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巴西橡胶树低磷胁迫应答相关E3泛素连接酶互作蛋白的筛选研究

发布时间:2025-01-17 20:19
  蛋白泛素化修饰是一种在真核生物多种生理过程中发挥重要作用的翻译后修饰形式,是靠E3泛素连接酶对关键基因的精确识别来实现其功能的多样性和特异性。研究表明,在植物低磷胁迫应答相关的根系形态建成、磷吸收转运以及激素代谢等过程中蛋白泛素化修饰都发挥了非常重要的调控作用。本研究以橡胶树组培苗为材料构建了地上部地下部均一化酵母双杂交cDNA文库,以前期通过抑制差减杂交(SSH)获得的2个低磷胁迫应答相关的E3泛素连接酶基因HbSIN4T2、HbTIR1构建诱饵载体,并通过酵母双杂交技术分别筛选了互作蛋白。继而克隆获得互作蛋白的cDNA全长,并通过生物信息学对互作蛋白进行了分析,以期探索这些E3泛素连接酶基因在橡胶树低磷胁迫应答中的调控作用。主要的研究成果如下:1.构建了橡胶树地上部均一化cDNA文库,文库滴度8×107cfu/mL,所得文库插入片段≥0.5 kb的重组率为100%;2.构建了橡胶树地下部均一化cDNA文库,文库滴度7×107cfu/mL,所得文库插入片段≥0.5 kb的重组率为87%;3.构建了两个与低磷胁迫应答相关的E3泛素连接酶诱饵载体HbSIN4T2、HbTIR1;4.利用酵母...

【文章页数】:66 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1橡胶树地上部(A)和地下部(B)总RNA??

图1橡胶树地上部(A)和地下部(B)总RNA??

胶树低磷胁迫相关E3泛素连接酶底物的筛3结果与分析??部地下部均一化酵母双杂交cDNA和地下部总RNA的提取??续实验要求的mRNA,总RNA的质CTAB法(淦国英等,2009;郭秀莲等,RNA。然后通过1.2%琼脂糖凝胶电泳rRNA和28SrRNA条带清楚(图丨),RNA没有降....


图2地上部(A)地下部(B)均一化之后(1)和均一化之前(2)的cDINA检测结果??Nker

图2地上部(A)地下部(B)均一化之后(1)和均一化之前(2)的cDINA检测结果??Nker

3.1.3?ds-cDNA的合成及DS_—化效果??以3.0pLmRNA反转录合成第一链,然后经两轮LD-PCR扩增后,电泳检测结??果显示ds-cDNA呈弥散状,片段分布较广,且丰度各异(图2)。由此表明,大小??不一和丰度各异的mRNA都得到了预期的反转录和扩增。??ds-c....


图3地上部(1和2)和地下部(3和4)均一化前后18SrRNA表达丰度变化检测??_

图3地上部(1和2)和地下部(3和4)均一化前后18SrRNA表达丰度变化检测??_

用管家基因18S?rRNA分别对地上部和地下部DSN均一化前以及均一化并过柱纯化??后的cDNA进行扩增检测。经扩增30个循环后,DSN均一化处理后的cDNA中,??18SrRNA基因的表达丰度均明显低于均一化之前(图3)。以上结果表明,均一化??处理有效地降低了高丰度基因,过柱....


图5地下部均一化文库的菌落生长情况??-

图5地下部均一化文库的菌落生长情况??-

3.1.4均一化酵母双杂交文库构建及质量评价??过柱纯化后的ds-cDNA和线性化质粒pGADT7-Rec共转化Y187感受态细胞,??转化后的菌落生长情况如图4和图5所示。经统计和计算,初始文库独立克隆地上??部为2.28xl〇6cfu,地下部为2.04xl〇6cfu,取收集后....



本文编号:4028453

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