中国光肩星天牛种群表型多样性及遗传变异研究
发布时间:2023-12-03 20:28
光肩星天牛Anoplophora glabripennis (Motschulsky)是国内最重要的林木蛀干害虫之一,在中国分布范围较广。近年来,形态学以及分子生物学的研究表明,光肩星天牛与黄斑星天牛A. nobilis (Ganglbauer)是同一种的不同生物型。本研究采用生物信息学的方法分析光肩星天牛全基因组微卫星特征,设计微卫星引物2621对,并且从中筛选出21对SSR引物。结合形态标记和微卫星分子标记的研究方法,以光肩星天牛在中国分布的20个地理种群585个个体为研究对象,对其表型性状的差异和遗传多样性、遗传结构以及两型间的种群分化问题进行了探讨,同时进一步验证了光肩星天牛与黄斑星天牛为同一种的不同型(白斑型与黄斑型)。主要研究结果如下:1、构建了光肩星天牛鞘翅斑纹颜色数字化分析的方法,为其两型分化机制的研究提供了基础。2、光肩星天牛的表型特征存在着广泛的变异且与寄主和地理因子相关,群体内变异是其表型性状变异的主要来源。13个表型性状的平均分化系数为11.78%,鞘翅斑纹颜色的分化系数达到最大,为50.53%。以鞘翅斑纹颜色分类的6个类群分析结果显示,13个性状的平均表型分化...
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
1 引言
1.1 光肩星天牛的两型分化
1.1.1 光肩星天牛的危害及生态适应性
1.1.2 光肩星天牛的分布及寄主
1.1.3 光肩星天牛的两型研究
1.2 表型性状多样性研究概述
1.3 基于微卫星的种群遗传学研究进展
1.3.1 种群遗传学概述
1.3.2 微卫星分子标记的原理和优势
1.3.3 微卫星分子标记在种群遗传学的应用
1.4 光肩星天牛种群遗传学进展
1.5 研究思路
1.6 技术路线图
2 研究内容与方法
2.1 样本采集
2.2 鞘翅斑纹颜色数字化描述
2.3 光肩星天牛表型性状多样性研究
2.3.1 表型性状的测量
2.3.2 表型性状数据的统计分析方法
2.4 光肩星天牛全基因组微卫星特征
2.5 光肩星天牛微卫星引物开发和筛选
2.5.1 样本来源
2.5.2 微卫星引物设计
2.5.3 微卫星引物的三步筛选
2.5.4 微卫星引物评估
2.6 光肩星天牛遗传多样性研究
2.6.1 基因组DNA提取
2.6.2 PCR扩增
2.6.3 毛细管电泳与微卫星分型
2.6.4 数据分析
3 结果分析
3.1 鞘翅斑纹颜色数字化描述
3.1.1 RGB三色的相关性分析
3.1.2 基于鞘翅斑纹颜色的分型
3.2 光肩星天牛表型性状多样性
3.2.1 光肩星天牛种群间与种群内的形态变异特征
3.2.2 光肩星天牛形态变异来源与群体间的表型分化
3.2.3 表型性状的变异特征
3.2.4 表型性状与地理因子的相关分析
3.2.5 基于表型性状的聚类分析
3.2.6 不同颜色类群的性状差异与分化
3.3 光肩星天牛全基因组微卫星特征
3.4 光肩星天牛微卫星引物筛选
3.5 光肩星天牛地理种群遗传变异
3.5.1 微卫星基因分型
3.5.2 光肩星天牛地理种群遗传多样性分析
3.5.3 光肩星天牛地理种群遗传结构与分化
3.6 光肩星天牛两型遗传变异
3.6.1 光肩星天牛两型种群遗传结构
3.6.2 光肩星天牛两型种群聚类分析
3.6.3 AMOVA分析
4 结论与讨论
4.1 结论
4.2 讨论
4.2.1 光肩星天牛表型性状多样性
4.2.2 光肩星天牛全基因组微卫星特征
4.2.3 引物开发
4.2.4 光肩星天牛遗传多样性及分化
5 创新点与展望
5.1 创新点
5.2 展望
参考文献
个人简介
导师简介
获得成果目录
致谢
本文编号:3870341
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
1 引言
1.1 光肩星天牛的两型分化
1.1.1 光肩星天牛的危害及生态适应性
1.1.2 光肩星天牛的分布及寄主
1.1.3 光肩星天牛的两型研究
1.2 表型性状多样性研究概述
1.3 基于微卫星的种群遗传学研究进展
1.3.1 种群遗传学概述
1.3.2 微卫星分子标记的原理和优势
1.3.3 微卫星分子标记在种群遗传学的应用
1.4 光肩星天牛种群遗传学进展
1.5 研究思路
1.6 技术路线图
2 研究内容与方法
2.1 样本采集
2.2 鞘翅斑纹颜色数字化描述
2.3 光肩星天牛表型性状多样性研究
2.3.1 表型性状的测量
2.3.2 表型性状数据的统计分析方法
2.4 光肩星天牛全基因组微卫星特征
2.5 光肩星天牛微卫星引物开发和筛选
2.5.1 样本来源
2.5.2 微卫星引物设计
2.5.3 微卫星引物的三步筛选
2.5.4 微卫星引物评估
2.6 光肩星天牛遗传多样性研究
2.6.1 基因组DNA提取
2.6.2 PCR扩增
2.6.3 毛细管电泳与微卫星分型
2.6.4 数据分析
3 结果分析
3.1 鞘翅斑纹颜色数字化描述
3.1.1 RGB三色的相关性分析
3.1.2 基于鞘翅斑纹颜色的分型
3.2 光肩星天牛表型性状多样性
3.2.1 光肩星天牛种群间与种群内的形态变异特征
3.2.2 光肩星天牛形态变异来源与群体间的表型分化
3.2.3 表型性状的变异特征
3.2.4 表型性状与地理因子的相关分析
3.2.5 基于表型性状的聚类分析
3.2.6 不同颜色类群的性状差异与分化
3.3 光肩星天牛全基因组微卫星特征
3.4 光肩星天牛微卫星引物筛选
3.5 光肩星天牛地理种群遗传变异
3.5.1 微卫星基因分型
3.5.2 光肩星天牛地理种群遗传多样性分析
3.5.3 光肩星天牛地理种群遗传结构与分化
3.6 光肩星天牛两型遗传变异
3.6.1 光肩星天牛两型种群遗传结构
3.6.2 光肩星天牛两型种群聚类分析
3.6.3 AMOVA分析
4 结论与讨论
4.1 结论
4.2 讨论
4.2.1 光肩星天牛表型性状多样性
4.2.2 光肩星天牛全基因组微卫星特征
4.2.3 引物开发
4.2.4 光肩星天牛遗传多样性及分化
5 创新点与展望
5.1 创新点
5.2 展望
参考文献
个人简介
导师简介
获得成果目录
致谢
本文编号:3870341
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/lylw/3870341.html