添加鸽粪对土壤细菌多样性影响及其驱动因素分析

发布时间：2021-05-15 16:24

　　微生物作为土壤中的主要生命存在形式,在土壤物质循环和能量转换过程中具有重要作用,因此,研究土壤微生物群落结构和多样性变化具有重要意义。解析不同环境因子对土壤微生物群落结构多样性和地理分布特征规律形成和维持机制逐渐成为当前土壤微生物研究的热点之一。为了弄清驱动土壤微生物多样性和生物地理分布特征的影响因素,回答土壤微生物生态学研究中的一些基础性科学问题,本文通过比较基因组学方法研究了 土壤和鸽粪微生物群落结构之间的差异;通过PCR-DGGE和Illumina MiSeq测序技术研究鸽粪添加、土壤类型、淹水环境和土壤基础理化因子对土壤细菌群落结构和多样性变化的影响;通过多元统计分析方法分析了致使土壤微生物群落结构和多样性变化的主控因子。Illumina MiSeq测序和比较基因组学结果表明,土壤中有38个门、86个纲、179个目、342个科、516个属,鸽粪有12个门、31个纲、55个目、101个科和164个属,土壤中微生物种类显著高于鸽粪样品中,香浓指数:土壤>鸽粪,然而鸽粪中的丰度指数却显著高于土壤样品。通过分析发现Proteobacteria、Acidobacteria、Bact... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：101 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
符号与缩略语说明
第一章 文献综述
    1 土壤微生物生物地理分布
    2 土壤微生物多样性及其影响因素
        2.1 土壤微生物多样性
        2.2 土壤微生物影响因素
    3 土壤微生物研究方法
    4 论文研究内容、目的及意义
第二章 三种典型土壤与家鸽粪便微生物多样性比较分析
    1 材料与方法
        1.1 研究区域概况
        1.2 样品采集与保存
        1.3 土壤与粪便微生物平板计数
        1.4 土壤与粪便总DNA的提取纯化
        1.5 细菌Illumina MiSeq测序
        1.6 数据分析
    2 结果与分析
        2.1 土壤与粪便微生物计数
        2.2 土壤与粪便总DNA的提取纯化
        2.3 土壤与鸽粪细菌群落多样性分析
        2.4 土壤与鸽粪细菌群落组成的系统发育分析
        2.5 鸽粪中的病原微生物菌属
    3 讨论
    4 本章小结
第三章 添加鸽粪后土壤细菌多样性的动态演变
    1 材料与方法
        1.1 供试土壤和鸽粪
        1.2 试验设计
        1.3 土壤中可培养细菌计数
        1.4 土壤微生物总DNA提取纯化
        1.5 土壤中细菌16S PCR-DGGE分析
        1.6 数据分析
    2 结果与分析
        2.1 土壤中可培养细菌计数
        2.2 土壤微生物总DNA提取
        2.3 土壤细菌16S PCR-DGGE分析
    3 讨论
    4 本章小结
第四章 典型时段的土壤细菌生物地理分布格局及其驱动因素分析
    1 材料与方法
        1.1 试验设计
        1.2 土壤理化性质测定
        1.3 土壤微生物总DNA提取纯化
        1.4 土壤细菌16S V3V4区Illumina MiSeq测序分析
    2 结果与分析
        2.1 不同时期土壤理化性质分析
        2.2 不同时期土壤细菌群落α多样性分析
        2.3 不同时期土壤细菌群落β多样性分析
        2.4 不同时期土壤细菌群落组成分析
        2.5 驱动土壤细菌群落多样性影响因子分析
    3 讨论
    4 本章小结
全文总结
创新点
参考文献
附录1 文中所用的培养基和试剂配方
附录2 DGGE数据分析
攻读硕士学位期间发表的论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]长期保护性耕作对纤维素降解基因cbh Ⅰ多样性的影响[J]. 陈坤,李传海,朱安宁,彭文涛,钱明媚,曹慧.  土壤学报. 2015(02)
[2]有机肥替代部分化肥对长期连作棉田产量、土壤微生物数量及酶活性的影响[J]. 陶磊,褚贵新,刘涛,唐诚,李俊华,梁永超.  生态学报. 2014(21)
[3]3种典型荒漠灌木内生固氮菌及固氮酶基因nifH多样性分析[J]. 徐正金,罗明,王卫霞,王纯利.  中国沙漠. 2014(02)
[4]第三代测序技术及其应用[J]. 张得芳,马秋月,尹佟明,夏涛.  中国生物工程杂志. 2013(05)
[5]Comparison of bacterial community structures in two systems of a sewage treatment plant using PCR-DGGE analysis[J]. Abd El-Latif Hesham.  Journal of Environmental Sciences. 2011(12)
[6]不同城市绿地类型对土壤微生物数量及微生物量的影响[J]. 蒋炳伸,杨喜田.  湖南农业科学. 2011(17)
[7]家畜粪便堆肥对番茄青枯病、土壤酶活性及土壤微生物功能多样性的影响[J]. 赵娜,林威鹏,蔡昆争,王建武.  生态学报. 2010(19)
[8]土壤微生物生物地理学研究进展[J]. 贺纪正,葛源.  生态学报. 2008(11)
[9]土壤微生物多样性的科学内涵及其生态服务功能[J]. 林先贵,胡君利.  土壤学报. 2008(05)
[10]水分条件对水稻土微生物群落多样性及活性的影响[J]. 刘岳燕,姚槐应,黄昌勇.  土壤学报. 2006(05)

博士论文
[1]典型农药在稻田及周围水环境中对微生物群落的影响研究[D]. 付岩.浙江大学 2015
[2]长期施肥对温室和大田土壤微生物的影响[D]. 王轶.中国农业大学 2014
[3]大豆慢生根瘤菌分子进化学分析及土著大豆根瘤菌生物地理分布的高通量研究[D]. 张星星.中国农业大学 2014
[4]基于磷脂脂肪酸（PLFA）分析技术的土壤微生物群落结构多样性的研究[D]. 吴愉萍.浙江大学 2009

硕士论文
[1]长期耕作对土壤团聚体有机碳及微生物多样性的影响[D]. 李景.中国农业科学院 2014
[2]hLYZ转基因山羊粪便对于土壤微生物群落及基因漂移的影响[D]. 吴洁云.西北农林科技大学 2012
[3]土壤酶活测定及土壤微生物总蛋白的提取、纯化与鉴定[D]. 吴云.南京农业大学 2011



本文编号：3187960