基于SSRs的青海云杉无性系遗传多样性及遗传关系的研究

发布时间：2024-02-02 15:01

　　青海云杉(Picea crassifolia Kom.)是松科(Pinaceae)云杉属(Picea)的木本植物,常绿乔木,是青藏高原东北边缘特有的森林树种,也是西北地区重要的造林和城市绿化树种,在祁连山乃至西北地区生态建设中发挥着不可替代的作用。目前国内对青海云杉的种子萌发特性、表型变异、同工酶遗传变异等研究已有文献报道,但是基于SSR标记的青海云杉的研究和应用还鲜有报道。本研究主要包含两部分的内容:(1)青海云杉SSR-PCR反应体系的建立和优化,以及引物的筛选;(2)基于SSRs的青海云杉无性系的遗传多样性和亲缘关系研究。采用正交试验设计和单因素分析方法,建立并优化了青海云杉的SSR-PCR反应体系。结果显示,青海云杉SSR-PCR最适反应体系为总体积为20.0μL,包括模板DNA(5-10 ng·μL-1)1.0μL、dNTP(10 mmol·L-1)0.45μL、正反向引物(10μmol·L-1)0.25μL、Mg2+(25 mmol·L-1)2.0μL、Taq DNA聚合酶(5 U·μL-1)0.8μL、10×PCR缓冲液2.0μL、HPLC超纯水13.25μL。PCR扩增...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-2青海云杉无性系基因组DNA

(260/280)约为1.8，符合进行ISSR-PCR反应的要求，最后将青海云杉的DNA产物放入-20℃冰箱中保存以备用。青海云杉无性系部分基因组DNA电泳图谱如图2-2所示。

图4-2青海云杉SSR-PCR反应体系的琼脂糖凝胶电泳图谱

SSR引物筛选图4-2青海云杉SSR-PCR反应体系的琼脂糖凝胶电泳图谱Fig.4-2ElectrophoreticpatternsofSSR-PCRreactionsystemforQinghaispruce

图4-2青海云杉SSR引物筛选电泳图谱

图4-2为青海云杉无性系编号1-30的EAC1A07引物SSR-PCR扩增电泳结图4-2青海云杉SSR引物筛选电泳图谱Fig.4-2ElectrophoreticpatternsofSSRprimerselectionforQinghai....

图3-3a上图基于SSRs和Dice相似性系数的青海云杉109个无性系聚类图

Dice’sSimilarityCoefficient图3-3a上图基于SSRs和Dice相似性系数的青海云杉109个无性系聚类图Fig.3-3aUpperclusterofUPGMAdendrogramfor109clonesofP.....

本文编号：3892853