马尾松产脂性状显著关联标记初步探索

发布时间：2022-08-29 18:41

　　马尾松（Pinus massoniana Lamb.）是我国主要产脂树种之一,近些年来由于其森林面积和产脂树木的减少,导致松脂产量降低;采用经典的轮回育种策略对马尾松高产脂进行遗传改良所需周期较长,短时间内难以满足市场对马尾松高产脂良种的需求。运用基因组关联分析方法,通过筛选出与产脂性状显著关联的分子标记,开展分子标记辅助选择研究,对马尾松高产脂良种快速选育,缩短育种周期具有重要意义。而对于显著性关联标记所在基因序列进行深度挖掘,是发现控制目标性状重要基因的有效途径,对于深层次探究并最终揭示马尾松产脂量性状遗传调控机理具有重要意义。本研究基于马尾松产脂性状候选基因组关联分析和简化基因组关联分析研究所得到的3个显著性关联分子标记（1个SSR标记和2个SNP标记）,开展相关基因序列深度挖掘工作。研究的主要内容包括:（1）基于高通量转录组测序结果对SSR-PCZ90标记所在基因序列进行追溯,并通过生物信息学软件分析SSR-PCZ90标记所在的mRNA序列,包括同源序列比对、蛋白结构（包括一级、二级和三级结构）和功能基因的预测;（2）基于通过简化基因组测序获得的SNP-M181697、SNP-... 

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 研究背景与目的意义
    1.2 国内外研究进展
        1.2.1 针叶树产脂机理的研究
        1.2.2 谷胱甘肽S-转移酶(GST)的概述
        1.2.3 关联分析
        1.2.4 关联分析中常用的分子标记
        1.2.5 染色体步移
    1.3 研究内容与路线
        1.3.1 研究内容
        1.3.2 技术路线
        1.3.3 项目来源和经费支持
第2章 马尾松SSR-PCZ90 标记相关基因挖掘及其生物信息学
    2.1 材料和方法
        2.1.1 马尾松SSR-PCZ90 标记所在基因序列的追溯
        2.1.2 基于第3 代高通量转录组测序的SSR-PCZ90 相关序列获取
        2.1.3 生物信息学分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 SSR-PCZ90 相关序列获取
        2.2.2 序列比对分析
        2.2.3 SSR-PCZ90 相关基因的ORF预测
        2.2.4 蛋白质一级结构预测
        2.2.5 蛋白质二级结构预测
        2.2.6 蛋白质三级结构预测
    2.3 讨论
第3章 SNP-M181697和SNP-M249970 标记相关序列挖掘
    3.1 实验材料与设备
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 主要试剂
        3.1.3 实验仪器
    3.2 实验方法
        3.2.1 总DNA提取
        3.2.2 中间片段的克隆
        3.2.3 染色体步移
    3.3 结果与分析
        3.3.1 DNA质量检测
        3.3.2 181697克隆结果分析
        3.3.3 249970克隆结果分析
    3.4 讨论
第4章 结果和展望
    4.1 结果
    4.2 讨论
    4.3 展望
参考文献
攻读硕士学位期间发表论文情况
致谢



本文编号：3678812