内蒙古西部地区土壤微生物多样性分析
发布时间：2022-01-04 19:27
微生物多样性研究对微生物资源的开发利用与环境保护具有重要意义。本研究通过PCR-DGGE（PCR-Denaturing Gradinent Gel Electrophoresis）技术对内蒙古西部地区土壤细菌、真菌、放线菌的多样性与群落结构进行了研究。研究结果显示,针对内蒙古西部地区土壤沙粒含量高的特点,将物理、化学与酶法相结合的DNA提取方法可以获得高质量的土壤总DNA。内蒙古西部地区土壤微生物资源非常丰富,优势菌菌种种类相对较多,其中细菌的丰富度是最高的,细菌优势菌群主要包括Proteobacteria（变形菌门）、Bacteroidetes（拟杆菌门）、Firmicutes（厚壁菌门）、Actinobacteria（放线菌门）、Acidobacteria（酸杆菌门）、Gemmatimonadetes（芽单胞菌门）、Nitrospira（硝化螺旋菌门）。放线菌优势菌群包括Saccharopolyspora（糖多孢菌属）Thermomonospora（高温单孢菌属）、Streptomyces（链霉菌属）、Iamiaceae（酸微菌属）、Corynebacterium（棒杆菌属）、Ti...
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 引言
1.1 土壤微生物多样性
1.2 变性梯度凝胶(DGGE)技术
1.2.1 基本原理
1.2.2 DGGE应用
1.3 国内外研究现状
1.4 内蒙古西部地区土壤概况
1.5 本课题研究的目的与意义
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 土壤样品
2.1.2 PCR引物
2.1.3 主要实验试剂
2.1.4 主要仪器与设备
2.1.5 图像处理软件及序列分析软件
2.2 实验方法
2.2.1 土壤总DNA提取
2.2.2 PCR反应条件
2.2.3 DGGE条件
2.2.4 DGGE方法
2.2.5 DGGE切胶回收方法（胶回收用了两种方法）
2.2.6 序列测定及分析
3 结果与分析
3.1 土壤总DNA提取方法的优化
3.2 DGGE图谱重复性检验
3.3 内蒙古西部地区土壤细菌多样性
3.3.1 细菌16S rDNA基因片段的PCR扩增
3.3.2 PCR产物的DGGE分析
3.3.3 内蒙古西部地区土壤细菌多样性分析
3.3.4 内蒙古西部地区土壤细菌16S rDNA系统发育树构建
3.4 内蒙古西部地区土壤真菌多样性
3.4.1 真菌18S rDNA片段的PCR扩增
3.4.2 PCR产物的DGGE分析
3.4.3 内蒙古西部地区土壤真菌多样性分析
3.4.4 内蒙古西部地区土壤真菌18S rDNA系统发育树构建
3.5 内蒙古西部地区土壤放线菌多样性
3.5.1 放线菌16S rDNA片段的PCR扩增
3.5.2 PCR产物的DGGE分析
3.5.3 内蒙古西部地区土壤放线菌多样性分析
3.5.4 内蒙古西部地区土壤放线菌16S rDNA系统发育树构建
4 讨论
4.1 内蒙古西部地区微生物多样性
4.2 不同土壤微生物多样性分析
4.3 相同类型土壤微生物多样性受多种因素影响
4.4 土壤总DNA的提取
4.5 DGGE胶回收
5 结论
致谢
参考文献
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]土壤微生物多样性及其影响因素[J]. 张记霞. 农民致富之友. 2015(24)
[2]肇庆星湖湿地放线菌多样性[J]. 薛冬,赵国振,赵海泉,姚青,朱红惠. 微生物学报. 2015(05)
[3]马铃薯土传病原真菌拮抗放线菌的抗病促生作用[J]. 陈杰,汤琳,郭天文,谭雪莲,魏晓丽,王东胜,何斐,段佳丽,薛泉宏. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2014(01)
[4]传统分离培养结合PCR-DGGE技术分析广式腊肠中优势菌[J]. 谢科,余晓峰,郑海松,宗凯,连英琪,刘国庆. 食品科学. 2013(04)
[5]内蒙古地区土壤水文特征的空间分布[J]. 云文丽,侯琼,李友文,王永利. 干旱区资源与环境. 2013(02)
[6]丛毛单胞菌在环境污染物降解方面的研究进展[J]. 赵燕,薛林贵,李琳,张红光. 微生物学通报. 2012(10)
[7]4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响[J]. 吕新,陈丽华,李玥仁. 福建农业学报. 2012(04)
[8]抗真菌活性粘细菌的筛选及鉴定(英文)[J]. 刘建玲,李宏铎,王军,万一. Plant Diseases and Pests. 2011(03)
[9]中药废水污泥群落结构解析中PCR-DGGE引物的选择与评价[J]. 林海龙,李伟光,闫险峰,任南琪. 环境科学. 2011(05)
[10]土壤解磷微生物及其磷素有效性转化机理研究进展[J]. 盛荣,肖和艾,谭周进,丁龙君,谢达平. 土壤通报. 2010(06)
博士论文
[1]内蒙古西部地区持久性有毒物质的分布特征及生态效应研究[D]. 侯德坤.内蒙古大学 2014
[2]纤维堆囊菌胞内脂类内含物成分、形成及其对埃博霉素生物合成的影响[D]. 钱云开.山东大学 2010
[3]大兴安岭兴安落叶松林土壤微生物与土壤酶活性研究[D]. 姜海燕.内蒙古农业大学 2010
[4]硝化细菌应用技术研究[D]. 张明.华东师范大学 2003
硕士论文
[1]内蒙古荒漠生物土壤结皮及下层土壤微生物多样性和群落结构研究[D]. 张星星.内蒙古农业大学 2015
[2]堆肥过程中硝化细菌和反硝化细菌多样性的分析[D]. 孙瑜.东北农业大学 2014
[3]内蒙古荒漠草原土壤微生物季节动态变化的研究[D]. 李浩.内蒙古师范大学 2008
[4]内蒙古荒漠草原不同退化阶段土壤微生物变化的研究[D]. 吴永胜.内蒙古师范大学 2008
[5]鄂尔多斯沙地土壤微生物和酶活性研究[D]. 张晓美.四川农业大学 2007
[6]内蒙古不同退化程度草原土壤细菌群落多样性研究[D]. 张善利.中国科学院研究生院（大连化学物理研究所） 2007
[7]024放线菌及其所产抗生素的初步研究[D]. 王远宏.河南农业大学 2002
本文编号：3568930
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 引言
1.1 土壤微生物多样性
1.2 变性梯度凝胶(DGGE)技术
1.2.1 基本原理
1.2.2 DGGE应用
1.3 国内外研究现状
1.4 内蒙古西部地区土壤概况
1.5 本课题研究的目的与意义
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 土壤样品
2.1.2 PCR引物
2.1.3 主要实验试剂
2.1.4 主要仪器与设备
2.1.5 图像处理软件及序列分析软件
2.2 实验方法
2.2.1 土壤总DNA提取
2.2.2 PCR反应条件
2.2.3 DGGE条件
2.2.4 DGGE方法
2.2.5 DGGE切胶回收方法（胶回收用了两种方法）
2.2.6 序列测定及分析
3 结果与分析
3.1 土壤总DNA提取方法的优化
3.2 DGGE图谱重复性检验
3.3 内蒙古西部地区土壤细菌多样性
3.3.1 细菌16S rDNA基因片段的PCR扩增
3.3.2 PCR产物的DGGE分析
3.3.3 内蒙古西部地区土壤细菌多样性分析
3.3.4 内蒙古西部地区土壤细菌16S rDNA系统发育树构建
3.4 内蒙古西部地区土壤真菌多样性
3.4.1 真菌18S rDNA片段的PCR扩增
3.4.2 PCR产物的DGGE分析
3.4.3 内蒙古西部地区土壤真菌多样性分析
3.4.4 内蒙古西部地区土壤真菌18S rDNA系统发育树构建
3.5 内蒙古西部地区土壤放线菌多样性
3.5.1 放线菌16S rDNA片段的PCR扩增
3.5.2 PCR产物的DGGE分析
3.5.3 内蒙古西部地区土壤放线菌多样性分析
3.5.4 内蒙古西部地区土壤放线菌16S rDNA系统发育树构建
4 讨论
4.1 内蒙古西部地区微生物多样性
4.2 不同土壤微生物多样性分析
4.3 相同类型土壤微生物多样性受多种因素影响
4.4 土壤总DNA的提取
4.5 DGGE胶回收
5 结论
致谢
参考文献
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]土壤微生物多样性及其影响因素[J]. 张记霞. 农民致富之友. 2015(24)
[2]肇庆星湖湿地放线菌多样性[J]. 薛冬,赵国振,赵海泉,姚青,朱红惠. 微生物学报. 2015(05)
[3]马铃薯土传病原真菌拮抗放线菌的抗病促生作用[J]. 陈杰,汤琳,郭天文,谭雪莲,魏晓丽,王东胜,何斐,段佳丽,薛泉宏. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2014(01)
[4]传统分离培养结合PCR-DGGE技术分析广式腊肠中优势菌[J]. 谢科,余晓峰,郑海松,宗凯,连英琪,刘国庆. 食品科学. 2013(04)
[5]内蒙古地区土壤水文特征的空间分布[J]. 云文丽,侯琼,李友文,王永利. 干旱区资源与环境. 2013(02)
[6]丛毛单胞菌在环境污染物降解方面的研究进展[J]. 赵燕,薛林贵,李琳,张红光. 微生物学通报. 2012(10)
[7]4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响[J]. 吕新,陈丽华,李玥仁. 福建农业学报. 2012(04)
[8]抗真菌活性粘细菌的筛选及鉴定(英文)[J]. 刘建玲,李宏铎,王军,万一. Plant Diseases and Pests. 2011(03)
[9]中药废水污泥群落结构解析中PCR-DGGE引物的选择与评价[J]. 林海龙,李伟光,闫险峰,任南琪. 环境科学. 2011(05)
[10]土壤解磷微生物及其磷素有效性转化机理研究进展[J]. 盛荣,肖和艾,谭周进,丁龙君,谢达平. 土壤通报. 2010(06)
博士论文
[1]内蒙古西部地区持久性有毒物质的分布特征及生态效应研究[D]. 侯德坤.内蒙古大学 2014
[2]纤维堆囊菌胞内脂类内含物成分、形成及其对埃博霉素生物合成的影响[D]. 钱云开.山东大学 2010
[3]大兴安岭兴安落叶松林土壤微生物与土壤酶活性研究[D]. 姜海燕.内蒙古农业大学 2010
[4]硝化细菌应用技术研究[D]. 张明.华东师范大学 2003
硕士论文
[1]内蒙古荒漠生物土壤结皮及下层土壤微生物多样性和群落结构研究[D]. 张星星.内蒙古农业大学 2015
[2]堆肥过程中硝化细菌和反硝化细菌多样性的分析[D]. 孙瑜.东北农业大学 2014
[3]内蒙古荒漠草原土壤微生物季节动态变化的研究[D]. 李浩.内蒙古师范大学 2008
[4]内蒙古荒漠草原不同退化阶段土壤微生物变化的研究[D]. 吴永胜.内蒙古师范大学 2008
[5]鄂尔多斯沙地土壤微生物和酶活性研究[D]. 张晓美.四川农业大学 2007
[6]内蒙古不同退化程度草原土壤细菌群落多样性研究[D]. 张善利.中国科学院研究生院（大连化学物理研究所） 2007
[7]024放线菌及其所产抗生素的初步研究[D]. 王远宏.河南农业大学 2002
本文编号：3568930
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