮,李耀翔,刘一星,Xiang-Ming Wang. 东北林业大学学报. 2013(06)
博士论文
[1]不同海拔藏川杨遗传多样性评估及苗期表型关联分析[D]. 沈登锋.北京林业大学 2014
[2]东北亚地区粳稻遗传多样性及主要株型性状与SSR标记的关联分析[D]. 王敬国.东北林业大学 2014
[3]杉木人工林生长及材种结构规律研究[D]. 相聪伟.中国林业科学研究院 2013
[4]小叶杨遗传资源评价及重要性状的SSRs关联分析[D]. 卫尊征.北京林业大学 2010
[5]山杨遗传多样性研究与核心种质构建及利用[D]. 白卉.东北林业大学 2010
[6]利用ISSR和EST-SSR标记研究中国茶树资源的遗传多样性和遗传结构[D]. 姚明哲.浙江大学 2009
[7]水稻关联定位群体的构建及若干品质性状的关联分析[D]. 金亮.浙江大学 2009
[8]云杉天然群体遗传多样性研究[D]. 罗建勋.中国林业科学研究院 2004
硕士论文
[1]基于SSR标记构建白蜡种质资源分子身份证及其遗传多样性分析[D]. 胡春龙.山东农业大学 2015
[2]浙江楠EST-SSR标记开发及天然种群遗传多样性研究[D]. 丁亚军.浙江农林大学 2014
[3]榧树群体遗传结构及与苗期生长性状关联的SRAP标记分析[D]. 董雷鸣.浙江农林大学 2013
[4]黄淮冬麦区175个小麦品种的SSR多态性及其与株高、产量相关性状的关联分析[D]. 武玉国.山东农业大学 2012
[5]玉米自交系遗传多样性及产量性状与SSR标记的关联分析[D]. 徐亮.扬州大学 2012
[6]近红外光谱分析法预测欧美杨材性的研究[D]. 邹鑫.北京林业大学 2010
[7]利用近红外光谱技术预测粗皮桉木材微纤丝角和气干密度的研究[D]. 张黎.西北农林科技大学 2008
[8]马尾松实生种子园遗传多样性研究[D]. 龚佳.南京林业大学 2007
[9]核桃SSR反应体系的优化及群体遗传多样性分析[D]. 刘晓丽.山东农业大学 2007
[10]杉木无性系生长与材性综合遗传改良研究[D]. 韦立权.广西大学 2004
本文编号：3664213
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 文献综述
1.1 杉木木材生长和材质性状研究进展
1.1.1 生长性状
1.1.2 物理力学性质及解剖特征
1.1.3 化学组成
1.1.4 各性状间相关性
1.1.5 杉木多性状综合选择
1.2 近红外光谱技术在木材材性分析中的应用
1.2.1 化学性质
1.2.2 物理力学性质
1.2.3 解剖性质
1.3 基于SSR标记的林木遗传多样性研究进展
1.3.1 SSR分子标记
1.3.2 基于SSR标记的林木遗传多样性研究
1.4 林木关联分析的研究进展
1.4.1 关联分析的概念
1.4.2 关联分析的方法和步骤
1.4.3 关联分析在林木中的研究进展
1.5 立题依据和研究意义
2 杉木纤维素和木质素含量的近红外模型建立及变异分析
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 纤维素、木质素测定
2.1.3 近红外光谱(NIR)的采集
2.1.4 模型的建立与评价
2.1.5 未知样品的预测与数据分析
2.2 结果与分析
2.2.1 杉木木材近红外光谱图描述
2.2.2 纤维素含量近红外模型的建立与评价
2.2.2.1 样品的选择
2.2.2.2 模型的建立
2.2.3 木质素含量近红外模型的建立与评价
2.2.3.1 样品的选择
2.2.3.2 模型的建立
2.2.4 杉木纤维素和木质素含量变异分析
2.2.4.1 种源间变异分析
2.2.4.2 无性系间变异分析
2.3 结论与讨论
3 杉木木材形成相关基因内SSR标记的开发
3.1 材料与方法
3.1.1 植物材料
3.1.2 总DNA的提取
3.1.3 SSR位点搜寻及引物开发
3.1.4 SSR位点扩增及电泳检测
3.1.5 SSR位点多态性分析
3.2 结果与分析
3.2.1 杉木木材形成相关基因内SSR位点的发现
3.2.2 SSR位点PCR扩增引物的设计及多态性分析
3.3 结论与讨论
4 杉木优株群体遗传多样性和群体结构分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 EST-SSR引物设计
4.1.3 基因组DNA的提取和EST-SSR标记的开发
4.1.4 群体遗传多样性分析
4.1.5 群体结构分析
4.1.6 多态性位点的连锁不平衡分析
4.2 结果与分析
4.2.1 DNA提取及多态性引物开发
4.2.2 杉木优株群体遗传多样性分析
4.2.3 杉木优株群体遗传结构分析
4.2.4 连锁不平衡分析
4.3 结论与讨论
5 杉木重要性状关联分析及优异等位变异的发掘
5.1 材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 重要表型性状与分子标记的关联分析
5.1.3 优异位点及优异等位变异的确认
5.2 结果与分析
5.2.1 重要性状与标记的关联分析
5.2.2 生长性状优异等位变异
5.2.3 材质性状优异等位变异
5.3 结论与讨论
6 结论与展望
6.1 主要结论
6.2 研究展望
参考文献
个人简介
论文发表情况
学术交流活动
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析[J]. 江锡兵,汤丹,龚榜初,赖俊声. 园艺学报. 2015(12)
[2]杉木应压木木质部细胞形态特征及主要代谢成分表征[J]. 张胜龙,刘京晶,楼雄珍,刘洋,童再康,黄华宏. 北京林业大学学报. 2015(05)
[3]21年生杉木优良无性系生长与材质性状研究[J]. 朱安明,赖树华,段爱国,张建国,孙建军,邓宗富. 林业科技通讯. 2015(04)
[4]杉木无性系主要经济性状遗传变异和无性系选择[J]. 何贵平,林阳峰,程亚平,徐肇友,曹高铨,王帮顺. 浙江林业科技. 2015(01)
[5]30年生不同生长势杉木的胸径和树高的生长动态[J]. 刘丽颖,张绍轩,任佳佳,孟京辉,李磊. 西北林学院学报. 2014(06)
[6]杉木无性系生长和木材品质性状遗传变异研究[J]. 李荣丽,黄寿先,梁机,周传明,何长虹,李龙梅,唐国强. 南方农业学报. 2014(09)
[7]杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发[J]. 徐阳,陈金慧,李亚,洪舟,王颖,赵亚琦,王新民,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
[8]马尾松生长和产脂性状在SSR和ESTP标记不同基因型间的变异研究[J]. 何韵,刘天颐,蔡燕灵,曾令海,黄少伟. 广东林业科技. 2013(06)
[9]杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析[J]. 欧阳磊,陈金慧,郑仁华,徐阳,林宇峰,黄金华,叶代全,方扬辉,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
[10]基于近红外光谱技术的人工林杨木苯醇抽提物质量分数的预测[J]. 刘镇波,孙凤亮,李耀翔,刘一星,Xiang-Ming Wang. 东北林业大学学报. 2013(06)
博士论文
[1]不同海拔藏川杨遗传多样性评估及苗期表型关联分析[D]. 沈登锋.北京林业大学 2014
[2]东北亚地区粳稻遗传多样性及主要株型性状与SSR标记的关联分析[D]. 王敬国.东北林业大学 2014
[3]杉木人工林生长及材种结构规律研究[D]. 相聪伟.中国林业科学研究院 2013
[4]小叶杨遗传资源评价及重要性状的SSRs关联分析[D]. 卫尊征.北京林业大学 2010
[5]山杨遗传多样性研究与核心种质构建及利用[D]. 白卉.东北林业大学 2010
[6]利用ISSR和EST-SSR标记研究中国茶树资源的遗传多样性和遗传结构[D]. 姚明哲.浙江大学 2009
[7]水稻关联定位群体的构建及若干品质性状的关联分析[D]. 金亮.浙江大学 2009
[8]云杉天然群体遗传多样性研究[D]. 罗建勋.中国林业科学研究院 2004
硕士论文
[1]基于SSR标记构建白蜡种质资源分子身份证及其遗传多样性分析[D]. 胡春龙.山东农业大学 2015
[2]浙江楠EST-SSR标记开发及天然种群遗传多样性研究[D]. 丁亚军.浙江农林大学 2014
[3]榧树群体遗传结构及与苗期生长性状关联的SRAP标记分析[D]. 董雷鸣.浙江农林大学 2013
[4]黄淮冬麦区175个小麦品种的SSR多态性及其与株高、产量相关性状的关联分析[D]. 武玉国.山东农业大学 2012
[5]玉米自交系遗传多样性及产量性状与SSR标记的关联分析[D]. 徐亮.扬州大学 2012
[6]近红外光谱分析法预测欧美杨材性的研究[D]. 邹鑫.北京林业大学 2010
[7]利用近红外光谱技术预测粗皮桉木材微纤丝角和气干密度的研究[D]. 张黎.西北农林科技大学 2008
[8]马尾松实生种子园遗传多样性研究[D]. 龚佳.南京林业大学 2007
[9]核桃SSR反应体系的优化及群体遗传多样性分析[D]. 刘晓丽.山东农业大学 2007
[10]杉木无性系生长与材性综合遗传改良研究[D]. 韦立权.广西大学 2004
本文编号：3664213
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