二倍体和四倍体白花泡桐响应盐胁迫蛋白质组变化研究

发布时间：2023-04-01 22:35

　　土壤盐渍化一直是困扰农业生产的一大难题,对于土地资源日趋紧张的今天,如何合理利用盐渍化土壤成为了当今各国的一个重要课题。运用蛋白质组学的研究方法研究植物在盐胁迫下的应答机制,发掘参与盐应答反应的关键蛋白,对于全面揭示植物的抗盐机理有重要的意义。本研究通过基于质谱的蛋白质组学同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)技术,以AB SCIEX Triple TOFTM5600液相色谱串联质谱仪为研究平台,分析研究了二倍体和四倍体白花泡桐盐胁迫处理后的表达差异,为进一步研究相关基因及其编码的蛋白功能打下基础,以探究泡桐抗盐分子机制。在本次质谱实验中共鉴定到2851个蛋白,8590个肽段,其中含7221个Unique肽段,并对这2851个蛋白进行GO(Gene Ontology)COG(Cluster of Ortholog Genes)KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)注释分析,这些蛋白被注释到47个GO条目上,属于24个COG cl...

【文章页数】：39 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
致谢
摘要
1 文献综述
    1.1 植物盐胁迫在国内外的研究进展
    1.2 植物蛋白质组研究
        1.2.1 蛋白质组学产生背景和相关概念
        1.2.2 蛋白质组学的研究方法
        1.2.3 转录组学与蛋白质组学的关联
        1.2.4 植物响应盐胁迫蛋白质组学研究
    1.3 二倍体和四倍体泡桐的研究
        1.3.1 泡桐概述
        1.3.2 泡桐新品种的培育
    1.4 本文研究的目的和意义
2 引言
3 材料与方法
    3.1 试验材料及盐处理
    3.2 主要试剂和仪器设备
        3.2.1 主要试剂
        3.2.2 主要仪器设备
    3.3 蛋白质提取
    3.4 iTRAQ实验
        3.4.1 蛋白消化
        3.4.2 iTRAQ标记
        3.4.3 SCX分离
        3.4.4 基于Triple TOF 5600 的LC-ESI-MSMS分析
    3.5 生物信息学分析
        3.5.1 数据库的选择和搜索
        3.5.2 蛋白质鉴定信息统计
        3.5.3 差异蛋白关联分析
    3.6 总RNA的提取
    3.7 qRT-PCR验证
4 结果与分析
    4.1 样品蛋白质含量
    4.2 蛋白质鉴定
        4.2.1 基本鉴定信息
        4.2.2 蛋白组整体分布情况
    4.3 蛋白质注释
        4.3.1 GO分类
        4.3.2 COG分类
        4.3.3 Pathway代谢通路分类
    4.4 差异蛋白统计
        4.4.1 蛋白质相对定量
        4.4.2 盐应答蛋白确定方案分析
        4.4.3 盐应答蛋白的GO分类
        4.4.4 盐应答蛋白Pathway分析
    4.5 蛋白质组与转录组的关联分析
    4.6 差异表达蛋白的qRT-PCR验证
5 结论与讨论
参考文献
ABSTRACT



本文编号：3777987