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杂交杨R2R3-MYB基因抗锈菌侵染表达

发布时间:2024-03-17 17:31
  杨树广泛分布于北纬3072°间世界各地,因其生长速度快、无性繁殖简便、用途广泛、适应性强、轮伐期短而备受欢迎,为主要用材树种。然而,杨树病虫害多且重,其中杨树叶锈病是分布最广、危害最大的杨树叶部病害之一。而MYB转录因子作为存在于所有植物中的转录因子,对多种植物特殊进程具有重要的调控作用,在植物与病原互作过程中扮演重要角色。为系统研究杨树R2R3-MYB转录因子在生物胁迫反应中的功能,建立关于R2R3-MYB转录因子如何调控具有生物学功能的特异性靶基因表达的调控网络,从本实验室收集的对落叶松-杨栅锈菌E4生理小种感病性存在差异的十余种杨树品种中挑选出感病指数为2级的低感病树种杂交杨作为主要研究对象,感病指数为4级的高感病树种欧美杨为对照树种。以杂交杨、欧美杨转录组测序数据为基础,鉴定得到217个杨树R2R3-MYB基因,其中214个可以对应到毛果杨version 3.0基因组的19条染色体上,另3条定位于scaffold25,scaffold221和scaffold408。转录组测序数据生物信息学分...

【文章页数】:62 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1-1植物MYB转录因子家族分类Fig.1-1PlantMYBtranscriptionfactorclassesR2R3-MYB仅存在于植物中且在植物中分布最为广泛,是植物中最大的MYB转录

图1-1植物MYB转录因子家族分类Fig.1-1PlantMYBtranscriptionfactorclassesR2R3-MYB仅存在于植物中且在植物中分布最为广泛,是植物中最大的MYB转录

东北林业大学硕士学位论文1.2.2MYB转录因子分类转录因子通常根据其所含保守DNA结合域的类型和数量进行分类。根据含有MY结构域的数量可将MYB转录因子分为1R-MYB、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB四类。原型MYB蛋白c-Myb的三....


图2-1R2R3-MYB转录因子家族系统发生树

图2-1R2R3-MYB转录因子家族系统发生树

东北林业大学硕士学位论文进化的单位。在杨树中,所有的MYB转录因子都含有1-4个由大约52个氨基酸残基构成的MYB结构域。为了明确杨树MYB转录因子的分类情况,利用最大似然法,对杂交杨、欧美杨和拟南芥R2R3-MYB蛋白进行系统进化分析。


图2-2杂交杨R2R3-MYB基因的染色体定位Fig.2-2ChromosomaldistributionofPopulusR2R3-MYBgenes另外,有些染色体上分布的MYB基因呈现出集群的现象,比如PdtMYB130、PdtMYB131、PdtMYB132和PdtMYB133成簇地定位在了11号染色体上(图2-2),而

图2-2杂交杨R2R3-MYB基因的染色体定位Fig.2-2ChromosomaldistributionofPopulusR2R3-MYBgenes另外,有些染色体上分布的MYB基因呈现出集群的现象,比如PdtMYB130、PdtMYB131、PdtMYB132和PdtMYB133成簇地定位在了11号染色体上(图2-2),而

2杂交杨R2R3-MYB基因鉴定2.2.3杂交杨R2R3-MYB基因的染色体定位为了解杂交杨R2R3-MYB基因在杨树染色体上的定位情况,MYB基因通过在杨树version3.0基因组上进行比对,发现在217个杂交杨R2R3-MYB基因中,有214....


图2-3锈菌侵染前后杂交杨R2R3-MYBs表达量Fig.2-3ExpressionchangingofPopulus×euramericanaR2R3-MYBsfollowingtheinfectionofM.larici-populina

图2-3锈菌侵染前后杂交杨R2R3-MYBs表达量Fig.2-3ExpressionchangingofPopulus×euramericanaR2R3-MYBsfollowingtheinfectionofM.larici-populina

东北林业大学硕士学位论文后杂交杨与欧美杨R2R3-MYB基因表达量差异分析结果表明MYB基因中仅有3条R2R3-MYB基因表达量差异不显著量显著,207条R2R3-MYB基因表达量差异极显著(表2-2



本文编号:3931385

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