限制性两阶段多位点全基因组关联分析法（RTM-GWAS）的特点、常见提问与应用前景

发布时间：2021-10-01 05:32

　　限制性两阶段多位点全基因组关联分析方法（RTM-GWAS）是新建立的一种可以全面检测自然群体和双（多）亲衍生群体中具有不同复等位变异QTL体系的关联分析方法。本文介绍了提出RTM-GWAS的出发点及其两大主要特点,包括建立适合自然群体和和双（多）亲衍生群体特点的复等位变异标记和控制总体贡献率的多位点关联分析模型。一般读者和编者对RTM-GWAS的方法、原理,对复等位标记和多位点模型并无异议,提问与质疑主要分为两方面:一是RTM-GWAS检测到的QTL数量较多,大大多于单位点MLM模型所检出的QTL数目,怀疑增加的QTL是假阳性所致;另一是采用常规显著水准要求太低,不适于关联分析。本文对此做了严密释疑。最后介绍了关于RTM-GWAS的应用前景,包括遗传体系解析与重要基因克隆,双（多）亲杂交衍生群体遗传解析,群体遗传分化与进化和设计育种等方面。 

【文章来源】：中国农业科学. 2020,53(09)北大核心CSCD

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 提出RTM-GWAS的出发点及其两大主要特点
2 RTM-GWAS方法的常见质疑与辩解
    2.1 关于检测的QTL数量多，怀疑假阳性高的辩解
    2.2 关于所用显著水平不够严格的辩解
3 RTM-GWAS的应用前景
    3.1 遗传体系解析与重要基因克隆
    3.2 双（多）亲杂交衍生群体遗传解析
    3.3 群体遗传分化与进化
    3.4 QTL-allele矩阵应用于设计育种


【参考文献】：
期刊论文
[1]东北大豆种质群体百粒重QTL-等位变异的全基因组解析[J]. 郝晓帅,傅蒙蒙,刘再东,贺建波,王燕平,任海祥,王德亮,杨兴勇,程延喜,杜维广,盖钧镒.  中国农业科学. 2020(09)
[2]RTM-GWAS方法应用于大豆RIL群体百粒重QTL检测的功效[J]. 潘丽媛,贺建波,赵晋铭,王吴彬,邢光南,喻德跃,张小燕,李春燕,陈受宜,盖钧镒.  中国农业科学. 2020(09)
[3]大豆重组自交系群体异黄酮含量QTL连锁定位与关联定位的比较研究[J]. 刘再东,孟珊,贺建波,邢光南,王吴彬,赵团结,盖钧镒.  中国农业科学. 2020(09)
[4]大豆巢式关联作图群体蛋白质含量的遗传解析[J]. 李曙光,曹永策,贺建波,王吴彬,邢光南,杨加银,赵团结,盖钧镒.  中国农业科学. 2020(09)
[5]限制性两阶段多位点全基因组关联分析方法的特点与计算程序[J]. 贺建波,刘方东,邢光南,王吴彬,赵团结,管荣展,盖钧镒.  作物学报. 2018(09)



本文编号：3417253