马尾松产脂性状EST-SSR引物开发及关联分析

发布时间：2023-12-02 11:36

　　马尾松(Pinus massoniana Lamb.)属于松科(Pinaceae)松属(Pinus L.)双维管束松亚属(Subgen.Pinus)常绿乔木。马尾松是我国分布最广泛的针叶树种之一,也是我国重要的荒山造林树种和我国南方林业产业的当家树种。马尾松脂材兼用是我国最主要的产脂树种,马尾松松脂占全国产脂量的70%以上。由于市场对松脂的需求量较大,但目前可推广的高产脂马尾松品系较少,不能满足市场对松脂的需求量,因此对马尾松产脂性状的遗传改良非常重要。传统的改良方式主要是通过选择优良单株和杂交实现的,但这种改良方式所需的周期较长。而通过基因组关联分析等方法开发出与马尾松产脂性状显著相关的分子标记,进行分子标记辅助选择,可以缩短育种周期,提高育种效率,加快高产脂良种选育的进程。本研究通过对马尾松无性系的3种组织进行转录组测序,分析转录组序列中SSR的重复单元类型、频率及分布特点,根据产脂差异序列筛选并设计合成EST-SSR引物,并对所开发的259对引物进行验证,将筛选出具有多态性的EST-SSR引物对马尾松无性系进行分型检测,结合产脂量表型数据进行关联分析,旨在寻找与马尾松产脂性状显著...

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 绪论
    1.1 研究背景
        1.1.1 马尾松简介
        1.1.2 松脂及针叶树种的产脂机理研究
        1.1.3 马尾松高产脂遗传改良进展
    1.2 分子标记在林木研究中的应用进展
        1.2.1 林木分子标记研究进展
        1.2.2 SSR分子标记研究进展
        1.2.3 SSR标记在松树研究进展
    1.3 关联分析研究进展
        1.3.1 基因组关联分析的概念、优点及影响
        1.3.2 候选基因关联分析
        1.3.3 关联分析在农作物的研究
        1.3.4 关联分析在林木上的应用
    1.4 研究内容及技术路线
        1.4.1 研究内容
        1.4.2 研究技术路线
    1.5 研究目的及意义
    1.6 项目来源与经费支持
第2章 材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 采集地概况及马尾松转录组测序的材料
        2.1.2 马尾松引物验证及关联群体的材料
    2.2 主要仪器、试剂及配制方法
        2.2.1 实验主要仪器
        2.2.2 实验试剂及配制方法
    2.3 实验方法
        2.3.1 提取DNA的方法
        2.3.2 马尾松SSR引物设计
        2.3.3 PCR扩增及检测
        2.3.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法
        2.3.5 马尾松产脂性状调查
    2.4 数据处理
        2.4.1 SSR标记的设计及开发
        2.4.2 关联分析的数据分析
        2.4.3 关联位点的表型效应计算
第3章 结果与讨论
    3.1 马尾松候选基因挖掘及SSR引物设计
        3.1.1 马尾松转录组中SSR重复单元类型、频率及分布特点
        3.1.2 马尾松转录组表达序列测序含SSR差异序列分析
        3.1.3 SSR引物有效性分析及多态性检测
    3.2 马尾松产脂性状关联分析
        3.2.1 群体结构分析
        3.2.2 马尾松产脂性状的测定
        3.2.3 关联分析
        3.2.4 关联位点的表型效应计算
    3.3 讨论
        3.3.1 基于候选基因策略的马尾松SSR标记开发
        3.3.2 基因关联分析
第4章 结论与展望
    4.1 结论
    4.2 展望
参考文献
攻读硕士阶段发表论文
致谢



本文编号：3869587